Biochemia i toksykologia, STUDIA, WIŚ PK, Podstawy Biochemi


Metabolizm=Anabolizm + katabolizm

Anabolizm-przemiany prowadzące do syntezy związków z wykorzystaniem energii wytwarzanej w reakcjach katabolicznych.

Katabolizm - procesy rozkładu związków w trakcie których wydziela się energia.

Podstawowe grupy związków wchodzące w skład komórki: aminokwasy, białka, cukrowce, kwasy nukleinowe

Aminokwasy: mają wysoką temperaturę rozpuszczania, nie mają zapachu, w białku występują tylko w konfiguracji L, są amfoteryczne.

Punkt izoelektryczny-wartość pH przy której aminokwas jest obojętny elektrycznie (jon obojnaczy). Zależy od ilości i rodzaju grup i ich stałych dysocjacji.

Kryteria podziału aminokwasów:

1. Występowanie w przyrodzie: naturalnie, syntetycznie

2. Występowanie w białku: białkowe, niebiałkowe

3. Budowa aminokwasu: z rodnikiem niepolarnym , z polarnym

4. Położenie w łańcuchu białkowym

5. Zdolność organizmu do syntezy aminokwasu: endogenne, egzogenne (niewytwarzane przez organizm) np. walina, leucyna, tryptofan, fenyloalanina, tyrozyna, lizyna, metionina.

PEPTYDY: <10 aminokwasów - digopeptydy, 10-100- polipeptydy, >100-makropeptydy

PODZIAŁ BIAŁEK:

1. Ze względu na kształt cząsteczki: włókienkowe (fiblyralne), sferyczne (globularne)

2. Ze względu na skład: proste, złożone

3. Ze względu na zawartość aminokwasów egzogennych: pełnowartościowe, niepełnowartościowe.

Ogólne właściwości białek:

-wielkość od kilku do ponad 100um

-tworzą roztwory koloidalne, optycznie czynne

-obdarzone ładunkiem elektrycznym (mogą mieć punkt izoelektryczny)

-mogą być oddzielane elektroforetycznie

-nie przenikają przez błony półprzepuszczalne (można stosować dializę)

-wykazują efekt Tandyla (rozpraszają związkę światła)

-niektóre białka można otrzymywać w formie wykrystalizowanej

STRUKTURA:

Struktura - tworzenie cząstek z homo i hetero polimerów. Jest to stopień połaćzenia lub polimeryzacji cząsteczek białka w większe jednostki.

pierwotna -rodzaj i kolejność amino. W łańcucha białkowym,

Wtórna-(ułożenie łańcucha białkowego w przestrzeni) : drugorzędowa, trzecio-, czwarto,

Struktura dwurzędowa - mówi o stopniu zwinięcia i ułożenia się w przestrzeni fragmentów cząsteczek białka. Utrzymują to wiązania wodorowe. Zwinięcia: α-helisa, β-harmonijka

Struktura trzeciorzędowa - utrzymywana jest przez różne typy wiązań: wodorowe, jonowe, estrowe, tioestrowe, dwusiarczkowe, siły van der Waalsa, oddziaływania hydrofobowe

Struktura czwartorzędowa- dotyczy białek zbudowanych z pojedynczych, czyli 2 lub kilku łańcuchów białkowych lub peptydowych.

DENATURACJA BIAŁEK - zniszczenie struktury wtórnej białek

Czynniki powodujące denaturacje:

Fizyczne: wysoka temp., wstrząsanie, rozciąganie

Chemiczne: duże zmiany pH, niektóre związki aromatyczne, detergenty, niektóre rozpuszczalniki organiczne, stężony mocznik, wysoki stężenia metali ciężkich.

