Do zanieczyszczeń zalicza się kurz i brud na powierzchni ziarna , pozostałości z młócenia ziarna, wszelkie ziarna obce oraz połówki ziaren. Połówki muszą być traktowane jak zanieczyszczenie, gdyż na odsłoniętym bielmie zbiera się więcej brudu, drobnoustrojów i ich zarodników, a ponadto takie ziarno nie będzie kiełkować.
W celu usunięcia zanieczyszczeń ferromagnetycznych ziarna jęczmienia przepuszcza się przez aparat magnetyczny wyposażony w magnes stały lub elektromagnes.
Do czyszczenia ziarna służą:
a) wialnie - za pomocą odpowiednio skierowanego strumienia powietrza oddzielają lekkie zanieczyszczenia, grubsze zaś oddziela się na sitach
b) tryjery - rozdzielają ziarna według długości, na tryjerze oddziela się dłuższe ziarna np. owsa, krótsze okrągłe nasiona (wyka, kąkol,) oraz połówki ziarn.
c) sita - .płaskie lub cylindryczne (separatory) służą do segregowania oczyszczonego jęczmienia według grubości. Sita zaopatrzone są podłużne szczeliny różnej szerokości (wg norm 2.2; 2.5; 2.8 mm)