1. Przedstaw na poziomie molekularnym działanie enterotoksyny ciepłostałej (ST) wytwarzanej przez szczepy Escherichia coli (ETEC).

Wiąże się z cyklazą guanylową, zaburzenia transportu jonów, wzrost wydzielania Cl, spadek wchłaniania Na i K, płyny konieczne do utrzymania izotoniczności, biegunka sekrecyjna

2. Przedstaw schemat replikacji wirusa C wzw (HCV).

1. a. ss(+)RNA wirusa → białka wirusa

2. b. ss(+)RNA → ss(-)RNA [forma pośrednia]

3. c. ss(-)RNA → ss(+)RNA

4. d. białka z pkt. a i RNA z pkt. c dają gotowy wirion

3. Scharakteryzuj syntetycznie fizjologiczną mikroflorę żołądka człowieka (podaj przynajmniej jeden dominujący gatunek).

Siężenie 10^3, większość zabijana przez kwaśne środowisko czyli stosunkowo małe
flora fizjologiczna: Enterococcus spp. Staphylococcus spp. Lactobacillus spp. Streptococcus spp.

Przykłady patogenów które przeżywają kontakt z niskim pH żołądka: mycobacterium tuberculosos, Helicobacter pylori

Bezkwaśność predysponuje do zap żołądka

4. Przedstaw wysoko patogenny wirus grypy ptasiej, jego docelowe receptory i łańcuch transmisji.

Chyba bez przesady

5. Wymień przynajmniej dwa gatunki bezwzględnych beztlenowców i związane z nimi jednostki chorobowe.

Clostridium (ścisły) 0,5-1% tlenu toksyczne

difficile - biegunka poantybiotykowa, rzekomobłoniaste zapalenie jelit.

Clostridium perfringens - zgorzel gazowa

Bacteroides (umiarkowany) 4%

Fragilis- zakażenia jemy brzusznej, posocznica

6. Wyjaśnij istotę zjawiska transdukcji ogólnej.

Transdukcja uogólniona jest wynikiem pomyłki w łączeniu się główek faga napełnianych DNA. Zamiast

zlepiania się wokół materiału genetycznego faga gromadzą się wokół fragmentu chromosomu bakterii lub

plazmidu. Po włączeniu dostatecznej ilości DNA do główki faga wirusowa endonukleaza przecina DNA,

umożliwiając ostateczne skompletowanie cząstek faga zawierających DNA. Powstały fag jest określany

jako uogólniona cząstka trandukująca.

Czesc chromosomu bakterii trafia razem z DNA wirusa do główki bakteriofaga litycznego i „na gape” trafia do innych komórek bakteryjnych. Nastepuje bezwładne przenoszenie genów kom. Bakteryjnej

7. Scharakteryzuj szczepionkę BCG i określ pierwszy termin obowiązkowego szczepienia BCG.

Szczepionki zawierajace żywe, atenuowane [awirulentne, pozbawione zjadliwosci] patogeny. Szczepionke BCG otrzymano droga pasażowania aż 231 razy pratka Mycobacterium bovis na podłożu z żółcia. 24h po urodzeniu.

8. Przedstaw krótko możliwości zastosowań bakteriofagów w praktyce medycznej (podaj przynajmniej dwa przykłady).

• Diagnostyka - typowanie bakterii przy użyciu fagów - np. w przypadku Salmonella i Staphylococcus aureus

• Terapia cieżkich, przewlekłych infekcji bakteryjnych, gdy zawodzi terapia antybiotykowa - np. w

oparzeniach skóry

9. Scharakteryzuj patogeny kategorii A broni biologicznej i podaj przynajmniej dwa przykłady.

1. kategoria A - patogenny o wysokiej zakaźności i powodujace bardzo wysoka smiertelnosc, np.

• Bacillus antracis

• Yersinia pestis

• Francisiella tularensis

• wirusy goraczek krwotocznych

2. kategoria B - umiarkowana smiertelnosc i umiarkowana rozsiewalnosc,

Brucella,Salmonella, Chlamydia psittaci i Coxiella burnetti, wirusy przenoszone przez komary, np. wirus

zapalenia mózgu

10. Podaj przynajmniej jeden przykład produktu patogenu bakteryjnego spełniającego funkcję superantygenu w organizmie gospodarza i określ konsekwencje tego działania.

Egzotoksyny pirogenne - reagują zarówno z cząsteczkami MHC-II na makrofagach, jak i swoistymi typami

zmiennych regionów łańcucha B receptorów limfocytów T. Reakcja ta nie jest antygenowo swoista dlatego

antygeny te są często przedstawiane jako superantygeny. Następuje wydzielanie przez makrofagi Il-1 Il-6 TNF-alfa prowadzące do ogólnoustrojowej odpowiedzi zapalnej - zapaść sercowo-naczyniowa i smieć

11. Wymień przynajmniej trzy najczęstsze wirusowe czynniki etiologiczne zapaleń górnych dróg oddechowych.

• adenowirusy,

• rhinowirusy,

• Influenza virus A, B,

• Parainfluenza virus typ 1-4

12. Scharakteryzuj wrażliwość HIV na czynniki fizykochemiczne.

1.HIV jest wrażliwy na działanie podwyższonej temperatury i ulega inaktywacji w 56°C, a wiec w

gorącej wodzie.

2. wrażliiwy na srodki odkażajace, takie jak

• zwiazki chloru,

• formalina,

• aldehyd glutarowy,

• lizol

• alkohol etylowy.