Skutki denaturacji:

-spadek rozpuszczalności w pkt. Izoelektrycznym

-utrata własności biogennych

-zwiększenie reaktywności grup chemicznych

-wzrost kąta skręcenia płaszczyzny światła spolaryzowanego

-zwiększenie asymetrii cząstki

-utrata zdolności krystalizacji

Funkcje białek: katalityczne, transportujące i magazynowe, mechaniczno-strukturalne, kurczliwe, ochrona immunologiczna, receptorowe, kontrola wzrostu i różnicowanie komórek

PODZIAŁ BIAŁEK: PROSTE i ZŁÓŻONE: fosfotpoteiny, glikoproteiny, chromoproteiny, lipoproteiny, nukleoproteiny, metaloproteiny. PROSTE: włókienkowe, globularne: polipeptydy, właściwe(histony, albuminy, globuliny, proloaminy, gluteiny, skleroproteiny)

PROSTE:

Skleroproteiny - bardzo odporne na działanie rozpuszczalników i enzymów proteolitycznych Przykłady: białko włosa - keratyna, a także kolagen i elastyna (tkanka łączna) i inne.

Protoaminy - polipeptydy; ze względu na skład aminokwasu mają charakter zasadowy

Histony - białka o ch-rze zasadowym (amino kwasy zasadowe: arginina, lizyna, histydyna)budowa bardziej zróżnicowana; występują gł. w jądrach komórk. wyższych org.; pełnią f. regulacyjną przy przekazywaniu informacji genetycznej.

Albuminy - b. dobrze rozpuszczalne w wodzie i rozcieńczonych r-rach soli; występują gł. W płynach ustrojowych, ziarnach zbóż; zawierają dużą aminokw. egzogennych; obecne są w surowicy krwi (odpowiadają za stałą ilość krwi; pełnią f. transportowe zw. chemicznych (np. kwasy tłuszczowe itp.)

Globuliny-najbardziej powszechne nie roz-puszcz w wodzie niewiele to enzymy rola białek zapasowych(roś.strączkowe),osocze krwi.

Proloaminy-rozpuszczane w r-rach niższych alkoholi alifatycznycz, etanol, większość to białka rośl. ziarna zbóż,prolina-zawdzięczają nazwe

Gluteliny- rozpusz. W słabych r-rach kwas i zasad, nie rozpuszcz.w r-rach soli oboj, duże ilości amin. Kwaśnych: asparaginowy, wchodzą w skład glutenu.

ENZYMY - białka o właściwościach katalitycznych zdolne do swoistej aktywacji substratu. Mogą być białkami prostymi lub złożonymi.

Część niebiałkowa enzymu : - koenzym - łatwo dysocjuje do enzymu i może współpracować i innymi enzymami. - grupa prostetyczna - trwale związana z enzymem. NAD - koenzym który łatwo dysocjuje. Inne katalizatory niebędące enzymami: RYBOZYMY, CYTOCHROMY

MAMY 6 KLAS ENZYMÓW:

1.oksydoreduktazy - katalizują reakcje utleniania i redukcji

2.transferazy - katalizują reakcje przeno-szenia grup pomiędzy różnymi cząstecz-kami

3.hydrolazy - rozbijają wiązania chemiczne w cząsteczkach przy udziale wody

4.liazy - rozszczepiają cząsteczki, ale bez udziału wody

5.izomerazy - katalizują wewnątrzcząsteczkowe przegrupowania atomów lub wiązań między atomami

6.ligazy(syntetazy) - katalizują syntezę i wykorzystują reakcję syntezy przy której dostarczana jest energia pochodząca z rozkładu związków makroergicznych

ENZYMY - jednostki aktywności

Aktywność enzymu- wyraża się ilością substratu który został przez ten enzym przekształcony w jednostce czasu. Jednostka standartowa [J] Aktywność enzymu który jest zdolny do przetworzenia 1mola substratu w ciągu 1 min w warunkach optymalnych w temp. 25oC. 1kat=6*107J lub 1J= on 17 nanokatali

Aktywność właściwa - to aktywność enzymu w przeliczeniu na 1mg białka preparatu enzymatycznego

Aktywność molekularna - to liczba moli substratu przetworzonych przez 1 mol enzymu w war. Optymalnych.

