Cytologia
Dyscyplina samodzielna od XIX w.
Hooke, 1665 - wprowadził termin komórka opisując teksturę korka
Grew - badał komórki roślinne opisując jamki, pęcherzyki otoczone ścianą celulozową
Leeuwenhoek , 1674 - odkrył komórki nieosłonięte błoną, a w nich różne struktury
Teoria komórkowa - Schleiden 1838, Schwann 1839
-Wszystkie istoty żywe budowane są z komórek i ich wytworów
-Każda komórka powstaje i innej komórki przez jej podział
- Wszystkie komórki charakteryzuje podobieństw składu chemicznego i aktywności enzymatycznej
-Organizm jest wynikiem aktywności i współdziałania komórek
Rozwój biologii komórkowej zadecydowały:
-zastosowanie mikroskopu elektronowego techniki badania ugięcia promieni Roentgena
- Współdziałania i zazębienie się nauk biologicznych i innymi dziedzinami wiedzy (genetyka, fizjologia, biochemia)
Komórki- miniaturowe laboratorium
- Metabolizm - suma wszystkich przemian chemicznych jakie zachodzą w komórce
-Katabolizm procesy prowadzące do rozkładu substancji, reakcje egzoergiczne tj , wyzwalające energię.
-Anabolizm procesy, w których syntetyzowane są nowe związki chemiczne, reakcje endoergiczne tj, pochłaniające energie.
Enzymy
- enzymy katalizatory biologiczne przyspieszające reakcje chemiczne zachodzące w komórce. Białka posiadające jedno lub więcej miejsc adsorpcji (grup czynnych) w cząstce, doktorach przyłączony jest substrat.
-Substrat substancja na której działa enzym.
- Produkt efekt przekształcania substratu.
Podział enzymów
W zależności od prowadzącej reakcji
Oksydoreduktazy ( reakcja oksydoredukcyjne)
Transferazy (przenoszenie grup)
Hydrolazy (rekacje hydrolistyczne)
Liazy (dołączanie lub usuwanie grup)
Izomerazy ( Kataliza izomeryzacji)
Ligazy i syntetazy ( kondensacja dwóch cząsteczek przed hydrolizę wiązania fostoranowego)
Aktywność enzymów
Aktywność enzymu zależy od częstości zderzeń między cząsteczkami enzymu i substratu.
Czynniki wpływają cena aktywność enzymu:
pH ( dla każdego enzymu optymalne)
Temperatura ( dla organizmów stałocieplnych optymalna jest norma temperatury ciała >56- inaktywacja)
Względne stężenie enzymu u substratu
W zależności od specyficzności względem substratu:
Absolutna- enzym działa tylko na jeden substrat
Stereochemiczna- działanie zależne od konformacji stereochemicznej substratu
Względne enzym oddziałuje z wieloma związkami danego typu
Komórka
Prokaryota Eukarota (pozostałe)
1. Bakterie
2. Sinice
Żywe organelle
1. CYTOPLAZMA 1. Cytoplazma
2. Robosomy 2. Rybosomy
3. Membrany fotosentyzujące 3. Plastydy ( obecne lub nie)
( organizmy auto czy heterotroficzne) 4. Mitochondria
4. Mezosomy 5. Retikulum endoplazma tyczne
6. Struktury Golgiego
7. Lizosomy, sfero somy
8. Wici,rzęski obecnelubnie
9. Jądro komórkowe
Komórka
Martwe organelle
1. Substancje zapasowe ,sok wakuolarny
2. Wydzieliny
3. Wydaliny
Komórka
Różnice między komórka roślinną i zwierzęcą
Komórka roślinna
Komórka zwierzęca
1. Ścianka komórkowa
Błona komórkowa, Zawisty ściany
2. Plastydy
2. lizosomy
3. Większe wakuole
4. Sfero somy
Komórka prokariotyczna
(Wirusy, bakterie, sinice)
Brak błony jądrowej
Substancja jądrowa zmieszana zresztą cytoplazmy lub zostaje z nią w bezpośrednim kontakcie
Komórka otoczona ścianą komórkową, zawierającą cząsteczki białka, polisacharydów, lipidów
Błona komórkowa ( struktura lipopreteinowa)
Cytoplazma
Rybosomy (RNA + białka: miejsce syntezy białek) Membrany fotosyntetyzujące
Nukleoid- obszar nie oddzieloną błoną jądrową, w których obecny jest chromosom bakteryjny w postaci pojedynczych cząsteczek kwasu dezoksyrybonukleinowego
Kształt komórki
Zmienny- ameby, leukocyty
Typowy wielościany mniej lub bardziej ustalony
Specyficzny - plemniki, rzęski , erytrocyty komórki nabłonkowe, komórki nerwowe itd.
