0208; 22.04.2009, wykład nr 8., - Apoptoza; Paul Esz
Fizjologiczna śmierć komórki (śmierć programowana) synonim apoptoza (apoptosis, od greckiego słowa - opadania liści, płatków kwiatu - Kerr w 1972 roku) Jest konsekwencją samobójczego programu genetycznego, uruchomianego w odpowiedzi na złożone oddziaływanie z innymi komórkami.
Najczęściej następuje naruszenie integralności 1 z 4 systemów wewnątrzkomórkowych
oddychania tlenowego
funkcjonowania błon komórkowych
enzymów i białek strukturalnych
naprawy aparatu genetycznego
Apoptoza Caenorhabditis elegans
Dorosły osobnik jest hermafrodytą i składa się z 959 komórek somatycznych.
Liczba komórek powstających - 1090.
W wyniku apoptozy ginie 131
131 umiera podczas embriogenezy
18 podczas dorosłego życia
Geny proapoptotyczne
ced-3 (ICE)
ced-4 (Apaf-1)
Feny antyapoptotyczne → brak apoptozy
ced-9 (bcl-2)
Genetyczne kontrola apoptozy
„ced” (cell death) geny śmierci są dobrze zachowane w procesie ewolucji
ekspresja genów ced-3 i ced-4 odpowiada za molekularne procesy apoptozy
„ced-9” (u ludzi bcl-2) - ekspresja w komórkach stymulowanych do proliferacji (między innymi limfocyty prawidłowe, komórki nowotworowe)
Różnice morfologiczne pomiędzy apoptozą, a martwicą
Apotoza |
Martwica |
|
|
Zmiany biochemiczne
Materiał genetyczny |
Apoptoza |
Martwica |
|
aktywacja specyficznych endonukleaz, fragmentacja, utworzenie odcinków o długości 200-300kb, 20-50 kb, 200-300 bp |
aktywacja niespecyficznych nukleaz, fragmentacja na odcinki o przypadkowej długości |
Rozdział elektroforetyczny |
Obraz drabinki Dna |
Obraz smugi (smear) |
Aktywacja enzymów |
kinaz białkowych (np. kinazy MAP) i fosfataz, nukleaz, kaspaz, kalpain |
niespecyficzna degradacja |
Białka regulacyjne |
Apoptoza;; białka rodziny Bel-2 (pro- i anty- apoptotyczne), inhibitory apoptozy (białka IAP), inhibitory kaspaz |
W niektórych przypadkach ekspresja Bel-2 |
Wymagania energetyczne |
Proces aktywny, zależny od ATP |
Proces bierny, niezależny od ATP |
Substraty |
Białka enzymatyczne o strukturalne |
Przypadkowe białka |
Inne |
Synteza poli(ADP-rybozy), synteza de novo mRNA i białek |
Brak syntezy białek |
Czynniki wywołujące apoptozę
hormony i cytokiny
deficyt czynników wzrostowych i troficznych
czynniki cytotoksyczne
czynniki fizyczne
Szlaki sygnałowe apoptozy
W zależności od rodzaju komórki i czynnika indukującego proces apoptozy może przebiega, rożnymi ścieżkami
Do najlepiej poznanych należą
szlak związany z błoną komórkową tzw. zewnętrzny
szlak wewnętrzny zwany mitochondrialnym
szlak angażujący perforyny i granzym B, czyli pseudoreceptorowy
Apoptoza może również odbywać się z udziałem szlaku sfingomielinowo-ceramidowego oraz indukowanego stresem.
Szlak zewnętrznych
pobudzenie receptorów śmierci należących do nadrodziny receptorów TNF np. Fas/CD95/Apol, TRAIL-R1 i R2/Apo2
receptory śmierci posiadają wewnątrzkomórkową domenę śmierci DD
po związaniu się odpowiedniego liganda z receptorem błonowym (TNF-alfa, FasL, TRAIL/Apo2L) dochodzi do oligomeryzacji receptora, a następnie powstaje kompleks DISC (death inducin singnaling caomplex)
kompleks ten powstaje poprzez połączenie domen śmierci z białkiem adaptorowym FADD oraz z prokaspazą 8
następuje aktywacja prokaspazy 8 (powstaje kaspaza 8), która jest bezpośrednim aktywatorem kaspazy 3 (kaspazy wykonawczej)
Szlak wewnętrzny
inicjowany poprzez
zmiany potencjału mitochondrialnego
mutacje DNA
inne zaburzenia metabolizmu komórkowego
Szlak ten może łączy się ze ścieżką receptorową zewnętrzną poprzez białko Bid, które ulega proteolizie - powstaje tBid (truncated Bid) - posta ta wpływa na uwalnianie cytochromu c - aktywacja szlaku mitochondrialnego
istotnym etapem jest uwolnienie cytochromu c z przestrzeni międzybłonowej poprzez specjalne kanały
kanały te tworzone są poprzez białka z rodziny Bel-2 (bax, bak) z bialekiem VDAC (voltage Dependent Anion Channel)
przez kanały mitochondrium do cytoplazmy dostaje się cytochrom c
wypływ cytochromu c jest sygnałem do tworzenia kompleksu zwanego apoptosomem
apoptosom skalda się z cytochromu c, prokaspazy 9, bialka Apaf-1 (ATP)
kompleks ten potrzebny jest do autoproteolizy kaspazy 9 , która następnie aktywuje kaspazę 3
podczas apoptozy z mitochondrium uwalniane są także białka Smac/Diablo o Omi/HTR A2 są one antagonistami inhibitorów apoptozy (IAP)
Szlak pseudoreceptorowy - indukowany przez cytotoksyczne limfocyty T oraz komorki NK - będzie jeszcze potem
Właściwości kaspaz - (będzie na ćwiczeniach jeszcze)
są to proteazy cysteinowe, substraty ich zawierają kwas asparaginowy w pozycji P1 (proteoliza w miejscu reszty Asp)
syntetyzowane są jako nieaktywne zymogeny
dotychczas zidentyfikowano 14 kaspaz
kaspozy inicjatorowe 2,8,9,10
kaspazy wykonawcze 3,6,7
kaspazy inicjatorowe posiadają „domeny śmierci” CARD i DED
kaspazy wykonawcze aktywują enzymy prowadzące do destrukcji komórek
Białka trawione przez kaspazy
większość tych białek uczestniczy w procesach molekularnych związanych z cyklem komórkowym i apoptozą
do proteolizy białek dochodzi przy udziale tylko kaspaz 3,6,7
Śmierć komórki niezależna od kaspaz
proteaza aktywowana wapniem kalpaina (kapalina), prawdopodobnie pełni autonomiczną rolę w apoptozie
ostatnie doniesienia wskazują na jej rolę w procesie aktywacji i unieczynnienia kaspaz 3,7,9, i ostatnio 12
Apoptoza w stanach patologicznych
Ograniczenie apoptozy prowadzi do powstania nowotworów i autoagresji komórek układu odpornościowego. Wzrost apoptozy jest charakterystyczny dla chorób zwyrodnieniowych: choroby Alzheimera, Parkinsona, AIDS, zawału serca czy udaru mózgu
Schemat