Ćwiczenie 2
Przygotowanie reakcji PCR ze starterem specyficznym
Składniki jednej reakcji (jedna oróbkaY:
-12,3 |U H2O
- 2,0 |il 10 x bufor do PCR
- 2,0 (ii MgCl2 [25 mM]
- 0,5 fil dNTP [10 mM]
- 0,5 jd staiter-forward [10 pM] - ql8SRNA-fl
- 0,5 (ii starter-reyerse [10 pM] - ql8SRNA-rl
- 0,2 pl enzym Taq polimeraza [5U/ pl]
- 2 pi DNA rozcieńczone Z = 20pl
Wykonanie:
- Wszystkie składniki reakcji należy po wyjęciu z zamrażarki i rozmrożeniu zworteksować i żwirować;
- dodawać kolejno w podanych objętościach do probówek do PCR;
WAŻNE!!! Polimerazę Taq trzymamy cały czas lodzie
- po umieszczeniu wszystkich składników reakcji w probówce, mieszaninę reakcyjną należy zworteksować i żwirować;
- umieścić probówkę z mieszaniną reakcyjną w aparacie do amplifikacji DNA (termocykler); Program reakcji PCR:
1. 94^-5 min,
2. 92°C - 45 sek.; 57°C - 45 sek, 72°C - 2 min. [35 cykli]
3. 72°C - 10 min.
4. 4°C - ®
Po zakończonej reakcji amplifikacji próbki można od razu poddać elektroforezie w żelu agarozowym lub przechować w zamrażarce (-18°C ) po czym rozdzielać elektroforetyczńie.