3. Powszechnie stosowane czynniki sterylizujace, takie jak:

• Para wodna w nadcisnieniu,

• suche gorace powietrze

• metoda gazowa z użyciem tlenku etylu

13. Co to są formy kokoidalne bakterii, podaj jeden przykład.

• nieprawdziwe, nietypowe - stanowia pewien odpowiednik formy egzosporalnej [nie sa to typowe

przetrwalniki]

• sa to przemijajace formy komórek, stabilne przez około 30 dni, odporne na warunki

srodowiskowe fizyczne i chemiczne

• gina w temp. 80°C po 10 min.

• powstaja w warunkach „stresowych” dla bakterii (np. pełny dostep tlenu w wypadku bakterii

aerofobnych, braku substancji od<ywczych)

• tworza formy ziarenkowate (kokoidalne) z rzeskami lub bez

• należa do bakterii spiralnych, posiadaja lofotrychalnie rozmieszczone 4 do 6 rzesek

• owe formy tworza nastepujace bakterie: Epsilon-Proteobacteria (e-Proteobacteria),

Campylobacteriaceae (C. jejuni*), Helicobacteriaceae (H.pylori**)

14. Przedstaw jedynie podstawowe metody w diagnostyce wirusologicznej.

a. metody immunoenzymatyczne EIA ELISA (np. RSV, HSV, CMV, influenzavirus)
b. aglutynacja lateksowa (np. Rotawirusy)
c. Hybrydyzacja In situ (np. CMV, HPV)
d. testy serologiczne (np. EBV)

e. PCR

15. Przedstaw tzw. postulaty Kocha.

Warunkiem uznania drobnoustroju za czynnik zakaźny jest:

• 1. jego występowanie we wszystkich przypadkach danej choroby, wg tej zasady określoną chorobę wywołuje określony czynnik etiologiczny (określony drobnoustrój)

• 2. wyizolowany z tkanek zmienionych chorobowo drobnoustrój winien być uzyskany in vitro w postaci czystej hodowli

• 3. Możliwość spowodowania u zwierzaka tej samej choroby (z tymi samymi objawami), czy tej samej patologii, jaka występowała w organizmie człowieka, w sytuacji, gdy ów wyhodowany szczep podamy wrażliwemu/podatnemu zwierzęciu

• 4. Musi istnieć możliwość ponownego wyizolowania (od zwierzaka) i wyhodowania tego drobnoustroju in vitro w postaci czystej i on winien być identyczny z tym wyizolowanym wcześniej od człowieka
  
  - chyba KAŻDY SOBIE PORADZI Z TYM PYT.

16. Priony patologiczne to białkowe cząstki zakaźne. Syntetycznie wyjaśnij strategię zakażania przez priony patologiczne.

• Fizjologiczne białko PrPC (C -cellular) posiada 3 α-helisy i 2 β-nici, jest rozpuszczalne w wodzie i denaturujących detergentach, natomiast patogenne PrPSC (SC - scrapie) zawiera przewagę struktury β-kartki, a ponadto jest nierozpuszczalne w wodzie

• Białko PrPSc wpływa na cząsteczki białka PrPC, zmieniając ich konformację i zaburzając procesy, w których priony fizjologicznie biorą udział.

zjedzenie zakażonego mięsa → przedostanie się wraz z krwią do mózgu białek PrPSC → białka PrPSC wymuszają zmianę konformacji przestrzennej białek PrPC → chora komórka po pewnym czasie zostaje rozerwana, a PrPSC uwolnione → następuje zakażanie kolejnych komórek, aż do śmierci człowieka.

17. Wymień kryteria podejrzenia biegunki poantybiotykowej (AAD) i jej czynnik etiologiczny.

a. oddanie 5. wodnisto-śluzowych stolców w ciagu 36 godzin
b. wystapienie ich podczas terapii antybiotykowej albo w ciągu 8 tyg. Od jej zakończenia
c. obecność toksykotwórczego C. difficile lub toksyny w kale
d. wykluczenie innych przyczyn biegunki

18. Przedstaw schemat replikacji HIV.

• Wirus namnaża sie w ustroju w ilosci 1-10 mld kopii na dobe

adsorpcja - GP-120 łaczy sie z CD4 (wirus łaczy sie z komórka poprzez receptor CD4).

• Wymagane do tego sa koreceptory CXCR4 oraz receptory dla chemokin CCR5. Gdy monocyt

lub makrofag nie posiada CCR5 nie ulega sie zakażeniu

• penetracja wirusa odbywa sie w wyniku fuzji otoczki z błona komórkowa

• po penetracji i odpłaszczeniu odwrotna transkryptaza przepisuje RNA do dsDNA, które to DNA

dzieki integrynie łaczy sie genomem gospodarza. Może tam pozostawac, badz namnażac sie

• a. ss(+)RNA → [odwrotna transkryptaza] → dsDNA [tzw. cDNA] (odwrotna transkrypcja)

• b. dsDNA → [polimeraza RNA] → ss(+)RNA

• c. ss(+)RNA [tu jako mRNA] → białko

• d. białka z pkt. c i RNA z pkt. b dają gotowy wirion

19. Przedstaw na poziomie molekularnym działanie toksyny cholery.

toksyna cholery składa sie z jednej podjednostki A otoczonej przez 5 podjednostek B

wzór: AB5.

