WYKŁAD 7
BIOSYNTEZA LIPIDÓW:
Lipidy pełnią funkcje zapasowe, strukturalne (wchodzą w skład komórkowej), sygnalizacyjne (między komórkami, między organizmami).
To, że lipidy nie rozpuszczają się w wodzie wynika z hydrofobowości lipidów, a ta wynika z powtarzających się układów grup metylowych (polimetylenowe, łańcuchoweukłady alifatyczne, głównie występujące w kwasach tłuszczowych i ich pochodnych) lub -lipidy prenylowe - powtarzanie się rozgałęzionych, 5-ciowęglowych jednostek.
Mówiąc o biosyntezie lipidów należy rozważyć kwestię jak powstają kwasy tłuszczowe - to one są pierwotnymi substancjami zawierajacymi powtarzające się układy grup metylenowych ułożone liniowo i jak powstaje element strukturalny zwany czynną jednostką pięciowęglową, z której składane są różne związki terpenoidowe.
KWASY TŁUSZCZOWE:
W najbardziej ogólnym ujęciu: synteza kwasów tłuszczowych jest odwróceniem katabolizmu kwasów tłuszczowych.
┌acylo-CoA
KT n acetylo-CoA
└CoA-SH
└ (n-1)CoA-SH
W katabolizmie KT ulegają rozkładowi do n cząsteczek acetylo-CoA (kwas tłuszczowy musi być zaktywowany stąd acylo-CoA, który w wyniku β-oksydacji ulga rozpadowi na dwuwęglowe fragmenty - reszty kwasu octowego połączone z CoA).
W biosyntezie KT z n cząsteczek acetylo-CoA powstają łańcuchy KT i reszty acetylowe (sytuacja jak z glikolizą i glukoneogenezą: niedokładnie odwrócenie reakcji).
Najpierw trzeba rozpatrzyć pochodzenie reszt acetylowych związanych z CoA, które są niezbędne do syntezy KT.
Reszty te moga się brać z metabolizmu cukrowców - kwas pirogronowy ulega osydacyjnej dekarboksylacji w wyniku czego powstaje acetylo-CoA.
Szkielety węglowe szeregu aminokwasów mogą ulegać przekształceniu do acetylo-CoA.
Innym możliwym źródłem jest β-oksydacja kwasów tłuszczowych, ale bez sensu byłoby równoczesnie degragować kwasy tłuszczowe i je syntetyzować, tym bardziej, że na przykładzie glikolizy i glukoneogenezy przekonaliśmy się, że zwykle odpowiedni proces anaboliczny (proces biosyntezy) jest energetycznie znacznie kosztowniejszy od procesu degradacji (od tego, co można uzyskać w procesie degradacji).
Są pewne mechanizmy zabezpieczające, regulacyjne, które nie pozwalają na to, aby równocześnie w komórce zachodziły procesy rozpadu KT i proces biosyntezy.
Główne źródła reszt acetylo-CoA: szkielety węglowe aminokwasów i metabolizm cukrowców.
Trzoda chlewna (szczególnie w Polsce) karmiona jest w dużej mierze ziemniakami (ziemniaki to przede wszystkim skrobia, a białek i tłuszczów jest bardzo niewiele). Świnie przybierając na wadze mają przyrost tkanki tłuszczowej. Skrobia jest przekształcana w zapasowe tłuszcze. Skrobia ulega hydrolizie do glukozy, glukoza wchodzi w glikolizę, z glikolizy powstaje pirogronian, który przkształca się w acetylo-CoA, który może posłużyć jako prekursor do biosyntezy kwasów tłuszczowych.
Procesy, zktórych pochodzi większość acetylo-CoA zachodzą głównie na terenie mitochondrium (β-oksydacja→reakcja pomostowa, wiążąca glikolizę i cykl kwasu cytrynowego) - przynajmniej jeśli chodzi o wyższe organizmy, o zwierzęta.
Acetylo-CoA nie ma w błonie mitochondrialnej nośnika, który pozwalałby na jego eksport do cytoplazmy, a tam właśnie zachodzą wszystkie dalsze reakcje biosyntezy KT. Dlatego musi istnieć mechanizm, który pozwala na to aby reszty acetylowe mogły być przenoszone z matrix mitochondrialnej do cytoplazmy.
