1. Białka przeznaczone do degradacji ulegają:
-metylacji
-fosforylacji
-ubikwitynacji
-glikozylacji
2.Inteiny są to:
-enzymy proteolityczne
-białka opiekuńcze
-białkowe odpowiedniki intronów
-czynniki biorące udział w procesie inicjacji translacji
3.Kod genetyczny jest jednoznaczny bo:
-1 tryplet koduje 2 lub więcej aminokwasów
-1 aminokwas kodowany jest przez kilka trypletów
-każdy tryplet koduje 1 aminokwas
-każdy aminokwas kodowany jest przez 1 tryplet
4.Kodon AUG jest obecny w :
-tRNA
-DNA
-rRNA
-cząst. mRNA
5.Sekwencja sygnałowa jest to sekwencja:
-rozpoznawana przez czynniki transkrypcyjne
-umożliwia komunikowanie się między białkami
-kieruje białka do odpow. kompartmentu kom.
-kieruje białka do degradacji
6.Etap elongacji translacji:
-dostarczenie aminoacylo tRNA
-tworzenie wiązań peptydowych
-translokacje
-wszystkie prawidłowe
7.Białka szoku termicznego:
-pojawiają się w komórkach pod wpływem wzrostu temp.
-biorą udział w degradacji białek
-umożliwiają białką przyjecie odpowiedniej konformacji
-wszystkie prawidłowe
8.W czasie inicjacji syntezy białka tRNA inicjatorowe wiąże się z :
-IF1 i GTP
-IF2 i GTP
-IF3
-IF3 i GTP
9.Kompleksy wielu rybosomów na jednym mRNA to:
-miejsce wiążące rybosom
-sekwencja Shine-Delgarno
-polisom
-inicjat. tRNA
10.t-SNARE to:
-białko obecne na pęcherzykach
-białko obecne po cytoplazmatycznej stronie błony docelowej
-sekwencja rozpoznawana przez rybosom w czasie skanowania
-sekwencja kierująca białko do ERW drugiej grupie, pierwsze pytanie było to samo, potem co to są eksteiny (czy coś
), v-SNARE, co jest potrzebne do transkrypcji (mRNA,tRNA.....itd.), jaką funkcję pełni RF3 (pomaga RF1 i RF2), co to znaczy,że kod genetyczny jest zdegenerowany i chyba coś jeszcze o sekwencji sygnałowej:P ale pewna nie jestem;)

-SWI/SNF
-tmRNA ( za co odpowiada )
-SiRNA
-graA i greB za co odpowiadają
-m7G
-gRNA
-chyba: pierwotny transkrypt polimerazy 1 nie zawiera:
a 28SrRNA
b 5SrRNA
c 18SrRN
d 5,8SrRNA
-które nie jest wykorzystywane w transkrypcji jako źródło energii:
ATP, GTP/CTP, TTP
-Jak powstaje ciałko Baara
- introny samowycinające się
- co robi B' w polimerazie
- czynnik sigma 32 za co odpowiada
- w której polimerazie są podjednostki -10 i -35 (chodziło o prokariota)
- u prokariota bezpośrednim produktem transkrypcji nie jest....
bylo jeszcze o bialku TBP

W jakiej postaci wystepuje materiał genetyczny u Procarytoa
Wybrac pochodną kamptotecyny
o polimerazę RNA z E.Coli wybrac fałszywe - że rdzeń enzymu zawiera czynnik sigma
enzym RNA polimeraza jak sie przesuwa,że wzdłuż nici sensownej i 5' -> 3'
coś o sekwecjach miedzy -35 a -10
wybrać który lek nie nalezy do antymetabolitów
chyba która polimeraza wyst u eucarytoa
bardzo trudne pytanka o rekombinacje z genomów
reszty nietsety nie pamiętam,bo były to pytanka typu wybierz prawdziwą lub fałszywą odpowiedź :-/
+ z rekombinacji pytanie na czym polega ten model tego pana na M.. że przecięcie w jednej nici i inwazja na drugą
-o miejsce chi w rekombinacji E.coli szlaku RecBCD
-białko powodujące przesuwanie sie rozgałęzienia w rekombinacji E.coli
-jaka grupa lekow nie zaburza transkrypcji, replikacji => inhibitory angiotensyny
-promotory dla pol III o te bloki chodziło A i B
-białko TBP czego jest składnikiem
-pyt o domeny helsa-zwrot-helisa -co to i gdzie występuje
-promotor dla Pol I
- do czego przyłącza sie polimeraza u E.coli