Podjednostka B łacza sie z receptorem GM1 na enterocytach, a podjed. A powoduje aktywacje cyklazy adenylowej (wzrost cAMP), co daje aktywacje pompy jonowej i w efekcie obfita biegunke sekrecyjna (utrata Na, Cl, K, weglanów) w 10 godz. od zadziałania toksyny;

mechanizm blokowania polega na przeniesieniu ADP z NAD na podjednostke białka Gs, hamujac jego zdolnosc do hydrolizy GTP → GDP (co warunkuje jego „wyłaczenie”), przez to białko Gs jest zablokowane w formie aktywnej, pobudzajacej cyklaze do produkcji cAMP

20. Wymień dwa podstawowe mechanizmy odpowiedzialne za efekt przeciwwirusowy interferonu indukowany w komórkach.

Mech. działania: poprzez kinazy tyrozyny Jak1 i Jak2, transdukcja sygnału z receptora

interferonu prowadzi do aktywacji w jadrze komórkowym ISRE

I sposób działania: aktywacja 2'5'-oligoadenylowej syntetazy - stymulacja endonukleaz (np. rybozylazy)-degradacja DNA i RNA

II sposób: aktywacja kinazy proteinowej-fosforylacja czynnika elongacji EF-3,

zablokowanie transfomacji wirusowej poprzez zahamowanie translacji białekwirusowych i komórkowych jednoczesnie

Obie reakcje wzbudzaja stan przeciw wirusowy komórki.

21. Co to są synbiotyki i jakie jest ich zastosowanie.

probiotyki - żywe mikroorganizmy, które podawane doustnie w odpowiednich ilościach, obdarzają gospodarza korzyściami zdrowotnymi
prebiotyki - nietrawione składniki pokarmowe, które korzystnie wpływają na gospodarza poprzez selektywną stymulację wzrostu i/lub aktywności jednego lub określonej liczby mikroorganizmów w jelitach. Są to substancje blokujące adhezyjny patogennych bakterii zapobiegające przez to kolonizacji przez nie jelita.
synbiotyki - mieszaniny probiotyków i prebiotyków

zastosowanie: korzystnie wpływające na zdrowie człowieka poprzez poprawę przeżywalności i kolonizacji żywych mikroorganizmów w przewodzie pokarmowym, osiągniętą na drodze selektywnej stymulacji ich wzrostu i aktywności

22. Naturalnie oporne na działanie wszystkich cefalosporyn są następujące rodzaje bakterii (wymień przynajmniej trzy rodzaje):

Mycoplasma, Ureoplasma, Chlamydia, Enterococcus (wg wykładu niby tez)

23. Wyjaśnij mechanizm działania fluorochinolonów.

bakteriobójcze,

inhibitory gyrazy DNA (bakteryjnej topoizomerazy 2 i 4).

Zablokowanie aktywności gyrazy prowadzi do gromadzenia nadmiaru skrętów dodatnich i blokowaniu replikacji DNA (normalnie gyraza wprowadza ujemne skręty, rekompensując w ten sposób dodatnie - jest to niezbędne doprawidłowego funkcjonowania komórki).

24. Przedstaw syntetycznie (w punktach) diagnostykę mikrobiologiczną płynu mózgowo-rdzeniowego.

Materiałem pobieranym w zakażeniach OUN (zapalenia opon mózgowo-rdzeniowych, zapalenia mózgu) jest

płyn mózgowo-rdzeniowy pobierany przez nakłucia lędźwiowe w warunkach aseptycznych:

- co najmniej 1 ml płynu posiany jałową igłą bezpośrednio do podłoża hodowlanego (Meningomedium,

podłoże do posiewu krwi, a w infekcjach grzybiczych podłoże Sabourauda) ogrzanego do 37°C.

Pobraną próbkę należy jak najszybciej przetransportować do laboratorium w warunkach zabezpieczających

utrzymanie temperatury podłoża

około 2 ml płynu pobrać do jałowej probówki lub pojemnika w celu wykonania preparatu bezpośredniego i

szybkich testów w kierunku Haemophilus influenzae, Neisseria meningitidis, Streptococcus pneumoniae i

grzybów.

Infekcje OUN mogą przebiegać z bakteremią, dlatego do badania bakteriologicznego należy równolegle z

płynem mózgowo-rdzeniowym pobrać krew.

25. VRE oznacza:

Vankomicin resistant enterococcus

26. Scharakteryzuj syntetycznie fizjologiczną mikroflorę skóry człowieka (podaj przynajmniej dwa dominujące gatunki).

Skóra zawiera 104-105 CFU/ cm2 (CFU = jednostka tworząca kolonię). Szczególnie skolonizowane są

miejsca wilgotne, takie jak pachy, pachwiny czy okolice odbytu. S. epidermidis, S. aureus, Propionibacterium acnes

Więcej na dolnej połowie ciała.

27. Scharakteryzuj szczepionki podjednostkowe starej generacji, podaj przykład.

Zawierają składniki kilku patogenów? Di PerTe? Nie wiem

28. Drobnoustroje z rodzajów Chlamydia i Chlamydophila obecnie zaliczane są do bakterii. Jednak posiadają także cechy wirusów, którymi są (wymień przynajmniej dwie cechy):

• Niewielkie rozmiary rzędu 0,2-1,3 μm,

• Nie produkują własnego ATP

• wyłącznie wewnątrzkomórkowy cykl rozwojowy, bezwzględny pasożyt wewnątrzkomórkowy

• nie zawierają peptudoglikanu

29. Syntetycznie scharakteryzuj zjawisko kolonizacji bakteryjnej, podaj przykłady.

Flora fizjologiczna to głównie bakterie (1014), w mniejszym stopniu grzyby i pierwotniaki. Pochodzą one

ze środowiska, od matki (drogi rodne, jama nosowo - gardłowa, skóra), od personelu szpitalnego. Na naturalną florę wpływają: wiek, zmiana miejsca pobytu, choroby, preparaty antybakteryjne (antybiotyki, kosmetyki,mydła). Flora fizjologiczna jest bardzo nierównomiernie rozmieszczona w obrębie organizmu:

�� Do miejsc wyjątkowo bogato skolonizowanych należą: skóra, błony śluzowe górnych dróg oddechowych,

górny i dolny odcinek przewodu pokarmowego (jama ustna, jelito grube), pochwa, ucho zewnętrzne.