Ponieważ acetylo-CoA nie ma możliwości penetrowania swobodnego przez błonę wewnętrzną mitochondrialną (nie ma nośnika) wykorzystywana jest reakcja, która jest reakcją zapoczątkowującą cykl Krebsa: szczawiooctan reaguje z resztą acetylową przeniesioną przez CoA , w wyniku czego powstaje cytrynian (reakcja katalizowana przez syntazę cytrynianiową). Cytrynian jest eksportowany na teren cytoplazmy, ponieważ w wewnętrznej błonie mitochondrialnej istnieje specjalny nośnik dla cytrynianu i innych trikarboksylowych kwasów.
Cytrynian, który zostanie przetransportowany na teren cytoplazmy ulega rozpadowi do szczawiooctanu i acetylo-CoA, ale przy udziale zupełnie innego enzymu. Reakcja powstawania cytrynianu jest energetycznie korzystna,a reakcja jego rozpadu jest niekorzystna, więc konieczny jest udział ATP jako dawcy energii. Działa enzym zwany ATP-zależną liazą cytrynianową. Liazy to enzymy, które rozszczepiają wiżanie C-C, w wyniku czego sześciowęglowa cząsteczka cytrynianu jest rozszczepiana na szczawiooctan i resztę acetylową, która jest wiązana z CoA.
Gdyby cytrynian był transportowany do cytozolu, to pula szczawiooctanu uczestniczącego w cyklu Krebsa. Jest więc specjalny mechanizm, który pozwala na odtworzenie szczawiooctanu.
Szczwiooctan, który powstaje w reakcji katalizowanej przez ATP-zależną liazę cytrynianu jest przekształcany do jabłczanu - jest redukowany przez zależną od NADH dehydrogenazę jabłczanową do jabłczanu (jedna z reakcji cyklu Krebsa, może zachodzić też na terenie cytoplazmy - jest specjalna cytoplazmatyczna forma dehydrogenazy jabłczanowej). jabłczan (4węglowy, dikarboksylowy, hydroksykwas) w wyniku działania enzymu jabłczanowego zależnego od NADP+ ulega dekarboksylacji z równoczesnym utlenianiem do α-ketokwasu trójwęglowego - pirogronianu. Ta reakcja jest ważnym źródłem NADPH (jest reduktorem wykorzystywanym np. do biosyntezy KT). Drugim ważnym źródłem jest szlak pentozofosforanowy.
Pirogronian ma swój nośnik w błonie mitochondrialnej, może przenikać na teren matrix i tu działa enzym karoksylaza pirogronianowa (rozpoczyna ona glukoneogenezę) - karboksyluje przy udziale ATP pirogronian do szczawiooctanu - cykl się zamyka. Pula szczawiooctanu wewnątrzmitochondrialnie ulega zubożeniu.
Wszystkie następne reakcje prowadzące od cząsteczek acetylo-CoA do KT odbywają się na terenie cytoplazmy.
ŹRÓDŁO ACETYLO-CoA:
Pierwszym co musi zajść to jest swoista aktywacja acetylo-CoA (dodatkowa aktywacja cząsteczek acetylo-CoA).
Karboksylaza acetylo-CoA przyłącza CO2 (w środowisku komórkowym wsytępują raczej jony węglanowe niż wolny CO2) na koszt ATP - karboksylacja acetylo-CoA. Powstaje trójwęglowa reszta związana z CoA zwana malonylo-CoA (pochodna kwasu malonowego, dikarboksylowy, trójwęglowy kwas). Ta reakcja w pewnym sensie aktywuje atom węgla, w wyniku czego ułatwia kondensację dwuwęglowych reszt w dalszych etapach biosyntezy KT.
W przypadku karboksylazy acetylo-CoA (podobnie jak w przypadku wielu innych karboksylazy np.pirogronianowej) koenzymem jest niskocząsteczkowy związek zwany biotyną.
Cząsteczka biotyny wiąże się z grupą dodatkową (ε-aminową) cząsteczki Lys, która wchodzi w skład łańcucha polipeptydowego odpowiedniego enzymu, czyli karboksylazy acetylo-CoA. Tworzy się wiązanie amidowe pomiędzy grupą karboksylową biotyny a grupą aminową znajdującą się w łańcuchu lizyny wchodzącej w skład białka enzymatycznego.