Swoistość grupowa- ważny jest jeden rodzaj wiązania i jeden podstawnik np. lipazy

Swoistość absolutna - enzym działa tylko na 1 substrat np. dehydrogenoza

Stereospecyficzność - enzym działa na jeden tylko stereo izomer, lub w wyniku jego działania powstaje jeden stereo izomer a nie mieszanina równocząsteczkowa dwóch stereo izomerów.

Heterogenność enzymów - występowanie w kilku odmianach różniących się właściwościami fizyko-chemicznymi a nie katalicznymi np. dekydrogenoza mleczanowa.

Proenzymy- enzymy które są wytworzone w komórce nieaktywnej a niewilka zmiana w ich budowie prowadzi do ujawnienia tego białka enzymatycznego np. enzymy proteolityczne

Izoenzymy - enzymy różniące się właściwościami fizyko-chemicznymi a mają tę samą aktywność

Wiązanie substratu do enzymu: model klucza i zamka, model indukowanego dopasowania

WYDAJNOŚĆ REAKCJI ENZYMATYCZNEJ ZALEŻY OD:

1)stężenia enzymu

2)stężenia substratu

3)temperatury

4)pH

5)stężenia soli w środowisku reakcji

6)potencjału oksydoredukcyjnego

7)obecności aktywatorów

8)obecności inhibitorów

AKTYWATORY:

- kofaktory ( jony: Ca, Na, Mg, K, aniony Cl- , drobnocząsteczkowe : koenzymy )

-związki utrzymujące określony potencjał oksydoredukcyjny np. cysteina

-związki powodujące przekształcenie proenzymu w enzym

INHIBITORY:

-nieswoiste( działają nieodwracalnie np. narkotyki ,duże stężenie metali ciężkich)

-swoiste ( drobnocząsteczkowe związki lub jony ale działanie odwracalne ) Wyróżnia się tu: kompetycyjne ( współzawodniczące) i niekompetycyjne (niewspółzawodniczące)

KONTROLA AKTYWNOŚĆI ENZYMATYCZNEJ:

1. Sprzężenie zwrotne

2. Odwracalne modyfikacje kowalencyjne

3.Aktywacja proteolityczna

4. Redukcja szybkości syntezy i degradacji enzymu

Czynniki wpływające na szybkość reakcji enzymatycznej: - obecność inhibitora kompetycyjnego, -obecność inhibitora niekompetycyjnego, Kontrola aktywności enzymatycznej : 1. sprzężenie zwrotne; 2. Odwracalne modyfikacje kowalencyjne (np. przyłączanie i odłączanie reszty fosforanowej) 3. Aktywacja proteolityczna - nieodwracalne hydroliza jednego lub więcej wiązań peptydowych (np. aktywacja proteaz trzustkowych) 4. Regulacja szybkości syntezy i degradacji enzym: -indukcja lub represja genu kodującego enzym; - szybkość degradacji mRNA wytwarzanego przez ten gen WEGLOWODANY -służą do syntezy różnych związków; -zawierają wiele grup hydroksylowych podział: -monosacharydy; -oligosacharydy (-laktoza, -maltoza, -celobioza, -sacharoza) -polisacharydy[ poliuronidy (pektyny, iluzy, guliny) -aminopolisacharydy; polisacharydy właściwe [(homopolisacharydy: -pentozany(arabany -ksylany) -heksozany (glukany -fruktany -mankany -galaktany) ;;lieteropolisacharydy)] monosacharydy: a) ze wzgl. na gr. Funkcyjną: -aldozy -ketozy b) ze wzgl. na liczbę atomów C: 3C triozy, tetrozy, pentozy… Właściwości cukrów prostych: -wszystkie mają własności optyczne -charakter polarny - właściwości redukcyjne (dzięki gr. Funkcyjnym) -wykazują zdolność do mutacji -występują w formie łańcuchowej i cyklicznej -estryfikacja (w komórce kwasem fosforowym) Glukoza: -występuje u roślin i zwierząt -może wyst. W formie wolnej (np. we krwi) -występuje w polisacharydach i monosacharydach Mannoza -polisacharydy roślinne, glikolipidy Galaktoza -występuje w cukrze mlekowym Fruktoza - wyst. w owocach , miodzie -jest najsłodszy z sacharoz Oligosacharydy - 2-6 cząsteczki cukrów prostych -dzielimy na: a)redukujące b) nieredukujące Jeżeli wiązanie tworzy się między grupami funkcyjnymi to taki sacharyd nie ma właściwości redukcyjnych DISACHARYDY: sacharoza: sacharyd nieredukcyjny -dobra rozpuszczalność w sodzie -brak zjawiska mutabotacji laktoza: ulega hydrolizie -fermentacja mlekowa to rozbicie laktozy na cukry proste izomaltoza: -zawiera wiązania glikozydowi typu L-1,6 czyli jest 6-0-L-D-glukopiranozylo-D-glukopiranoza; Źródło: Produkt częściowego trawienia skrobi. Reakcje: -sacharyd redukujący. Tworzy osozony. Ulega fermentacji alkoholowej. Ulega hydrolizie d glukozy POLISACHARYDY skrobia - mieszanina 2 sacharydów: amyloza: amylopektyna, które są zbudowane z L-deglukozy. W przypadku amylozy mamy tylko wiązanie L-1-4-glikozydowe czyli ma strukturę liniową, nie jest rozgałęziony. Amylopektyna ma strukturę rozgałęzioną które to łańcuchy mają wiązania L-1-6 glikozydowe. Glikogen- polisacharyd zbudowany z L-deglukozy. Produkowany w organizmach zwierzęcych oraz w drożdżach. Jest rozgałęziony (L-1-4 i L-1-6 glikozydowe) Proporcje wiązań L-1-4 i L-1-6 są różne niż w skrobiach, L-1-6 jest więcej w stosunku 1:10 (są bardziej rozgałęzione) Celuloza- jest zbudowana z B-deglukozy -inny enometr. Jest nierozgałęziony, struktura jest liniowa, ułożenie łańcuchów nierozgałęzionych równoległych do siebie daje nam specyficzne właściwości m.in. odporność na czynniki chemiczne, mechaniczne Cukry kwaśne; Poliuronidy -polisacharydy, w których reszty cukrowe są przekształcone w kwasy uronowe Do polisacharydów zaliczamy: -pektyny -chemicelulozy -gumy i śluzy roślinne; Wszystkie występują w organizmach roślinnych. Najważniejszą grupą są pektyny których podstawą są kwas galakturonowy. Pektyny sklejają między sobą komórki roślinne (przemiany pektyn: przemiana z form nierozpuszczalnej `protopektyna' w formę rozpuszczalną `pektyny' np. miękczenie owoców Hemicelulozy- w zdrewniałej tkance roślinnej podstawą jest kwas glikuronowy. Oprócz łańcuchu kwasu glukuronowego występują łańcuchy glukanów, łańcuchy zbudowane z pentoz (kselany itd.) Różnią się u roślin iglastych i liściastych. Różnice hemicelulozy związane są ze zmianami łańcuchów Aminopolisacharydy polisacharydy, zawierają aminocukry np. glukozaminel. Przykładem aminosacharydy jest chityna. TŁUSZCZOWCE Lipidy- związki, których wspólną cechą jest nierozpuszczalność w wodzie i występowanie w ich strukturze alkoholu i kwasów tłuszczowych. Nie są rozpuszczalne w wodzie, ale w rozpuszczalnikach organicznych są. Występują w org. roślin: zwierząt. Jest to materiał energetyczny izolacyjny: czasem budulcowy. W org. zwierzęcych odkładane są w tkance tłuszczowej u roślin w pestkach tzw. rośliny oleiste może stanowić 60% nasionka. Podział: ze względu na budowę:1. tłuszcze właściwe 2. Woski 3. Tłuszcze zbożowe Tł. Właściwe są połączeniami alkoholu wodorotlenowego (glicerolu) i kw. tłuszczowych (najczęściej liniowe, mają parzystą liczbę węgli) Im dłuższy łańcuch w kw. Tłuszczowych tym wyższa temp. Topnienia. Im więcej wiązań podwójnych tym niższe temp. Topnienia. Rola tłuszczów: -materiał zapasowy -najbardziej wysokoenergetyczny -tłuszcz okołonarządowy: -warstwa ochronna np. przy oku -funkcja izolacyjna -uelastycznienie powłok Woski: grupa tłuszczowców w prg. Roślinnych i zwierzęcych są to estry alkoholi jest jedno wodorotlenkowy wyższe kwasy tłuszczowe od 16-31 węgli w łańcuchach alkoholu, funkcje: -ochronne np. liści przed parowaniem -strukturalna np. do budowy plastra przez pszczoły Tłuszcze złożone: są najbardziej skomplikowane wspólną ich cechą jest zawartość kwasów tłuszczowych w strukturze. Podział: tłuszcze złożone: -fosfolipidy (-fosfosfingiozydy -fosfoglicerydy :-lecytyny-kefaliny -fosfatydyloseryny -fosfoinozytydy -kwas fosfatydowy) -Glikolipidy (-sulfolipidy -galaktolipidy -gangliozydy) Właściwości fizyczne 1. masa właściwa <1 2. Bezbarwne, bez smaku i zapachu 3. Nielotne 4. Palne 5. Łatwo rozpuszczalne w eterze, chloroformie, benzenie, słabiej w alkoholu 6. Nierozpuszczalne w wodzie, z którą w obecności substancji powierzchniowo czynnych (soli kwasów żółciowych, mydeł) mogą tworzyć emulsję (układ koloidowy) 7. Konsystencja tłuszczów zależy od rodzaju i stosunków ilościowych kwasów tłuszczowych wchodzących w ich skład; tłuszcze stałe zawierają zdecydowanie więcej kwasów nasyconych (głównie tłuszcze zwierzęce) w tłuszczach ciekłych przeważają kwasy nienasycone.



