Laboratorium biotechnologii
Poniedziałek 8 15 - 12 00
Ćwiczenie 2
Biosynteza α-amylazy bakteryjnej w hodowli wstrząsanej
Wstęp teoretyczny
Hodowla wgłębna - prowadzimy ją zawsze w płynnym podłożu, wzrost drobnoustrojów odbywa się w całej masie podłoża. Zapewniaja jednakowy dostęp każdej komórki do tlenu, składników pożywki, jednakową temperaturę oraz pH w każdym punkcie. Pozwala na optymalne warunki wzrostu i wytworzenia produktu, co daje większą wydajność niż w metodzie powierzchniowej.
Zalety hodowli wgłębnych:
Łatwiejsze utrzymywanie czystości mikrobiologicznej
Lepszy kontakt drobnoustrojów
Lepsze natlenienie
Łatwiejsze wydzielenie produktu
Jednorodność warunków w całym podłożu
Większa możliwość automatyzacji
Większa wydajność
Wady:
Duży koszt aparatury
Większa energochłonność
Hodowla wstrząsana - typ hodowli wgłębnej, polega ona na ciągłym wstrząsaniu hodowli w czasie inkubacji. Wykorzystywana jest przede wszystkim jako hodowla kontrolna, do badania i powielania prób. Stanowi także etap namnażania materiału posiewowego, rzadko zaś jest hodowlą produkcyjną. Wyjściowym warunkiem w opracowaniu procesu produkcji enzymu jest znalezienie wysokowydajnego szczepu mikroorganizmów, co w praktyce technologicznej oznacza właściwe przygotowanie inokulum. Odbywa się to w kilku etapach:
Szczep na skosie -> kolba wstrząsana -> fermentor propagacyjny -> fermentor produkcyjny
Podstawowymi parametrami takiego procesu są:
pH środowiska
temperatura
stopień napowietrzenia
szybkość mieszania
Ze względu na szerokie spektrum zastosowania amylaz w przemyśle, enzymy te produkuje się na skalę przemysłową. W tym celu wykorzystuje się produkcję amylaz w różnorodnych kulturach bakteryjnych oraz grzybiczych. Bakteryjne amylazy są bardziej odporne na zmiany temperatury niż grzybicze.
Cel ćwiczenia
Celem ćwiczenia jest poznanie podstawowych operacji przygotowania i prowadzenia procesu biosyntezy enzymu w hodowli wgłębnej (wstrząsanej) drobnoustrojów oraz ocena wpływu wybranych parametrów (skład podłoża) na wydajność procesu.
Tabela
1. Tabela przedstawiająca grupowe wyniki doświadczenia
Numer grupy |
Stężenie laktozy w podłożu |
|||||||
|
0,5% |
1,0% |
2,0% |
3,0% |
||||
|
Aktywność |
Biomasa |
Aktywność |
Biomasa |
Aktywność |
Biomasa |
Aktywność |
Biomasa |
1 |
176 |
|
317 |
|
608 |
0,804 |
642 |
1,102 |
2 |
|
0,296 |
379 |
0,536 |
|
0,736 |
710 |
0,999 |
3 |
|
0,27 |
|
|
494 |
|
|
0,83 |
4 |
163 |
0,33 |
263 |
0,56 |
465 |
0,80 |
|
1,07 |
5 |
164 |
0,30 |
292 |
0,48 |
448 |
|
|
0,94 |
6 |
170 |
|
314 |
0,57 |
538 |
0,81 |
|
1,06 |
7 |
|
0,3 |
|
|
|
0,73 |
766 |
0,954 |
Metodyka
Oznaczenie aktywności α-amylazy
Wykorzystano ciecz po hodowli Bacillus licheniformis. Szczep uprzednio aktywowano i inkubowano przez 24 h w temperaturze 39°C.
Otrzymano 4 ciecze z następującą początkową zawartością laktozy w pożywce:
0,5%, 1%, 2%, 3%.
Dokonano następujących rozcieńczeń:
roztwór 0,5% rozcieńczono 100 razy
roztwór 1% rozcieńczono 200 razy
roztwór 2% rozcieńczono 400 razy
roztwór 3% rozcieńczono 400 razy
Do 5 probówek dodaliśmy po 0,5 ml 1% roztworu skrobi rozpuszczalnej. Następnie do 4 probówek dodaliśmy po 0,5 ml cieczy rozcieńczonych (z enzymem), a do ostatniej dodaliśmy 0,5 ml wody destylowanej (próba kontrolna). Próby inkubowaliśmy 3 minuty w temperaturze pokojowej, po czym dodaliśmy do każdej po 1 ml kwasu 3,5-dinitrosalicylowego (DNS). Następnie próby inkubowaliśmy przez 5 minut we wrzącej łaźni wodnej. Po inkubacji objętość probówek uzupełniliśmy do objętości 10 ml (dodano po 8 ml wody destylowanej). Zmierzyliśmy absorbancję tak przygotowanych roztworów (dł. fali 540 nm), a następnie za pomocą krzywej wzorcowej obliczyliśmy aktywność enzymu.