�� Skąpo skolonizowane są: krtań, tchawica, oskrzela, zatoki boczne nosa, przełyk, żołądek, początek jelita

cienkiego, cewka moczowa, szyjka macicy, spojówka, ucho środkowe.

�� Fizjologicznie skolonizowane nie są: oskrzeliki, pęcherzyki płucne, jama opłucnej, układ krwionośny, układ kostno - stawowy, układ nerwowy, mięśnie, narządy wewnętrzne.

Górne drogi oddechowe skolonizowane są przez: Moraxella catarrhalis, S. pneumoniae, H. influenzae, które

mogą być potencjalnie chorobotwórcze.

30. Scharakteryzuj fazę penetracji wirusów człowieka do komórki, podaj przykłady.

II. Faza penetracji - czyli wnikanie do wnetrza komórki

• wirusy bezosłonkowe - wnikaja do komórki przez receptor, nukleokapsyd „wslizguje sie”

HAV?

• wirusy osłonkowe - na dwa sposoby:

a. przez proces fuzji osłonki wirusa z błona cytoplazmatyczna komórki, za posrednictwem receptorów dochodzi do wnikniecia np. HIV

b. endocytoza - np. wirus grypy, różyczki - tworzy sie pecherzyk endocytarny [wewnatrz

proces „fuzji wewnetrznej” - fuzja osłonki z pecherzykiem co okreslamy mianem wiropeksji]

31. Przedstaw schemat replikacji wirusa B wzw (HBV).

Patrz pyt 2

32. Omów zjawisko skoku antygenowego na przykładzie wirusa grypy.

(tzw. Shift zjawisko tyczące się wirusa grypy typ A polegające na reasortacji ośmiu segmentów kwasu nukleinowego z których składa się genom wirusowy prowadzący do gwałtownej zmiany antygenowości wypustek otoczki lipidowej wirusa i potencjalnego nagłego wzrostu wirulencji

33. Syntetycznie scharakteryzuj różnice między efektem działania szczepionek atenuowanych i inaktywowanych.

Atenuowane

• żywe drobnoustroje

• możliwosc odtworzenia wirulentnego genotypu - a wiec rewersja do wirulencji.

• najskuteczniejsze szczepionki - indukuja długotrwałą odpornosc komórkową i humoralną

• przeciwwskazaniami osoby z niedoborami immunolog. - pierwotnymi i wtórnymi [leczenie, nowotwory, uważac w ciaży (szczególnie z różyczka)

inaktywowane

• zabite

• bez możliwości wirulencji

• odpornosć humoralna

• daja stosunkowo krótkotrwała odpowiedz, stad koniecznosc czestego ich powtarzania

34. Przedstaw na poziomie molekularnym działania toksyny błoniczej.

• synteza wzmaga się gdy kom obumiera.

• dostępność Fe, szczyt gdy jest niskie.

Frakcja B wiazaca- odp za przylaczanie się do kom przez receptor dla nabłonkowego czynnika wzrostu i transport do wnętrza kom.

Frakcja A- aktywna biologicznie: katalizuje przejscie adenozynodifosforany rybozy z NAD do czynnika wdłużająceg 2- EF2-to blokuje wydłużanie łańcuchów polipeptydowych. Rybozylacja EF-2 powoduje utrate aktywności hydrolitycznej GTP- kompleks GTP-EF-2_tRNA-mRNA nie może dysocjować. Blok wydłużania łańcucha.

35. Przedstaw strukturę endospory.

1. Najbardziej wewnętrzna warstwa - protoplast

• chromosom bakteryjny

• rybosomy

• zagęszczona cytoplazma

• kw. dipikolinowy (DPA) związany z Ca2+ zapewniający twardość i odporność przed wysokimi temperaturami. (posiadają bakterie i egzospory)

• białka SASP

2. warstwa korowa (tzw. kora endospory)

• Zbudowana z peptydoglikanu, cechującego się niskim usieciowaniem

• enzym GSLE - niezbędny do germinacji (kwitnienia, powrotu do formy metabolicznej), (amidaza, która hydrolizuje korę endospory)

• amidazy, hydrolazy potrzebne dla umocnienia nowej kom. bakt.

3. Płaszcz spory (tzw. płaszcz białkowy)

• zbudowany z keratynopodobnego białka

4. Egzosporium lipoproteinowa błona zewnętrzna (nie zawsze)

36. Omów mechanizm działania makrolidów, podaj przykłady tych antybiotyków i najważniejsze wskazania mikrobiologiczne.

Makrolidy wiążą się z podjednostka 50S rybosomy, immobilizuja peptydy tRNA powodując przedwczesne zakończenie syntezy łańcucha polipeptydowego. Blokują translokację.

Bakteriostatyczne, w wysokim stężeniu bakteriobójcze (wobec paciorkowców)

Np.: 1erytromycyna, 2klarytromycyna, 3azytromycyna.

Wskazania:1z wyboru Legionella, Mycplasma, alternatywa dla penicylin-bhemolizujace pac gr A i s.pneumoniae.

2Helicobacter pylori, Mycobacterium avium-intracellulare.