za co odpowiedzialne jest snRNA
-białka GREA i GREB -regulują elongacje u procaryota
-produkty transkrypcji u eucaryota ( tRNA,rRNA,snRNA,snoRNA,scRNA)
-aktynomycyna D
-opisać palce cynkowe
-co to jest TBP
-co to jest kryptogen
-produkty transkrypcji u procaryota(pre mRNA,pre rRNA,pre tRNA)
-allolaktoza-induktor
-co to jest siRNA
-tryptomycyna
-domena zasadowa i domena kwasowa
- tryptofan-korepresor
-białko STAT
-ryfamycyna
-były podane nukleotydy w jakiś kolejności i trzeba było wskazać która z nici to mRNA ona miała na poczatku UU
- Antyestrogeny było testowe, to co z ostatniego seminarium podawała
-skąd pochodzi energia do elongacji i chyba chodziło o ATP->AMP
1. Spliceosom
2. DICER i RISK(jesli ktos wie o co chodzi prosze dac znac)
3. Cisplatyna
4. Kamptotecyna
5. Ktora polomeraza ma promotory wewnetrzne- III
6. Mech. dzial. antyestrogenow
7. Bialko CAP- rola w operonie laktozowym
8. Bialko Rho
9. Co to interferenca
10. Co to redagowanie?
bialko ABObeta- cos w kom jelita... ale czy napweno??
homeodomena (czy to to samo co domena homeotyczna?)
ktora polimeraz posiada czapeczke i lancuch poliA
polimeraz ktora wyst w jaderku
ktory czynnik fosforyluje Ckoncowa domene
flucytozyna (w odp. coz z cytozyna)
M7G (w odp cos z czapeczka)
5sRNA
ktora polimeraza ma promotory wew a ktora zew
energia transkrypciji( ponoc ma byc odp TTP (cokolwiek to jest)
1. RYBOZYMY
2. TOPOTECAN
3. Co wchodzi w sklad HOLOENZYMU
4.TRYPTOMYCYNA??????
1. Funkcje GreA i GreB - wg mnie wszystkie poprawne.
2. Allolaktoza jest:
a) induktorem
b) korepresorem
c) represorem
d) wzmacniaczem
3. Energia do trankrypcji pochodzi z(mniej więcej tak to brzmiało:
a) ATP
b) CTP i GTP
c) TTP
d) b i c prawidłowe
5. Pytanie testowe o snoRNA
6. Co to jest aktynomycyna D? Testowe, mniej wiecej chodziło chyba o tez związek...
7. Antyestrogeny - pytanie testowe, różne dziwne odpowiedzi do wyboru.
8. Ryfamycyna - gdzie działa, z czym działa i co powoduje, pytanie testowe. Chyba wszystkie odpowiedzi poprawne.
9. Podana nić antysensowna i trzeba było dobrać sekwencję mRNA.
10. Opisowe. Co to są kryptogeny?
11. Opisowe. Interferencja RNA na czym polega.
12. Opisowe. Co to jest białko TBP?
1. Czynnik sigma32 za co odpowiada.
2. Kamptotecyna
3. Cisplatyna
4. Sila promotora- opisowe
5. Budowa promotora u E.Coli- opisowe
6. Episom- opisowe
7. Przepisac sekwencje z sesnownej DNA na RNA
8. Bialko Rho- co konczy terminacje
9. Domena dimeryzacyjna- wybrac 1 z podanych
10. Sposob wycinania intronow- chyba ma byc prawidlowa odp I i III bez punktu II gdzie podane byly jakies bialka TAF
11. Rola bialka gRNA- podalam ze bierze udzial w dojrzewaniu ale czy dobrze??
12. Roznica w dojrzewaniu pre-tRNA (chodzilo o odp ze u prokariota CCA jest kodowana a u eukariota nie)

