1. Narysuj peptyd w konkretnym pH.
2. Charakterystyka aminokwasów (czy reszta aminokwasu jest polarna czy nie).
3. Narysować wszystkie możliwe wiązania stabilizujące struktury białek.
4. Wzór Michaelisa - Menten
5. Koenzymy, od jakiej witaminy pochodzą, gdzie jest miejsce reaktywne.
6. Do czego potrzebny jest nam tlen cząsteczkowy? Na czym polega szczególna rola tlenu w komórce? Co się dzieje, gdy komórki zdolne tylko do oddychania tlenowego zostaną pozbawione tlenu?
7. Co to jest łańcuch oddechowy?
8. Jak działa enzym?
9. Co to jest dehydrogenaza?
10. Co to jest fosforylacja oksydacyjna?
11. Co to jest grupa acylowa? Narysować
12. Porównać szlaki syntezy i rozkładu (np. glikogenu lub kwasów tłuszczowych)
13. Magazyn energii u zwierząt. Nazwij i narysuj wzory cząsteczek materiału zapasowego komórek zwierzęcych.
14. Reakcje z udziałem acetylo - CoA.
15. Losy pirogronianu - reakcje.
16. Co to jest kontrola oddechowa?
17.Narysuj wzór związku, który jest źródłem łatwo dostępnego potencjału redukcyjnego (elektronów i protonów) potrzebnego w procesach biosyntezy. Nazwij ten związek i napisz w jakim szlaku metabolicznym powstaje.
18. Jakie są korzyści z tego, ze reakcje syntezy nie są na ogól odwróceniem reakcji katabolicznych?
19. Oblicz szybkość reakcji enzymatycznej przy stężeniu substratu [S]=1*10-5 mol/l, jeżeli Km
rozpatrywanego enzymu wynosi 4,5*10-6 mol/l, a prędkość maksymalna reakcji katalizowanej przez ten enzym Vmax=7*10- mol/min
20. Przedstaw funkcje: a) centrum aktywnego enzymu, b) koenzymu, c) miejsca allosterycznego enzymu.
21. W jaki sposób gradient protonów wpływa na syntezę ATP?
22. Stosunek molowy zasad jednego łańcucha dwuniciowej helisy DNA jest następujący: A:G=3:2. Co można powiedzieć o zawartości A, G, T i C w łańcuchu komplementarnym?
23. Czy zwierzęta potrafią przekształcać kwasy tłuszczowe w glukozę? Odpowiedz uzasadnij.
24. Podaj reakcje glikolizy katalizowane przez izomerazy.
25. Wymień przynajmniej trzy związki, które mogą wiązać się z grupami acylowymi (np. acetylowymi) w organizmach żywych.
26. W której z reakcji cyklu kwasów trójkarboksylowych powstaje wysokoenergetyczne wiązanie fosforanowe? Jaki enzym katalizuje te reakcje?
27. Podaj korzyści fosforolitycznego rozkładu glikogenu w porównaniu z rozkładem hydrolitycznym.
28. Narysuj 3 cząsteczki, które przenoszą grupy acylowe.
29. α-ketokwasy powstałe w transaminacjia. Narysuj i nazwij
30. Narysuj NADPH. Jaka pełni funkcje. Jakie jest zróżnicowanie NADH i NADPH?
31. Co to jest: miejsce aminoacylowe; kontrola oddechowa; jednostka aktywności enzymu; cytochrom; antykodon; degradacja kodu genetycznego; enzym allosteryczny; translacja; fosforylacja;
32. Czy glicerol może służyć organizmowi jako źródło energii?
33. Podaj po jednym przykładzie reakcji katalizowanych przez hydrolaze, izomeraze, liaze.
34. Jakie związki poza ATP mogą pełnić role magazynowania energii (są wysokoenergetyczne)? Napisz wzór i pełną nazwę jednego z nich.
35. Jakie mechanizmy pozwalają utrzymać stałe pH w komórce?
36. Ile jonów HCO3 - weźmie udział w syntezie 1 cząsteczki kwasu palmitynowego. Uzasadnij.
37. Ile cząsteczek ATP powstaje z utlenienia glukozy, NADH, fruktozy, 1,6-difosforanu?
38. Narysuj FADH2 i biotynę. Podaj ich witaminowe prekursory, zaznacz miejsce aktywne.
39. Co to znaczy, ze aktywność enzymu wynosi 4?
40. Jaka jest funkcjonalna różnica miedzy NADH a NADPH?
41. Narysuj aminokwas w punkcie izoelektrycznym.
42. Jaki będzie stosunek [S] do Km., jeśli prędkość wynosi 80% prędkości max?
43. Ile energii uzyskamy podczas utlenienia: glukozy, fruktozofosforanu, NADH?
44. Napisz po jednej reakcji: hydrolizy; kontrola szlaku pentozofosforanowego; fosforylacji,
powstawanie mocznika.