3.Chlamydia

34. Syntetycznie omów zjawisko transformacji genetycznej.

Jest to proces aktywnego pobierania przez kompetentne bakterie DNA pozabakteryjnego

(wolnego, nagiego) różnego rodzaju - może to byc DNA genoforowe (chromosomowe) i

plazmidowe. Może pobierac DNA wyłacznie swego gatunku, ale też może innych gatunków

bakterii, a nawet roslin, czy zwierzat…

Stan kompetencji (usposobienia do pobierania DNA) mo<e sie wyra<ac u bakterii:

• konstytutywnie (czyli stale) - np. Neisseria, czy Haemophilus

• po wzbudzeniu kompetencji - np. w przypadku niedoborów czynników wzrostowych, czy

składników pokarmowych, czy pod wpływem zniszczenia jakiejs jej struktury (np. otoczki).

Bakterie te charakteryzuja sie wiec obecnoscia pewnych detektorów, które wzbudzaja

transformacje.

Taki proces (pobieranie DNA przez komórke) u Eukaryota zwie sie transfekcja.

Transformacja jest to zatem proces naturalnego przetwarzania genów.

35. Wymień fazy wzrostu bakterii.

1. Faza adaptacyjna do podłoża, stanowi faze zahamowanego wzrostu (ok. 20 min., liczba bakterii

nie ulega zmianie - stała)

2. Faza logarytmicznego/intensywnego wzrostu, w niej nastepuje gwałtowny przyrost wielkosci

populacji, do momentu, w którym nastepuje równowaga miedzy iloscia bakterii a iloscia

substancji odżywczych

3. Faza stacjonarna, w której ilosc powstajacych w wyniku podziału bakterii jest równa ilosci

umierajacych (trwa kilka godzin), bo w podłożu zaczyna ju< brakowac substancji od<ywczych.

4. Faza wymierania, w której to na pożywce znajduje sie już zdecydowanie za mało pokarmu,

dlatego nie może nastapic dalszy wzrost.

36. Scharakteryzuj bakterie bezwzględnie beztlenowe; przykłady.

Oddychanie beztlenowe - ostatecznym biorcą elektronów jest zewnątrzpochodny związek organiczny

(fumaran) lub utleniony związek nieorganiczny (azotan, siarczan, węglan). ATP powstaje w wyniku

fosforylacji oksydatywnej. Łańcuch oddechowy krótszy niż przy oddychaniu tlenowym. Proces ten jest

bardziej wydajny niż fermentacja, mniej wydajny w porównaniu z oddychaniem tlenowym.

Bezwzgledne dzielimy dalej na:

• Scisłe - rosna z dala od tlenu - toksyczne jest dla nich steżenie 0,5-1% tlenu, np. Clostridium

• Umiarkowane [4% O2 działa toksycznie], np. Bacteroides

Tlen jest dla nich toksyczny dlatego, gdyż nie zawieraja układów rozkładajacych wolne rodniki

tlenowe.

37. Wyjaśnij znaczenie oporności naturalnej (wrodzonej) bakterii na antybiotyki; przykłady.

wrodzona (naturalna) - wiąże się z chromosomalnie określoną struktura bakterii i dotyczy wszystkich bakterii danego gatunku - nie opłaca się nawet robić testu na oporność.
Brak ściany komórkowej u Mycoplasma - brak działania beta-laktamów

Nieprzepuszczalna ściana komórkowa Pseudomonas - b-laktamy, aminoglikozydy

38. Wymień najczęstsze patogeny zakażeń szpitalnych.

a. Pseudomonas aeruginosa
b. S. ureus
c. S, epidermidis
oraz: Klebsiella pneumoniae, Proteusz mirabilit, paciorkowce
wirusy: wirus grypy
grzyby: Candida spp.

39. Scharakteryzuj rząd Mononegavirales.

Wirusy ssRNA(-) - zawierają jednoniciowy RNA o ujemnej polarności

• - Paramyxoviridae

• - Rhabdoviridae

• - Filoviridae

43 Postulaty Kocha - opisz.

p.w.

45.Szczepionki staej generacji - opisz, podaj jeden przykład.

1. Szczepionki zawierajace żywe drobnoustroje:

a. Szczepionki zawierajace drobnoustroje o pełnej wirulencji

• jedyna - ospa krowia (krowianka) - szczepienie to daje odpornosc na ospe prawdziwa

b. Szczepionki zawierajace żywe, atenuowane [awirulentne, pozbawione zjadliwosci] patogeny

• waglik

• gruzlica

• MMR - mumps [swinka], measles [odra], rubeola [różyczka]

• polio - szczepionka doustna Sabina

istnieje możliwosc odtworzenia wirulentnego genotypu - a wiec rewersja do wirulencji.

powstanie odpornosci komórkowej i humoralnej

przeciwwskazaniami do stosowania tego rodzaju szczepionek sa:

• osoby z niedoborami immunolog. - pierwotnymi i wtórnymi [leczenie, nowotwory]

• uważac w ciaży (szczególnie z różyczka)

2. Szczepionki zawierajace zabite drobnoustroje [ „inaktywowane”]

• polio - szczepionka Salka - zawiera 3 typy wirusów polio [ubitych formalina]

•  Vaxigrip - szczepionka na grype

•  DiPerTe - zabite pałeczki krztusca [pertussis]

powstania odpornosci humoralnej

krótkotrwała odpowiedz, stad koniecznosc czestego ich powtarzania

3. Anatoksyny

przekształcona na drodze procesów fizycznych toksyna bakteryjna, która traci własciwosci toksyczne („odzjadliwiona” toksyna), zachowujac właściwości antygenowe [preparat pozbawiony własciwosci toksycznych, ale immunogenny, to toksoid]

• anatoksyna teżcowa -. w szczepionce DiPerTe

• anatoksyna błonicy - na wykładzie były dwa rodzaje otrzymywania tej anatoksyny

53.Podaj przykałd klinicznie ważnego reowirusa i napisz czym sie różnią reowirusy od innych wirusów RNA.