Wyszukiwarka

Podobne podstrony:
Zagad. do Podstaw Bio i toks 2010, STUDIA, WIŚ PK, Wytrzymałość Materiałów
Projekt nr 2, STUDIA, WIŚ PK, Hydrologia i Meterologia
Hydrologia sesja, STUDIA, WIŚ PK, Hydrologia i Meterologia
bud1, STUDIA, WIŚ PK, Mechanika Teoretyczna
WORD XP nauka, STUDIA, WIŚ PK, Technologia Informacyjna
WORD XP nauka2, STUDIA, WIŚ PK, Technologia Informacyjna
Operacje na plikach, STUDIA, WIŚ PK, MatLab
Podstawy budownictwa IS rok2 sem3 Egz KAP, STUDIA, WIL PK, Budownictwo ogólne
11-nkb~1, wisisz, wydzial informatyki, studia zaoczne inzynierskie, podstawy programowania, l2
2-eukl~1, wisisz, wydzial informatyki, studia zaoczne inzynierskie, podstawy programowania, l2
CERAMIKA, Studia, Materiałoznastwo, Metaloznastwo i Podstawy Obrobki Cieplnej, Meteloznastwo
1-algo~1, wisisz, wydzial informatyki, studia zaoczne inzynierskie, podstawy programowania, l2
TPK 05.03 Dydaktyka, Studia - Pedagogika, Teoretyczne Podstawy Kształcenia
c-zadania-w3, wisisz, wydzial informatyki, studia zaoczne inzynierskie, podstawy programowania, kol
odpowiedzi -zarządzanie, Studia - Mechatronika PWR, Podstawy zarządzania - wykład (Teresa Maszczak)
s1, Studia, Materiałoznastwo, Metaloznastwo i Podstawy Obrobki Cieplnej, Meteloznastwo
3. Metody prewencji nieprawidłowego żywienia, Studia - materiały, semestr 7, Podstawy żywienia, Diet
2-eukl~1, wisisz, wydzial informatyki, studia zaoczne inzynierskie, podstawy programowania, l2

więcej podobnych podstron