45. Jaka jest różnica między syntezą a rozkładem kwasów tłuszczowych jeśli chodzi o: miejsce
zachodzenia reakcji; nośniki grup acylowych; koenzymy; białkowy nośnik; związki jakie powstają?
46. Co to jest aktywacja proteolityczna i modyfikacje kowalencyjne?
47. Podaj przykład fosforylacji i dehydrogenacji.
48. Podaj reakcje kontrolna szlaku pentozofosforanowego i reakcje powstawania mocznika.
49. Napisz wzór peptydu Thr-Glu-Lys w punkcie izoelektrycznym. Zaznacz, które reszty aminokwasów są polarne, a które nie polarne.
50. Narysuj mitochondriom i zaznacz, gdzie zachodzi: cykl Krebsa, łańcuch oddechowy, gradient protonów.
51. Oblicz stosunek [s] do Km jeśli prędkość wynosi 60% prędkości maksymalnej.
52. Napisz reakcje katalizowane przez: fosfofruktokinazę, fosforylazę glikogenową, karboksylazę acetylo-CoA, synatzę cytrynianową
53. Wymień związki i narysuj ich wzory, które dostarczają CO2 i amoniaku do budowy mocznika.
54. Narysuj wzór niacyny i narysuj wzór koenzymu pochodzącego od niej oraz napisz reakcję, w której bierze udział ten koenzym.
55. Wyjaśnij co to jest modyfikacja kowalencyjna i aktywacja proteolityczna enzymu.
56. Izomeraza + przykłady reakcji.
57. Specyficzność substratowa enzymów?
58. Wyznaczyć doświadczalnie Vmax i Km enzymu.
59. Napisz klasy do jakich należą: trypsyna, ureaza, lizozym.
60. Napisz wzór koenzymu przenoszącego grupy acylowe i enzymu przenoszącego grupy karboksylowe. Nazwa + miejsce aktywne.
61. Witaminy rozpuszczalne w tłuszczach + funkcje.
62. Koenzymy nie pochodzące od witamin . Narysować 1.
63. Koeznym A - klasa + reakcja.
64.. Rodzaje regulacji aktywności enzymów.
65. Km - wzór + znaczenie.
66. Wzory biotyny, NADPH - co to i do czego?
67. Co to są enzymy allosteryczne.
68. Obliczyć aktywność enzymu. 10mmol, 2 minuty.
69. Wg wykresu Lineaveara-Burka opisać różnice między inhibicją kompetencyjną i niekompetencyjną.
70. Oksydoreduktazy, wypisać + grupy które reagują.
71. Narysuj kwas liponowy, wskaż miejsce aktywne.
72. Co wpływa na aktywność enzymu?
73. Jakie koenzymy współpracują z oksydoreduktazami?
74. funkcje ATP
75. narysować wzory ryboflawiny, wit PP, Wit. B1 (pirofosforan tiaminy), Wit.B2 (ryboflawina), Wit. B3, Wit. B5 (kw. pantotenowy), Wit. H (biotyna), Wit. C (kw askorbinowy)
76. Reakcje w glikolizie do których zostaje zużyte ATP.
77. Reakcja dehydrogenacji w cyklu krebsa.
78. Kiedy powstaje mleczan i jego funkcja w organizmie. Zapisz reakcje, w której powstaje.
79. Napisz reakcje glukozo-6-fosforanu, której podlega w wątrobie a nie w mięśniach.
80. Reakcja izomeryzacji w glikolizie.
81. Reakcje cyklu krebsa, w której powstaje wysokoenergetyczne wiązanie fosforanowe.
82. Dlaczego więcej cząsteczek ATP (ile?) powstaje z utlenienia NADH, niż z FADH2?
83. Jak regulowana jest szybkość rozkładu glikogenu.
84. Reakcja w glikolizie w których zostaje wytworzone ATP.
85. Wymień kolejno przenośniki elektronów łańcucha oddechowego.
86. Napisz sumaryczną reakcję łączącą glikolizę z cyklem krebsa. Nazwij i scharakteryzuj enzym katalizujący ta reakcje.
87. Napisz nieodwracalne reakcje w glikolizie.
88. Izomeryzacja głównego produktu rozkładu glikogenu.
89.Energia swobodna utleniania wykorzystywana do syntezy ATP. W jaki sposób utleniane NADH i FADH2 jest sprzężone z fosforylacją?
90. Gdzie przebiega cykl krebsa i glikoliza w komórce oraz synteza glikogenu, fosforylacja oksydacyjna.
91. Wyjaśnij dlaczego cykl krebsa mimo że tlen cząsteczkowy nie bierze udziału, może funkcjonować jedynie w warunkach tlenowych.
92. Reakcja fosforylacji w glikolizie.
93. Przekształcenia pirogronianu w warunkach beztlenowych w organizmach wyższych i drobnoustrojach.
94. Jak regulować szybkość przebiegu glikolizy.