W pierwszym etapie następuje przy udziale ATP jako źródła energii przeniesienie grupy karboksylowej na atom azotu w układzie heterocyklicznym biotyny, w wyniku czego powstaje karboksybiotyna która przerzuca grupę -COOH na acetylo-CoA, w wyniku czego powstaje malonylo-CoA.
STRUKTURA KOMPLEKSU SYNTEAZY KWASÓW TŁUSZCZOWYCH (E.coli):
Biosynteza KT u E. Coli (i innych prokariontów): w biosyntezie długiego łańcucha z prostych prekursorów cząsteczek acetylo - i malonylo-CoA uczestniczy kompleks enzymatyczny. Składa się z 6 odrębnych enzymów, tworzących pewną fizyczną całość i z pewnego nieenzymatycznego białka - białko ACP (białko transportujące acyl).
Białko ACP jest małe (niektórzy kwalifikują je do polipeptydów). Jest ono nośnikiem struktury, która jest przyłączona do grupy OH jednej z reszt seryny, która wchodzi w skład ACP. Ta striktura to ramię kwasu fosfopantotenowego jaki występuje w koenzymie A. Czyli jest to struktura analogiczna do struktury występującej w koenzymie A.
Koenzym A: adenina, ryboza, 2 reszty kwasu ortofosforowego w pozycji 5 i jedna reszta dodatkowa w pozycji 3, ugrupowanie pantotenianowe.
W przypadku grupy prostetycznej białka ACP - nie ma elementu nukleotydowego tylko poprzez resztę fosforanową reszta fosfopantotenianowa przyłączona jest do grupy OH seryny z białka ACP.
Można powiedzieć, że ta grupa prostetyczna jest analogiczna do podobnej grupy występującej w CoA (również jest reaktywna grupa SH, która jest w stanie tworzyć z kwasami wiązanie tioestrowe).
Jedno z 6 białek enzymatycznych - enzym kondensujący zawiera szczególną resztę cysteiny, gdzie w łańcuchu bocznym występuje grupa SH.
Obie grupy SH odgrywają ogromną rolę w procesie biosyntezy KT, składania cząsteczek prostych w długie łańcuchy KT.
Grupa SH związana ACP przez ramię fosfopantotenianowe nazywana jest grupą centralną, a grupa związana z resztą cysteiny grupą peryferyjną, peryferyczną.
Najpierw dziła jeden z 6 enzymów zwany acetylotransferazą, który z acetylo-CoA bierze resztę acetylową i przenosi ją na grupę centralną SH (kosztem wiązania tioestrowego, które ulega ropadowi, powstaje nowe wiązanie tioestrowe pomiędzy centralną grupą SH z resztą acetylową).
Następnie ten sam enzym katalizuje reakcję wymiany - reszta jest wewnętrznie przesuwana na peryferyczną grupę SH, grupa centralna zostaje uwolniona.
Następnie działa enzym zwany malonylotransferaza, która również przenosi resztę, ale nie acetylową, tylko resztę kwasu malonowego (resztę malonylową) na centralną grupę SH; CoA jest uwalniany
następny etap reakcji odbywa się przy udziale enzymu kondensującego, który powoduje dekarboksylację reszty kwasu ……………………………………………………………… ……………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………………
grupa acetylowa z enzymu kondensującego jest przez ten enzym przerzucona na grupę centralną, w wyniku czego powstaje układ czterowęglowy - reszta kwasu acetooctowego (grupa acetoacylowego).
Następnie jest ciąg reakcji, które są w istocie rzeczy odwróceniem tego, co się dzieje w β-oksydacji.
Ten ciąg reakcji jest prawie dokładnym odwróceniem tego, co się dzieje w procesie β-oksydacji kwasów tłuszczowych. Tylko tam mamy do czynienia nie z redukcją a utlenieniem, nie z odwodnieniem a z hydratacją i z drugą reakcją utlenienia. Utleniaczami w β-oksydacji są FAD i NAD+, a tu reduktorem jest NADPH.