1. Bialka histonopodobne występują na zasadzie oddziaływania ..........
2. Narysowany (odręcznie;) schemat operonu i trzeba napisac co jest oznaczone literką "b" (w mojej wersji byl to chyba induktor)
3. Narysowana struktura spinki : Narysowana struktura jest sekwencją(czy strukturą).......Nie występuje w .....terminatorach
4. Wymienić pochodne kamptotecyny
5. terminatory oznaczają miejsca w ktorcyh szybkść uwalniania..... jest .... niż szybkość uwalniania transkryptu
6. Pyt testowe o struktura helisa zwrot helisa ze występuje : a) domenach homeo.. b) THIIA c)SP1 d) a i c prawdziwe
7. wymienić czynniki transkrypcji przy polimierazie II
8. Co to jest THIID i THIIA , przy jakiej polimerazie i funkcje
9. Materiałem genetycznym (czy chromosomem )bakteri jest :
a) nukleoid b) nukleosom c) diplodalna kolista cząst DNA przyczepiona do bł. kom (coś takiego )
10. Pytanie o kinazy tyrozynowe (testowe , o funkcji tych kinaz)
11. Transkryopcja jest przeprowadzana dzięki polimerazie .... zależnej od ... W skład rdzenia polimerazy wchodza 2 podjednostki ... podjednostka ... i ... Istnieje też podjednostka ... ktorej funkcją jest ...
12. Polimeraza I nie syntetyzuje (testowe)
13.W transkrypcji przy pomocy polimerazy I czynnikiem odpowiedzialnym za rozpoznanie i przyłączenie sie do promotora jest...
14. TBP wchodzi w sklad (testowe)
15. W promotorze (przy pol I ) występują (testowe jakie regiony)
To była wersja A i tyle zapamiętałam (było 16 pytań i mniej wiecej tak brzmialy ale tylko mniej więcej;)

Polimerazy I, Pol III, operon laktozowy - trzeba zaznaczyc na rysunku - chodzi o aktywator, wypisac pochodne kamptotecyny, jak nazywa sie genom prokaryota, co to jest TBP, co robią kinazy tyrozynowe (fosforylują), za co odpowiedzialna jest podjednostka "sigma", co tworzy holoenzym, pytani o podjednostkę "beta" , dokonczyc zdanie o strukturze spinki - ze to terminacja rho-niezależna
co syntetyzuje Pol I
białko TBP wchodzi w skłąd czynnika SL1
pytanie o promotory

To co udalo mi sie zapamietac:WERSJA D
- inhibitory kinaz tyrozynowych wymienic do jakiej naleza grupy i przyklady
- funkcja TFIID i TFIIJ
- TBP
- na jakiej zasadzie oddzialywuja bialka histonopodobne z DNA(elektrostatycznie)
- rysunek operonu lac i opisac ktory z elementow to represor
- mutacja w miejcu promotora -10 powoduje.........
- kilka pytan testowych o czynniki transkrypcyjne dla Poli III
- funkcja bialek greA i greB
- cos o strukturach heksamerowych
- testowe o bialkach histonopodobnych nieswoistych
Wiecej nie pamietam niestety...

W jakiej postaci wystepuje materiał genetyczny u Procarytoa
Wybrac pochodną kamptotecyny
o polimerazę RNA z E.Coli wybrac fałszywe - że rdzeń enzymu zawiera
czynnik sigma
enzym RNA polimeraza jak sie przesuwa,że wzdłuż nici sensownej i 5' -> 3'
coś o sekwecjach miedzy -35 a -10
wybrać który lek nie nalezy do antymetabolitów
chyba która polimeraza wyst u eucarytoa

z rekombinacji pytanie na czym polega ten model tego pana na M.. że
przecięcie w jednej nici i inwazja na drugą
-o miejsce chi w rekombinacji E.coli szlaku RecBCD
-białko powodujące przesuwanie sie rozgałęzienia w rekombinacji E.coli
-jaka grupa lekow nie zaburza transkrypcji, replikacji => inhibitory
angiotensyny
-promotory dla pol III o te bloki chodziło A i B
-białko TBP czego jest składnikiem
-pyt o domeny helsa-zwrot-helisa -co to i gdzie występuje
-promotor dla Pol I
- do czego przyłącza sie polimeraza u E.coli

pytania z zeszlych lat wersja awenturyn i rubin
~funkcje GreA i GreB
~allolaktoza jest...
~energia do transkrypcji pochodzi z...
~pytanie o snoRNA
~co to jest aktynomycyna D
~antyestrogeny
~ryfampicyna gdzie dziala co powoduje
~podana byla nic antysensowna i trzeba bylodobrac sekwencje mRNA
~opisowe co to sa kryptogeny
~opisowe na czym polega interferencja RNA
~opisowe co to jest bialko TBP
~czynnik sigma 32 za co odpowiada
~kamptotecyna
~cisplatyna
~opisowe sila promotora
~opisowe budowa promotora u E coli
~opisowe episom
~przepisac sekwencje z sensownej DNA na RNA
~bialko Rho
~domena dimeryzacyjna
~sposoby wycinania intronow
~rola bialka g RNA
~roznice w dojrzewaniu pre-tRNA