Segmentowany wirus o podwójnej nici DNA dodatkowo bezosłonkowe co wśród RNA wirusów też nie często się zdarza

Wirus rota - najczęstsza przyczyna niebakteryjnej biegunki u niemowląt

54.Podaj geny strukturalne HIV i za co sa odpowiedzialne.

Wirus HIV posiada 9 genów, w tym 3 geny strukturalne oraz 6 regulatorowych

• Geny strukturalne koduja białka struktury wirusa:

o Gen gag - koduje białka nukleokapsydu, kapsydu (p24/p26), matriksowe (p17/p16), p6 i peptydy p1 i p2

o Gen pol - koduje odwrotna transkryptaze z domeną RNazy H, integraze, proteaze P

o Gen env - envelop (z ang. otaczac) - koduje GP 160 (GP41 + GP 120)

55.Najczesnsza bartoneloza i jednostka chorobowa jaka wywołuje.

Bartonella (Rochalimea) hensale- choroba kociego pazura, łagodny, czasami przewlwkły przebieg, powiększenie węzłów chłonnych, gorączka str. 231

56.Przykład antybiotyku glikopeptydowego i zastosowanie kliniczne.

zaburzenie drugiego etapu syntezy peptydoglikanu ściany komórkowej

Przedstawiciele: wankomycyna, teikoplanina.

Spektrum:

- ziarenkowce G(+), oporne na β -laktamy i u pacjentów z nadwrażliwością na β -laktamy,

- paciorkowce β -hemolizujące, penicylino-oporny S. pneumoniae / Enterococcus,

- gronkowce: S. aureus, S. epidermidis metycylino-oporny (MRSA, MRCNS).

Wady: potencjalnie ototoksyczne i nefrotoksyczne, szybkie zaczerwienienie skóry na skutek szybkiego

uwalniania histaminy.

57.Scharakteryzuj S. agalaciae ze szczególną uwagą na jego działanie patologiczne.

Streptococcus agalactiae jest paciorkowcem β-hemolizującym z grupy B.

a) Jest składnikiem flory fizjologicznej jamy ustnej, nosogardzieli przewodu pokarmowego i pochwy, jest

podstawowym czynnikiem etiologicznym zakażeń w okresie noworodkowym, Zakażenia charakteryzują się poważnym przebiegiem klinicznym i wysoka śmiertelnością.

Najczęstszym sposobem zakażenia noworodka jest zakażenie podczas porodu, lub zakażenie drogą wstępującą wskutek pęknięcia pęcherza płodowego. Zakażenie manifestuje się zespołem

ostrej niewydolności oddechowej w wyniku zapalenia płuc oraz posocznicy.

Głównym czynnikiem zjadliwości jest otoczka wielocukrowa, inne czynniki to hemolizyny i neuraminidaza.

Antygeny otoczkowe paciorkowca z grupy B są obecne we wszystkich płynach ustrojowych.

58.Drobnoustroje predysponujace do rozwoju raka.

-HPV (rak szyjki macicy, sromu, prącia)
-EBV (Chłoniak Burkitta, chłoniak z limfocytów B, rak jamy nosowo-gardłowej)
-HHV-8 (mięsak Kaposiego).
-HBV (pierwotny rak wątroby)
-HTLV-1,2 (białaczka z limfocytów T)
-Poliomawirusy: BK,JC,SV40 (m.in. złośliwy międzybłoniak opłucnej)
Bakterie:
-Helicobacter pylori (rak żołądka)
Grzyby?
-Aspergillus flavus (aflatoksyny)
tank sou Jazzman87

59.Co to jest transformacja lizogenna bakterii podaj przykład.

Transformacja

 Jest to proces aktywnego pobierania przez kompetentne bakterie DNA pozabakteryjnego

(wolnego, nagiego) różnego rodzaju - może to byc DNA genoforowe (chromosomowe) i

plazmidowe. Może pobierac DNA wyłacznie swego gatunku, ale też może innych gatunków

bakterii, a nawet roslin, czy zwierzat…

60.Podaj szkodliwe skutki działania leków przeciwdrobnoustrojowych zarówno dla pacjenta jak i dla środowiska.

61.Najcześciej występyjacy u człowieka enterokok i jego naturalna lekooporność

Bakterie Enterococcus faecalis czyli paciorkowce kałowe należą do ziarniaków. Stanowią naturalną florę

przewodu pokarmowego człowieka. Niektóre mogą być przyczyną chorób dróg moczowych i zatruć

pokarmowych oraz zakażeń szpitalnych. Do ważniejszych należą: Enterococcus faecalis, Enterococcus faecium, wg. Wykładu wszystkie Enterococcus są naturalnie oporne na cefalosporyny i penicylinę benzylową

ampicylina, amoksycylina (część szczepów naturalnie oporna)

JJEŻELI PISZEMY ŻE „CZĘŚĆ SZCZEPÓW JEST OPORNA” TO NIE MAMY NA MYSLI OPORNOSCI NATURALNEJ!
piperacylina (ok. 40% szczepów opornych)
aminoglikozydy (tylko w skojarzeniu z antybiotykiem β-laktamowym, część szczepów wysoce oporna)

62.Co to jest szczepionka podjednostkowa podaj 2 przykłady
Szczepionki nie zawierające całych patogenów ale ich izolowane antygeny lub fragmenty antygenówotrzymane droga syntezy chemicznej lub rekombinacji

• np. wielocukier otoczki Neisseria meningitidis

• np. szczepionka przeciw wirusowi zapalenia watroby typu B (robiona na drożdżach!) jest to tylko antygen HBsAg tego wirusa.