Kształt komórki zależy od:
Adaptacji czynnościowej komórek
Napięcia powierzchniowego
Lepkości protoplazmy
Mechanicznego oddziaływania sąsiednich komórek
Stopnia sztywności błony komórkowej
Wielkość komórek
Wielkość kilka µm
Najmniejsze ok. 4µm
Jaja ptaków- kilka, kilkadziesiąt cm
Jądro komórkowe
Brown 1831 (pręciki trzykrostki)
Występuje w komórkach grzybów, roślin i zwierząt. Wielkości i ilości jąder w komórce jest cechą gatunkową
Erytrocydy ssaków oraz dojrzale człony rurek sitowych nie posiadają jąder ( komórki bezjądrzaste)
Struktura jądra komórkowego
Otoczka- podwójna błona ( wewnętrzna gładka, zewnętrzna przechodzi w błony RE granularnego) poprzecinana porami
Kariolimfa (sok jądrowy)- koloid białkowy ,płynne środowisko. w których zanużone są: chromatynai jąderko
Chromatyna - interfaza postać materiału genetycznego
Chromo centry czyli gatunki chromatydy
Chromo nemy czyli nici chromatydy
Fibryle chromatynowe= chromo centry+ chromo nemy
Jąderko- jedno lub kilka, nieobłonone, zawiera RNA i białka (polimeraza RNA)
Budowa fibryli
DNA- ilość stała dla gatunku
Histony- zasadowe białka proste ( arginina, lizyna)
Białka niehistonowe - cząsteczki o różnym odczynie pH, rola regulatorowa i stabilizująca w chromosomach
RNA( z wyjątkiem RNA organelli autonomicznych)
Stadia rozwojowe ściany komórkowej:
Blaszka środkowa-pektyny
Ściana pierwotna
a)Składniki konstrukcji- polisacharydy lub ich pochodne tworzące mikrofibryle
-u roślin - celuloza
-grzybów z wyjątkiem glonowców- chityna
- u bakterii i sinic-kwasy: pimelinowy i muraminowy
b) składniki podłoża wypełnione konstrukcja, matrix
- pektyny
-hemicelulozy
-białka
Ściana wtórna powstaje powstaję prze chemiczne i fizyczne zmiany ścian pierwotnych
Sposoby zmiany ściany pierwotnej
Inkrustacja- odkładanie się związków chemicznych wewnątrz istniejącej ściany. Między elementy szkieletowe
- lignina (drzewnik)-proces drewnienia ( lignifikacja)
-węglan wapnia, krzemionka-mineralizacja
2. Adkrustacja- odkładanie związków na zewnętrzną powierzchnie ściany pierwotnej
A) polisacharydy
-Śluz
-Dumy
B) tłuszczowce
-Kutyna- proces kutynizacja
-Suberyna proces suberynizacja
-Sporopolenina- proces sporopolenizacja
Budowa błony komórkowej
Lipidy
Fosfolipidy-cząsteczki mają charakter amfipatyczny ( jeden koniec rozpuszcza się w wodzie drugi w tłuszczach)
Sterole- u zwierząt cholesterol
Glikolipidy- zawierają polarne grupy węglowodanowe
Sfingolipidy- zamiast glicerolu sfingozyna
Cerebrozydy- zawierają zarówno węglowodany jak i sfingozynę
Białka- klasyfikacja oparta na stopień zawiązania z lipidami
A) Białka integralne- trudno usuwalne z błony, zawierają część hydrofilową hydrofobową często wystaje z błony
B) białka powierzchniowe usuwane z błony
-hydrofilowe ( liofobowe) zbudowane głównie a aminokwasów kwaśnych np. kwas glutaminowy
- hydrofobowe (lipofilne) aminokwasy, których łańcuchy boczne mogą tworzyć nietrwałe wiązania z łańcuchami węglowodorowymi kwasów tłuszczowych
Struktura błony komórkowej
Półpłynny, podwójny zrąb utworzony przez dwie warstwy lipidów
Główki- hydrofilowe, na zewnątrz
Ogonki- hydrofobowe, do wnętrza
Mozaikowo rozmieszczone w zrębie i na powierzchni białka
Cytoplazma
Cytoplazma - półpłynna, galaretowata substancja o niejednolitej strukturze
Faza rozpraszająca - woda 60-90%
Faza rozproszona
- białko 50%
- tłuszcze 12-25%
- węglowodany 15-20%
- nukleoproteidy 5%
- aminokwasy
- sole mineralne: Ca, Mg, K, Na, P itp.