Gr A: Wązanie beta-N-glikozydowe? (cukier-zasada)
Co to jest nukleotyd? (Cukier+zasada+reszta fosforanowa)
Wymienić pirymidyny. (Tymina, cytozyna, uracyl)
Podać pochodne kamtotecyny. (Tapotekam, CPT11, 9-amino-kamptotecyna)
Jaki enzym rozrywa wiązania wodorowe? (Helikaza)
Miejsce inicjacji replikacji u E.Coli. (ori C)
Aukostrofy. (Uaktywniają czynniki mutagenne pod wpływem sub odżywczej)
Wiązanie fosfodiestrowe. (Między cukrem a resztą fosforanową).
Fluorouracyl jest… (analogiem uracylu-antagonistą pirymidyny)

Gr B
Wiązanie fosfodiestrowe. (Między cukrem a resztą fosforanową).
Jakiej gr funkcyjnej nie posiada tymina, a mają ją wszystkie inne zasady? (NH2)
Puryny. Adenina, guanina
Jaki enzym bierze udział w cięciu i zlepianiu łańcuchów nukleotydowych DNA. (Topoizomeraza).
Organizmy warunkowo letalne. (Uaktywniają się w zależności od temp).
Wiązanie beta-N-glikozydowe. (Ckier-zasada)
Miejsce inicjacji replikacji u drożdży. (Ars)
Do jakiej gr leków należą kompleksy z platyną,. (Alkilujące)
Do jakiej gr leków należą inhibitory gyrazy, podać przykłady tych inhibitorów. (Chinoliny. Kwas halidyksowy, rozoksacyna, norfoksacyna)

1. Naprawę przez wycinanie zasad zaczyna: glikozydaza
2. Kompleks enzymatyczny UvrABC występuje w mechanizmie naprawy: krótkich łat
3. Skutkiem poślizgu replikacji mogą być: choroby neurodegeneracyjne
4. Wysoka wierność procesu replikacji: wynika z istnienia specjalnych mechanizmów naprawczych
5. Mechanizm korekcyjny replikacji odbywa się dzięki: aktywności egzonukleazowej polimerazy DNA
6. Rejony chromosomów eukariotycznych zawierające aktywne transkrypcyjnie geny posiadają: rozluźnioną strukturę
7. Plazmidy degradacyjne: nadają komórce biorcy zdolność do metabolizowania nietypowych substancji, np toluenu
8. Do białek nie wykazujących swoistości sekwencyjnej należą: Hu i H-NS
9. Do cech charakterystycznych genomu prokaryota należą: występowanie genów ciągłych; obecność operonów; policistronowe mRNA; występowanie plazmidów, kaset genowych i integronów
10. Otwarty kompleks inicjujący u Procaryota zawiera: białko DnaA, DnaB, białka Ssb oraz region OriC
11. Polimeraza DNA katalizuje proces powstawania wiązań chemicznych między: deoksyrybozą jednego nukleotydu a resztą fosforanową drugiego nukleotydu
12. Odpowiednikiem białek Ssb u eukaryota jest: RPA
13. W polimerazie DNA III podjednostką odpowiedzialną za sprawdzenie poprawności procesu replikacji jest: podjednostka epsilon o aktywności 3' -> 5'
14. Typ replikacji zwany toczącym się kołem: inicjowany jest przez przecięcie jednego z łańcuchów rodzicielskiej kolistej cząsteczki DNA; zachodzi u faga lambda
15. U eukaryota w porównaniu z prokaryota: występuje więcej replikonów i fragmentów Okazaki
16. Liczba miejsc inicjacji u człowieka: wiele
17. Najczęstsza replikacja: semikonserwatywna
18. Gdzie zachodzi rekombinacja umiejscowiona: E.coli i bakteriofag lambda
19. Co robi ligaza: złącza krótkie fragmenty DNA
20. Geny podzielone na takie geny, w których występują odcinki kodujące łańcuch polipeptydowy i niekodujące występują u: Eukaryota
21. Przykładem tranzycji jest: A -> G
22. Topoizomeraza I: rozcina jedną nić podwójnej helisy DNA
23. E. coli ma miejsc inicjacji: 1
24. Stabilizacja struktury III niciowej DNA: Mg 2+
25. Zamiana kodonu kodującego aminokwas na kodon stop to mutacja: nonsens
26. Liczba puryn wynosi 80, z czego 25 to A. Ile jest cytozyny? odp. 55
27. Mutagenem działającym jak homolog zasad jest 5-bromouracyl/ 2-aminopuryna. Jest homologiem tyminy/ adeniny
28. Czego dotyczy deaminacja: A, G, C
29. Co to jest episom
30. Rysunek, na którym trzeba było wskazać, w którym miejscu zajdzie synteza nici opóźnionej