37. Przedstaw na poziomie molekularnym działania toksyny błoniczej.

• synteza wzmaga się gdy kom obumiera.

• dostępność Fe, szczyt gdy jest niskie.

Frakcja B wiazaca- odp za przylaczanie się do kom przez receptor dla nabłonkowego czynnika wzrostu i transport do wnętrza kom.

Frakcja A- aktywna biologicznie: katalizuje przejscie adenozynodifosforany rybozy z NAD do czynnika wdłużająceg 2- EF2-to blokuje wydłużanie łańcuchów polipeptydowych. Rybozylacja EF-2 powoduje utrate aktywności hydrolitycznej GTP- kompleks GTP-EF-2_tRNA-mRNA nie może dysocjować. Blok wydłużania łańcucha.

38. Przedstaw strukturę endospory.

1. Najbardziej wewnętrzna warstwa - protoplast

• chromosom bakteryjny

• rybosomy

• zagęszczona cytoplazma

• kw. dipikolinowy (DPA) związany z Ca2+ zapewniający twardość i odporność przed wysokimi temperaturami. (posiadają bakterie i egzospory)

• białka SASP

2. warstwa korowa (tzw. kora endospory)

• Zbudowana z peptydoglikanu, cechującego się niskim usieciowaniem

• enzym GSLE - niezbędny do germinacji (kwitnienia, powrotu do formy metabolicznej), (amidaza, która hydrolizuje korę endospory)

• amidazy, hydrolazy potrzebne dla umocnienia nowej kom. bakt.

3. Płaszcz spory (tzw. płaszcz białkowy)

• zbudowany z keratynopodobnego białka

4. lipoproteinowa błona zewnętrzna (nie zawsze)

39. Omów mechanizm działania makrolidów, podaj przykłady tych antybiotyków i najważniejsze wskazania mikrobiologiczne.

Makrolidy wiążą się z podjednostka 50S rybosomy, immobilizuja peptydy tRNA powodując przedwczesne zakończenie syntezy łańcucha polipeptydowego. Blokują translokację.

Bakteriostatyczne, w wysokim stężeniu bakteriobójcze (wobec paciorkowców)

Np.: 1erytromycyna, 2klarytromycyna, 3azytromycyna.

Wskazania:1z wyboru Legionella, Mycplasma, alternatywa dla penicylin-bhemolizujace pac gr A i s.pneumoniae.

2Helicobacter pylori, Mycobacterium avium-intracellulare.

3.Clamydia

57.Scharakteryzuj S. agalactiae ze szczególną uwagą na jego działanie patologiczne.
Gram (+) paciorkowiec beta-hemolizujący, należący do grupy B wg Lancefield.
Gdzie występuje?
Jest to drobnoustrój oportunistyczny:
-jama nosowo-gardłowa
-jama ustna
-przewód pokarmowy
-pochwa
-okolica moczowo-płciowa 5-50% kobiet w ciąży
Czynniki chorobotwórcze:
-CAMP = Co-cytolizyna B
-DNAza
-CF (clumping factor = czynnik zlepiania u niektórych szczepów)
-Hialuronidaza, neuramidaza
Ważny czynnik etiologiczny okołoporodowych zakażeń noworodków:
Do 1 tygodnia życia:
-bakteriemia
-zapalenie płuc
Od 1 do 8 tyg. ż.:
-bakeriemia
-zapalenie opon mózgowo-rdzeniowych
Leczenie:
-ampicylina

58.Drobnoustroje predysponujace do rozwoju raka:
Wirusy:
-HPV (rak szyjki macicy, sromu, prącia)
-EBV (Chłoniak Burkitta, chłoniak z limfocytów B, rak jamy nosowo-gardłowej)
-HHV-8 (mięsak Kaposiego).
-HBV (pierwotny rak wątroby)
-HTLV-1,2 (białaczka z limfocytów T)
-Poliomawirusy: BK,JC,SV40 (m.in. złośliwy międzybłoniak opłucnej)
Bakterie:
-Helicobacter pylori (rak żołądka)
Grzyby?
-Aspergillus flavus (aflatoksyny)

59.Co to jest transformacja lizogenna bakterii podaj przykład.
Bakteria nabywa nowych cech poprzez integracje materiału genetycznego przenoszonego przez bakteriofaga ( np. gen tox -Corynebacterium diphteriae).

40. Przedstaw tzw. postulaty Kocha-na podstawie wykładu który przesłał Kuba

Warunkiem uznania drobnoustroju za czynnik zakaźny jest:

1. Jego występowanie we wszystkich przypadkach danej choroby.

2. Możliwość wyizolowania go z zakażonej tkanki i wyhodowania go In vivo

3. Możliwość zakażenia podatnego zwierzęcia wyhodowanym drobnoustrojem. Objawy choroby są takie same jak u człowieka.

4. Wyizolowany i wyhodowany drobnoustrój od zarażonego zwierzęcia jest identyczny z tym wyhodowanym z materiału pobranego od człowieka.