- mikrotubule, mikrofilamenty
Mikrotubule (mikrorureczki)- Sr 25 µm - luźno rozmieszczone w cytoplazmie, odpowiadają za przemieszczenia i ruch cytoplazmy, wchodzą w skład wrzeciona kariokinetycznego, rzęsek, wici, centrioli
Mikrofilamenty (mikrowłokienka)
O śr 10-12 µm, keratynowe w nabłonkach pełnią funkcję podporową
O śr 4-8 µm, odpowiedzialne za ruchy i zmianę kształtu komórek, we włóknach mięśniowych aktynowe i miozynowe, w innych komórkach aktynowe
Mitochondrium
Morfologia mitochondriów różni się w zależności od rodzaju komórki, ale jest mniej więcej stała w komórkach podobnego typu
Kształt - zasadniczo podłużny lub kulisty czasami pałeczka lub pęcherzyk
Wielkość - zmienna, szerokość stosunkowo stała ok. 0,5m, długość największa 7 m - zależna od stanu fizjologicznego komórki, ciśnienia i pH
Rozmieszczenie- w obrębie cytoplazmy równomierne chociaż mogą się skupiać wokół jądra lub w cytoplazmie obwodowej ( patologia)
Liczebność- waha się w zależności od typu komórki i jej stanu czynnościowego
Budowa mitochondrium
Błona zewnętrzna - gładka
Błona wewnętrzna - tworzy poprzeczne wpuklenia - grzebienie mitochondrium
Płytkowate - mitochondria grzebieniaste
Rurkowate - mitochondria rurkowate
Przestrzeń pery mitochondrialna - strefa między błonami
Matrix mitochondrialna - koloid w skład, którego wchodzą enzymy cyklu Krebsa, β-oksydacji
Genofor mitochondrialny - mitDNA
Rybosomy
Aparaty Golgiego
Aparaty Golgiego (1881) - zespół pęcherzyków, ułożonych jeden na drugim, otoczonych błoną białkowo- lipidową
Spłaszczone cysterny
Zgrupowania gęstych pęcherzyków ściśle związanych z cysternami
Duże jasne wakuole na brzegach układu
Czasem elementy pęcherzykowe połączone z RE
U bezkręgowców i glonów pojedynczy dictiosom ( spłaszczony pęcherzyk). U wyższych organizmów - 4-8 spłaszczonych woreczków ułożonych w stos, wokół pęcherzyki i kanaliki
Lokalizacja, wielkość aparatu Golgiego - różne w zależności o typu komórek i stanu fizjologicznego komórki
Wodniczka
Przestrzeń ograniczona tonoplastem i wypełniona sokiem wakuolarnym, martwy składnik komórki ( błona wodniczki zaliczana do protoplastu)
Składniki wodniczki
Nieorganiczne
- woda 90%
- K, Na, Ca, Mg, Zn, Cl, SO, PO i inne
- związki wytrącone z roztworu ( rafidy i druzy )
Organiczne
-aminokwasy, białka, rozpuszczalne kwasy organiczne
- cukry rzadko tłuszcze
- metabolity wtórne
a) glikozydy (antocyjany, flawony)
b) alkaloidy (nikotyna, chinina, morfina, strychnina, kofeina, kokaina, skopolamina
c) garbniki - pochodne cukrów i polifenoli
Retikulum endoplazma tyczne
Zespół tuneli kanalików połączonych ze sobą, ograniczonych błoną lipidowo - białkową
Podział:
Szorstkie
Gładkie
Plastydy, chromo-, chloro-, leukoplasty, chromatofory
Chloroplasty
Kształt, wielkość i rozmieszczenie różne w zależności od komórki i gatunku rośliny, stosunkowo stałe w obrębie danej tkanki
- maczugowaty
- kulisty
- jajowaty
- dyskowaty
b) liczba - u poszczególnych gatunków stosunkowo stała 20-40 w komórkach roślin wyższych
c) rozmiary - wielkość stała dla danego typu komórek, różnice rozmiarów uwarunkowane są płcią i podłożem genetycznym
- chloroplasty komórek poliploidalnych są większe niż komórek diploidalnych
- większe u roślin, które wyrosły w miejscach zacienionych niż u roślin z miejsc nasłonecznionych
d) rozmieszczenie w komórce
- równomiernie w cytoplazmie
- grupują się w pobliżu jądra lub ścian komórkowych
e) gęstość - większa niż gęstość cytoplazmy
Skład chemiczny
Białka ( 30-55% suchej masy)
Lipidy (20-30%- sterole, woski, fosfatydy, tłuszcze właściwe)
Cukrowce ( zmienny % suchej masy)
Chlorofil ( 9% w tym chlorofil a i b)
Karotenoidy (4.5%)
Kwasy nukleinowe (RNA 2-3% i DNA 0.01-0.02%)
Budowa chloroplastu
Podwójna błona lipoproteinowa
- zewnętrzna gładka
- wewnętrzna - system równoległych wpukleń
Tylakoidy - spłaszczone woreczki poukładane w grana ( grana struktury cylindryczne powstałe przez ułożenie jednej na drugiej cystern o podwójnych błonach - tylakoidów połączonych systemem lamelli)
Stroma - koloid, macierz, w niej zanurzone są grana i łączące je błony integralne
Rybosomy
Robinson, 1953 ( komórka korzenia fasoli, komórki zwierzęce)
Każdy zbudowany z dwóch podjednostek- większej i mniejszej
Skład chemiczny:
Rybosomy RNA
Białka zasadowe - strukturalne
Białka kwaśne - enzymatyczne