Zachodzi redukcja: działa reduktaza β-ketoacylo-ACP wykorzystująca jako reduktor: NADPH (wykorzystywany w procesach redukcyjnych w biosyntezie wielu substancji). Redukowana jest grupa ketonowa do grupy alkoholowej (w pozycji 3).
następnie zachodzi reakcja odwodnienia - usunięcia cząsteczki wody (bardzo często spotykany typ reakcji w biochemii). Między dwoma atomami węgla powstaje podówjne wiązanie. Powstaje krotonylo-ACP (pochodna kwasu krotonowego, nienasyconego, 4węglowego kwasu). Enzym katalizujący tę reakcję to dehydrogenaza 3-hydroksyacylo-ACP.
Następuje kolejna redukcja, w wyniku czego podwójne wiązanie jest redukowane przy udziale również cząsteczki NADPH i powstaje 4węglowa reszta nasyconego kwasu masłowego - reszta butynylowa (butynylo-ACP).
Grupa peryferyczna jest związana z enzymem kondensującym jest wolna, natomist grupa centralna, związana z białkiem ACP jest połączona z resztą kwasu masłowego (z resztą butynylową).
Znów mamy przeniesienie reszty wewnątrz kompleksu z grupy centralnej na grupę peryferyczną; grupa centralna jest uwolniana;
działa malonylotransferaza, która do grupy centralnej przyłącza resztę kwasu malonowego z malonylo-CoA, w wyniku czego powstaje taka sytuacja, że do grupy peryferycznej mamy przyłączoną resztę butynylową do reszty centralnej - grupa malonylowa (resztę malonylową).
Działa enzym kondensujący (podobnie jak poprzednio), który powoduje, że cała reszta butynylowa przenoszona jest na atom węgla reszty kwasu malonowego, zrównoczesną dekarboksylacją grupy COO-.
Powstaje struktura 6-węglowa, zachodzi ten sam ciąg reakcji, co przed chwilą.
Znów zachodzi: redukcja, odwodnienie, redukcja, w wyniku czego powstaje reszta sześciowęglowego, nasyconego kwasu tłuszczowego.
Proces będzie powtarzał się cyklicznie tak długo, aż powstanie kwas tłuszczowy o długości najczęściej 16 atomów węgla (reszta kwasu palmitynowego).
Większość syntaz kwasów tłuszczowych kończy swoje działanie w momencie kiedy uformowana zostanie reszta kwasu palmitynowego. Kwas palmitynowy jest jednym z wielu KT występujących w różnych lipidach, w związku z tym, z tego kwasu palmitynowego muszą wtórnie powstać inne KT. Dzieje się to tak, że działają odrębne enzymy - elonyazy kwasów tłuszczowych, które wydłużają łańcuchy kwasu palmitynowego kolejno o 2 atomy węgla - w ten sposób z kwasu palmitynowego może powstać kwas stearynowy, z niego kwas behenowy. Oprócz tego, działają tzw. desaturazy - enzymy, które wprowadzają podwójne wiązania, w wyniku czego np. z kwasu stearynowego może powstawać kwas oleinowy, a potem linolowy.
Wystęująca w naturze KT są z reguły parzystowęglowe bo ulegają składaniu z dwuwęglowych elementów; uczestniczy tam kwas malonowy ale on powstaje tylko przejściowo, potem następuje jego dekarboksylacja, przyłączanie grupy karboksylowej do acetylo-CoA jest swego rodzaju aktywacją tego atomu węgla, który później wchodzi w reakcję w związku z wydłużaniem łańcucha KT
PODSUMOWANIE:
cząsteczka acetylo-CoA, która służy jako starter do wydłużenia reszty KT reaguje z 7 cząsteczkami malonylo-CoA, w wyniku czego powstaje reszta kwasu palmitynowego; ponieważ musi zajść 7 cykli wydłużania i obróbki powstającego łańcucha, więc potrzebne jest 14 cząsteczek NADPH na jedną powstającą cząsteczkę palmitynianu (C16) - 7 kolejnych procesów dołączania jednostek dwuwęglowych.
Malonylo-CoA powstaje z acetylo-CoA, więc gdyby uwzględnić tą reakcję wstępną, reakcję powstawania malonylo-CoA, to tak naprawdę z 8 reszt acetylo-CoA, przy udziale 7 cząsteczek ATP, 14 NADPH powstaje jedna cząsteczka palmitynianu, 14 cząsteczek utlenionej formy NADP, 8 cząsteczek CoA, 7 cząsteczek ATP, które wchodząc w reakcję rozpada się na 7 ADP i 7 Pi.