Aktywność enzymu ma być podana w µmolach grup redukujących (w przeliczeniu na maltozę) uwolnionych z substratu (1% roztworu skrobi) w ciągu 1 minuty przez 1 ml preparatu enzymatycznego [µmol/min*ml], czyli U/ml.
Tabela 2. Zbliżone wartości absorbancji aktywności enzymu
Zawartość laktozy w pożywce [%] |
0,5 |
1 |
2 |
3 |
Absorbancja A540 |
||||
gr. I |
0,44 |
0,396 |
0,38 |
0,401 |
gr. II |
|
0,473 |
|
0,444 |
gr. III |
|
|
0,309 |
|
gr. IV |
0,408 |
0,329 |
0,291 |
|
gr. V |
0,41 |
0,365 |
0,28 |
|
gr. VI |
0,425 |
0,3925 |
0,336 |
|
gr. VII |
|
|
|
0,478 |
Następnie zgodnie z definicją podaną wyżej obliczono aktywność wg wzoru:
A= A540 * 2 * R /( t * a)
A540 - absorbancja mierzona wobec próby kontrolnej przy 540 nm
2 - przeliczenie na 1ml enzymu
R - rozcieńczenie płynu pohodowlanego
t - czas reakcji enzymatycznej - 3 minuty
a - współczynnik kierunkowy krzywej wzorcowej (0,1689ml/µmol)
Przykład obliczeniowy dla gr.7, 0,5% laktozy:
A 0,5% = 0,508*2*100/(3*0,1689) = 115,45 = 115 (µmol/min*ml)
Wyniki zebrano w tabeli 3 oraz obliczono średnie aktywności dla poszczególnych zawartości laktozy w pożywce:
Tabela 3. Obliczone aktywności enzymu
Zawartość laktozy w pożywce [%] |
0,5 |
1 |
2 |
3 |
Aktywność [µmol/min*ml] |
||||
gr. I |
174 |
313 |
600 |
634 |
gr. II |
|
374 |
|
701 |
gr. III |
|
|
487 |
|
gr. IV |
161 |
260 |
459 |
|
gr. V |
162 |
288 |
442 |
|
gr. VI |
168 |
310 |
531 |
|
gr. VII |
|
|
|
756 |
Średnia* |
166 |
309 |
504 |
697 |
Oznaczenie wzrostu biomasy.
Wzrost szczepu można określić za pomocą metody pośredniej (uproszczonej). Wykonaliśmy to przez pomiar zmętnienia zawiesiny hodowlanej (cieczy pohodowlanej) po rozcieńczeniu pobranej próbki w stosunku 1:20. Pomiar wykonaliśmy się na spektrofotometrze przy długości fali λ=535 nm, stosując jako próbę kontrolną wodę.
Tabela 4. Wyniki pomiaru wzrostu biomasy
Zawartość laktozy w pożywce [%] |
0,5 |
1 |
2 |
3 |
Ekstynkcja E535 |
||||
gr. I |
|
|
0,800 |
1,102 |
gr. II |
0,296 |
0,536 |
0,736 |
0,999 |
gr. III |
0,270 |
|
|
0,850 |
gr. IV |
0,330 |
0,560 |
0,800 |
1,070 |
gr. V |
0,300 |
0,480 |
|
0,948 |
gr. VI |
|
|
0,810 |
1,060 |
gr. VII |
0,300 |
0,470 |
0,730 |
0,954 |
Średnia* |
0,299 |
0,512 |
0,775 |
0,998 |
|
Biomasa |
0,5 % laktozy |
5,98 |
1 % laktozy |
10,24 |
2 % laktozy |
15,5 |
3 % laktozy |
19,96 |
Zmierzone wartości pomnożono przez 20 (współczynnik wynikający z rozcieńczenia prób)
Tabela 5. Wartość ilości biomasy
Wykres zależności stężenia laktozy na produkcję biomasy i aktywności α-amylazy
Wnioski:
Otrzymane prawidłowe wyniki pokazują że zwiększanie stężenia laktozy powoduje do pewnego momentu wzrost aktywności enzymu. Najwyższą wartość aktywności α-amylazy wykazano przy 2% zawartości laktozy po jej przekroczeniu zaobserwowano spadek aktywności enzymu. Optymalnym stężeniem laktozy dla działania α-amylazy jest wiec ta wartość, lecz nie możemy bardziej dokładniej wyznaczyć tą daną z uwagi na spektrum dobranych stężeń. Zależność tę obrazują tylko wyniki grupy 8, w reszcie grup wyniki są nieprawidłowe. Wyniki otrzymano zawyżone, jednak są one najbardziej zbliżone do idealnej zależności. Badanie wzrostu biomasy wykazuję że ze zwiększeniem stężenia laktozy wzrasta także zmętnienie cieczy pohodowlanej.