41. Przedstaw jedynie podstawowe metody w diagnostyce wirusologicznej.

Spróbuje tu coś napisać

1. Hodowla w zarodkach kurzych, zwierzętach, komórkowa

2. Mikroskopia elektronowa- tzw. diagnostyka bezpośrednia wykrywanie wirusa w pobranym materiale- wykrycie ciałek wtrętowych w wymazach z zawartości pęcherzyków w wypadku ospy wietrznej.

3. Techniki wirusologiczne(diagnostyka pośrednia)

1. Hemaglutynacja- test oparty na zdolności wirusów do wywołania aglutynacji krwinek czerwonych. Hodowla+ seryjne rozcieńczenia+ 1%zawiesiny erytrocytów kurzych ludzkich.

2. Test lateksowy- cząsteczka lateksu opłaszczona p/ciałami

3. Immunofluorescencja:

- bezpośrednia FDA/DIF- materiał na szkiełku znakowane są p/ciała a wykrywane antygeny

- pośrednia IFA Antygen z występującymi w surowicy pacjenta p/ciałami+ antyimmunoglobuliny ludzkie znakowane.

d) Immunoenzymatyczne EIA

e) Techniki biologii molekularnej- PCR RFLP elektroforeza

3 Oporne na działanie wszystkich cefalosporyn są:

1. P. aeruginosa

2. Chlamydia

3. Enterobacter- Klebsiella

Żeby sklasyfikowac wirus trzeba podać typ i liczbe nici kwasu nukleinowego polarność genomu symetrie kapsydu wystepowanie lub brak oslonki kapsydu. Pytanie 39

- jednoniciowe RNA o ujemnej polarności

- symetria kapsydu heliakalna

- osłonkowe

???Kolonizacja:

1. Kontakt z komórkami gospodarza

2. Adherencja do kom. Gospodarza

3. Współzawodnictwo o substancje odżywcze

4. Obrona(unikanie) przed mechanizmami obronnymi gospodarza(fagocytoza)

5. Unikanie odpowiedzi immunologicznej

Niekiedy między pkt 2 a 3 można wstawić jeszcze jeden wniknięcie do komórki gospodarza np. chlamydia

Pytanie 38 najczęstsze patogenny zakażeń szpitalnych

1. S. Aureus

2. P. aeruginosa

3. Proteus vulgaris et mirabilit

4. Klebsiella pneumoniae

5. E. coli

6. S. typhi

7. S. dysenteriae

Nieco inna wersja pytania 34 syntetycznie tzn. w punktach(chyba;)

Jest to proces aktywnego pobierania przez kompetentne bakterie DNA pozabakteryjnego

(wolnego, nagiego) różnego rodzaju - może to byc DNA genoforowe (chromosomowe) i

plazmidowe.

1. Łączenie DNA z ścianą komórkową bakterii dzięki siłom jonowym

2. Przejście DNA przez ścianę komórkową i nieodwracalne łączenie z wewnętrzną błoną komórkową co powoduje zmiany konformacyjne w DNA i oporność na DNA-azę komórkową

3. Wniknięcie jednej nici DNA do cytoplazmy

4. Integracja z chromosomalnym DNA

51.Flora naturalna skóry

-10^4-10^5 drobnoustrojów na cm2

-głównie G+ bakterie beztlenowe

-Rozmieszczenie: więcej w msc wilgotnych niż suchych

                          Więcej mikroorganizmów  na skórze poniżej pasa (wydostają się z dróg przewodu                                             pokarmowego i dróg moczowo płciowych i kolonizują okolicę krocza)

-Skład: bakterie G+ (przykłady poniżej) oraz grzyby zwykle pod paznokciami i między palcami; u osób starszych bakterie G+ zastępowane przez grzyby np. C. albicans

(nie wiem czy mam opisać florę czy bakterie, pozwolę sobie opisać ten mniej oklepany przykład):

S.aureus (5-25% ludzi)

 

S.epidermidis (85-100%)

 

Propionibacterium Acnes

-pałeczki gram +, beztlenowe, nieprzetrwalnikujące

-morfologia pomiędzy Corynebacterium i Actinomyces; czasem widoczne „ziarna siarki”

-charakterystyczne: wytwarzają kwas octowy i propionowy

-udział w powstawaniu trądziku pospolitego; też zakażenia pooperacyjne, zakażenia sztucznych zastawek, zakażenia oczu , choroba Kawasaki

 

52. Zgodnie ze streszczeniami z wykładów:

-Enterokoki

-Pseudomonas

No i oporne na β-laktamy:

Chlamydie, Mykoplazmy

 

 

53. Cechy wyróżniające Reowirusy:

-SEGMENTOWANY GENOM O PODWÓJNEJ NICI RNA

-charakterystyczny 3 warstwowy kapsyd (ale nie wiem czy inne też go nie mają)

 

 Myślę że z tych wszystkich Reo- najistotniejsze klinicznie będą Rotawirusy… Skrótowa informacja:

-4 serotypy (ponoć teraz już 7, z czego A, B, c atakują ludzi)

- szczyt zachorowań w chłodnych miesiącach

-droga feralno-oralna

- wirus zakaża enterocyty kosmków jelita cienkiego - uszk nabłonka - biegunka (+ból brzucha, wzrost temp, wymioty, nudności)

-najczęstsza przyczyna niebakteryjnej biegunki niemowląt

-inkubacja 2-4 dni; biegunka trwa 1-2 dni; groźne: odwodnienie

-problem: zakażenia rotawirusami na oddziałach pediatrycznych dot do 60% dzieci przyjętych z innych powodów

- wyzdrowienie samoistne; od 2006 skuteczna szczepionka

14

---