U GRZYBÓW:
Mamy do czynienia nie z kompleksem złożonym z 7 defacto białek (ACP+6 białek enzymatycznych) tylko z 2 łańcuchami polipeptydowymi. Z tym, że jeden z tych łańcuchów polipeptydowych zawiera 3 aktywności enzymatyczne oraz odpowiednik białka ACP w obrębie 1 łańcucha. Drugi łańcuch zawiera 3 inne enzymy konieczne do tego, żeby zaszła reakcja. Nie ma takiego rozbudowanego kompleksu enzymatycznego jak u E. coli tylko dimer, gdzie pewne aktywości enzymatyczne występują w obrębie jednego łańcucha polipeptydowego - heterodimer, w którym są enzymy (aktywności enzymatyczne). Związane z kolejnymi etapami powstawania KT pogrupowanych.
U KRĘGOWCÓW:
też dimer, ale homodimer - 2 identyczne łańcuchy, które zawierają (każdy z nich) wszystkie niezbędne enzymy, potrzebne do powstawania KT (aktywności enzymatyczne)+ coś co jest odpowiednikiem białka ACP. Działa to jako dimer. Konieczne jest, aby dwa takie łańcuchy współdziałały z sobą. Ewolucyjne upraszczanie się sytuacji.
POWSTAWANIE TRIACYLOGLICEROLI-zapasowych cząsteczej tłuszczowych
Żeby powstały traicyloglicerole potrzebny jest glicerol - w tym procesie wykorzystywana jest ufosforylowana postać glicerolu - 3-fosfoglicerol. Może on bardzo łatwo powstać z fosfodihydroksyacetonu, który powstaje np. w glikolizie w wyniku redukcji. 3-fosfoglicerol jest biorcą reszt kwasów tłuszczowych z acylo-CoA.
Działają enzymy zwane acetylotransferazami - najpierw następuje przeniesienie reszty kwasu tłuszczowego z acylo-CoA na 1o grupę alkoholową, w wyniku czego powstaje kwas lizofosfatydowy.
Następnie działa inna acetylotransferaza, o nieco innej (na ogół) specyficzności, w wyniku czego do drugiej grupy OH w kwasie lizofosfatydowym przyłączana jest kolejna reszta kwasu tłuszczowego z wykorzystaniem acylo-CoA jako donora reszty acylowej. Powstaje kwas fosfatydowy. Jest on ważny nie tylko na drodze biosyntezy zapasowych triacylogliceroli ale również strukturalnych fosfolipidów.
Działa fosfataza, w wyniku czego następuje odszczepienie reszty kwasu ortofosforowego, który występuje w pozycji 3 kwasu fosfatydowego. Powstaje cząsteczka diacyloglicerolu (glicerol w dwóch pozycjach połączony z kwasami tłuszczowymi).
Działa trzecia acylotransferaza wykorzystująca acylo-CoA jako źródło reszt acylowcyh przyłączając do wolnej grupy OH kolejną resztę jwasu tłuszczowego.
Te trzy różne acylotransferazy charakteryzują się odmienną specyficznością w stosunku do kwasu tłuszczowego - jego długości i stopnia nienasycenia. U różnych organizmów jest charakterystyczny wzór, że np. w pozycjach centralnych przeważają kwasy nienasycone, a w pozycjach zewnętrznych - kwasy nasycone. Tłumaczy się to specyficznością odpowiednich acylotransferaz w stosunku do odpowiednich acetylo-CoA.
[………………] jest ważny jako metabolit pośredni na drodze biosyntezy glicerofosfolipidów, które (?) stanowią najważniejsze (ilościowo) ekementy strukturalne błon komórkowych.