1. Zdanie prawdziwe dotyczące replikacji u prokariota
- białkiem inicjacyjnym jest DNA A
- w terminacji replikacji bierze udział białko Tus
- brak jest fragmentów Okazaki
2. Zdanie prawdziwe:
- telomeraza wydłuża końce chromosomów liniowych czyli telemerów
- -''- wydłuża tylko nic bogatą w C
- telomeraza w swojej cząsteczce ma matrycę RNA
3. za wiązanie polimerazy DNA Sigma do matrycy DNA podczas replikacji jest odpowiedzialny:
- PCNA
- RPA
- RPC
- FEN1
4. U bakterii terminacji jest możliwa dzięki:
- sekwencji telomerowej
- obecności sekwencji Ter
- spotkaniu się widełek replikacyjnych poruszających się w przeciwnych kierunkach
5. MtDNA jest replikowane według schematu:
- przemieszczającego się oczka
- obracającego się koła
- przemieszczającej się pętli
- modeli sigma
6. W cyklicznym odłączaniu polimerazy DNA od matrycy DNA podczas synetezy nici opóźnionej bierze udział:
- kompleks gamma
- podjednostka beta
- podjednostka tau
- rdzeń polimerazy
7. Helikazom u E. coli jest białko:
- DNA A, B, C czy G
8. Fałszywe zdanie:
- topoizomeraza typu II przecina obie nici DNA
- gyraza to przykład topoizomerazy I
- topoizomeraza IV rozdziela tzw. katenaty
- topoizomerazy tworzą z jednym z kw. DNA wiązanie fosfotyrozynowe (jakoś tak)
9. Strukturą natywną DNA jest
10. cechy prokariota : ma Hu, tworzy pętle i domeny
11. Fragment Okazaki składa się z DNA, RNA, DNA i RNA?
12. Prymosom co to jest
13. enzymy regulujące stopień skręcania DNA
14. inicjacja replikacji zaczyna się od miejsca bogatego w AT czy GC?
15. Co powstaje w wyniku przecięcia miejsca chi poziomo?
16. pętla D jest charakterystyczna dla
17. jaką rolę w strukturze Holliday'a odgrywa RuvA/RuvB
18. sekwencja Alu nalezy do
19. co jest skutkiem działania HNO3
20. co robi glikozydaza DNA
21. co powstaje w wyniku działania prom. UV?
22. liczba A jest 35% podaj liczbę pozostałych zasad
23. z czego składa się nukleotyd
24. co to jest nukleoid?
25. podaj odpowiednią kolejność - nukleosom>solenoid itd
26. na czym polega translokacji konserwatywna?
27. wirus HIV ulega
28. co nie należy do aberracji chromosomowych?
29. co to jest tranzycja?
30. Jaka jest najczęściej replikacja??

1czym zajmuje sie genomika -trzeba bylo podac odpowiedz nieprawdlowa: odpowedz byla zwiazana z lekami
2.co to jest transkryptom
3.była sekwencja Dna i trzeba bylo ja przepisac na sekwencje Rna
4byla podana liczba chyba guanin i ogolnej liczby pirymidyn i na podstawie tego obliczyc liczbe cytozyny
5. bylo pytanie o A-dna : ze jest antyrownolegle , lewoskretne zasady sa pod katem
6.ktore biaklo inicjuje replikacje dna u prokaryota
7. prawdziwe zdanie o troiniciowym dna rownoleglym : odp byla taka ze do nici komplementarnej przylacza sie homopirymidyna (chyba) i te wiazania sa typu hogenstena
8.co to jest nukleoid
9.ile replikonow jest u czlowieka
10.co to jest polimorfizm : zmiana sekwencji dna wystepujaca czesiej niz 1%
11.bylo pytanie o sekwebcjach rozproszonych i byyly podpunkty z wymienionymi LINE SINE
12. co ta sa mutacje genomowe: zmiana liczby chromosomow
13co to jest insercja
14. co to jest mutacja nonsens
15.jakie sa analogi zasad
16.jak oddzialuje cieplo na strukture dna
17. ktora ze struktur przy dlugosci fali 260 nm najabardziej pochalana swatlo : odp parwidlowa to mononukleozy

---