BIOSYNTEZA GLICEROFOSFOLIPIDÓW:
ogólny wzór glicerofosfolipidu błonowego
→ reszta glicerolu połączona z dwiema resztami kwasów tłuszczowych; przy węglu 3 jest kwas ortofosforowy a do niego przyłączony jest jakiś alkohol (coś co zawiera grupę OH). Tym związkiem o charakterze alkoholu (związkiem hydroksylowym) może być:
seryna (hydroksyaminokwas) - mówimy o fosfatydyloserynie
reszta etanoloaminy - mówimy o fosfatydyloetanoloaminie
podstawiona grupami metylowymi reszta fosfatydyloetanoloaminy to będziemy mieli resztę choliny - fosfatydylocholina (najważniejsza ilościowo wśród glicerofosfolipidów błonowych)
elementem hydroksylowym może być jeszcze np. inozytol, dodatkowa cząsteczka glicerolu.
Wszystko zaczyna się od kwasu fosfatydowego, który powstaje analogicznie jak w syntezie triacylogliceroli. Reaguje on z cytydynotrifosforan (CTP), w wyniku czego powstaje CDP-diacyloglicerol i pirofosforan. (Reakcja ta bardzo przypomina reakcję syntezy nukleotydocykrów).
W cząsteczce CTP następuje rozerwanie wiązania, w wyniku czego reszta uwalniana jest w postaci pirofosforanu a powstała całość - cytrynomonofosforan (CMP) przenoszona jest na resztę kwasu ortofosforowego w kwasie fosfatydowym, w wyniku czego powstaje wiązanie bezwodnikowe między resztą fosforanową kwasu fosfatydowego a resztą fosforanową pochodzącą z CTP. Powstaje CDP-diacyloglicerol, który można traktować jako aktywną postać kwasu fosfatydowego. Można powstały związek traktować jako CMP-pochodną kwasu fosfatydowego.
Ta reakcja jest łatwo odwracalna. Powstający pirofosforan jest rozszczepiany hydrolitycznie przez nieorganiczną pirofosfatazę, w wyniku czego usuwany produkt ze środowiska reakcji powoduje bardzo efektywne napędzanie reakcji ze strony lewej na prawą. Nawet przy niewielkich stężeniach kwasu fosfatydowego i CTP reakcja będzie efektywnie zachodziła w prawą stronę.
CDP-diacyloglicerol jest wykorzystywany jako dawca reszty kwasu fosfatydowego, co w reakcji z seryną daje fosfatydyloserynę, natomiast reszta zawierająca cytozynę jest odszczepiana w postaci CMP (w jego miejsce jest przyczepiana reszta seryny przez grupę OH).
Fosfatydyloseryna jeżeli ulegnie dekarboksylacji, to powstanie reszta etanoloaminy. Następnie jeśli zajdzie metylacja atomu azotu, przy udziale specjalnych metylotransferaz to powstanie cząsteczka fosfatydylocholina.
Jedna z dróg znanych syntezy ważnych glicerofosfolipidów. Znane są również inne drogi.
BIOSYNTEZA LIPIDÓW PRENYLOWYCH:
kluczową sprawą jest powstawanie 5-cio węglowych, rozgałęzionych jednostek
związki prenylowe składane są z 5-cio węglowych jednostek („czynnych” jednostek).
Pierwotnym prekursorem jest acetylo-CoA, który ulega kondensacji z drugą resztą actylową w wyniku czego, w łatwo odwaracalnej reakcji powstaje acetoacetylo-CoA (40węglowy ketokwas, pochodna kwasu acetooctowego).
Następuje kolejne przyłączenie reszty acetylowej, również przenoszonej przez koenzym A, ale ta reakcja będzie przebiegać trochę inaczej niż poprzednia, ponieważ nie zachodzi liniowe wydłużenie cząsteczki z 4-węglowej do 6-węglowej, a powstanie układu rozgałęzionego. Enzym, który katalizuje tą reakcję (przyłączenie trzeciej reszty acetylowej) działa podobnie jak syntaza cytrynianowa - jeden z atomów wodoru grupy CH3 reszty acetylowej jest przenoszony na grupę C=O, w wyniku czego powstaje grupa OH,a przy tym samym atomie węgla przyłączana jest reszta pozostała. Powstaje 3-hydroksy-3-metyloglutarylo-CoA---> glutarylo-, bo 5-węglowy, dikarboksylowy kwas nazywany jest kwasem glutarowym, a w pozycji 3 tego kwasu jest grupa metylowa i hydroksylowa. Związek, który powstaje z 3 reszt acetylowych jest związkiem 6-węglowym (a my potrzebujemy).
W następnym etapie działa enzym zwany reduktazą HMG. Enzym ten odszczepia koenzym A i grupa karboksylowa, która się przez to ujawnia jest redukowana poprzez aldehyd do alkoholu. Z grupy karboksylowej, po odszczepieniu CoA powstaje 1o grupa alkoholowa. Reakcja zachodzi dwuetapowo, więc potrzebne są 2 cząsteczki NADPH. Powstaje kwas mewalonowy, a właściwie jego anion - mewalonian.
Następnie zachodzi kilka reakcji, w których sumarycznie: zachodzi dekarboksylacja (katalizowana przez dekarboksylazę), następnie zachodzi ufosforylowanie 1o grupy alkoholowej przez dwie odrębne, osobno działają kinazy wykorzystujące ATP jako źródło reszt fosforanowych, w wyniku czego grupa CH2OH zostaje podwójnie ufosforylowana. Zachodzi jeszcze eliminacja cząsteczki wody, w wyniku czego powstaje podwójne wiązanie między dwoma atomami węgla. Powstaje w efekcie „czynna” jednostka 5-węglowa; dokładna nazwa to pirofosforan izopentenylu (IPP). Ten związek i jego izomer pirofosforan dimetyloallilu, związek, który różni się tylko umiejscowieniem wiązania podwójnego (DMAPP), służą do składania różnych związków terpenoidowych.
IPP kondensuje z DMAPP, w wyniku czego powstaje pirofosforan geranylu (związek dziesięciowęglowy).
GPP, jeśli przyłączy się kolejna reszta IPP przekształca się w piętnastowęglowy pierofosforan farnezylu (FPP) a jeżeli dojdzie jeszcze jedna reszta IPP to powstaje dwudziestowęglowy związek zwany gerano-geronylo pirofosforanem (GGPP).
Te związki są prekursorami całej licznej rodziny związków terpenoidowych.
Związek C20, (GGPP), może ulegać dalszemu wydłużaniu przez przyłączanie kolejnych cząsteczek IPP, reszt izopentenylowych, w wyniku czego powstają długie polimery, np. kauczuk. Związki powstające po drodze mogą w wyniku różnych procesów przekształcać się w odpowiednie terpenoidy.
GPP w wyniku cyklizacji cząsteczek, hydroksylacji, różnych obróbek przekształca się w wcałą rodzinę związków zwanych monoterpenami. Wiele z tych związków ma intensywny zapach - zapachy różnych kwiatów.
Seskwiterpeny (również zapachy) - również związki lotne.
FPP jest również bardzo ważny, bo 2 cząsteczki FPP jeśli się z sobąpołączą, to powstaje układ C15-C15
->łącznie C30; w ten sposób powstaje związek zwany skwalenem, który jest prekursorem wszystkich triterpenów, w tym cholesterolu.
Analogicznie: dwudziestowęglowy pirofosforan geranylogeranylu jeśli ulegnie podobnej kondensacji to powstanie układ C20-C20. Pierwotnie powstający związek zwany jest fitoenem i jest to prekursor wszystkich związków karotenoidowych.
Żeby powstały karotenoidy to muszą zachodzić liczne reakcje, jak np. wprowadzanie nowych podwójnych wiązań, redukcja starych wiązań podwójnych, dodatkowe wprowadzenie funkcji tlenowych.
Ocenia się, że w tej chwili znamy kilkadziesiąt tysięcy różnych związków terpenoidowych, głównie są to metabolity roślinne, zaliczane do grupy wtórnych metabolitów roślinnych. Ogromna część związków terpenoidowych odgrywa bardzo ważną funkcję w różnych procesach, np.
cholesterol - składnik błon, substancja wyjściowa do syntezy substancji hormonalnych (hormonów sreroidowych)
karotenoidy są ważnymi pomocniczymi barwnikami fotosyntetycznymi mono i seskwiterpeny to głównie związki o charakterze zapachowym, aromatycznym, nadające zapach kwiatom.
Reszty izoprenoidowe występują w niektórych ważnych związkach jak np.
ubichinon - susbtancja, która uczestniczy w łańcuchu oddechowym
plastochinon - również zawiera długi łańcuch izoprenoidowy, uczestniczy w fazie jasnej fotosyntezy.
1