CiBtEAJB
I Pod w /|lędcm biochemicznym enzymy restrykcyjne 10 atczgtwnikk:.MY
Cjrybonuklcł/y d) lipwy
’ Do grupy I zaliczamy enzymy restrykcyjne, których aktywność »•, ,,n> oó Al I*. S-łdcnozylomctioniny i Mg'
S) tylko ATP i Mg3’
c) tylko Mg3*
d) tylko ATP i S-adenozyło metioniny
3 Enzymy restrykcyjne II klasy
a) zawsze generują tzw rudmicrnosci typu 5’
b) rozpoznające sekwencje s/ostkowc zazwyczaj trawią DNA na mniejsze fragmenty niz enzymy czwórkowe (ej) ich miejsce trawienia może leżeć naprzeciwko siebie w obu niciach i wówczas powstają końce tępe
o) zawsze generują nadnucrnosci długości 3 nuklcotydów
4 Enzymy restrykcyjne II klasy
W* "“Jł rozdzielony aktywność resrryktazy i mcłylazy
m jeśli rozpoznaj sekwencje bogate w pary AT lub GC mogą być na ogól uważane za rzadkotn.ycc c^substrafem może być wyłącznic dsDNA
<§
mogą rozpoznawać wieloznaczne sekwencje palindromowe
5 Które sposrod poniższych sekwencji me są najprawdopodobniej miejscami rozpoznania enzymów restrykcyjny eh kl
a) GAATTC
b) ATCCTA (ej GCTTGC d) CTGCAG
6 Aktywność gwiaździsta enzymu restrykcyjnego
# pojawia się jako elekt zbyt długiej inkubacji mieszaniny reakcy jnej pojawia się przy nadmiarze enzy mu restrykcyjnego c) pojawia się u bardzo nielicznych cnzymósv
d) zalczy od rodzaju użytego DNA i pojawia się tylko podczas trawienia genomowego DNA
7 Przyłączanie starterów a) przeprowadza się w temp pokojowej
wj) jest kluczowym etapem reakcji PCR wpływającym na jej specyficzność (cT) przeprowadza się w zakresie temp 37-72°C
o) na ten etap można wpływać stosując dodatki takie jak DMSO lub formamid
8. Nowo syntetyzowane nici produktów pierwszorzędowych reakcji PCR (uy nic mają określonej długości / 5) mają ściśle określoną długość
A J P°*°wa n,c 0,8 określonej długości V-/ 0) nic zawierają nucjsca przyłączania starterów
2? W reakcji PCR
(aj) pierwsze właściwe zamierzone fragmenty dsDNA powstają w 3 cyklu reakcji U) krótkie dsDNA są amplifikowane w kolejnych cyklach w sposób liniowy c) produkty dnigorzędowc tworzone są sv sposób wykładniczy fdj długość amplifikowanych fragmentów jest zdefiniowana przez kośtcc 5 start aa
10. Etap dcnaturacji
QJ przeprowadza się w temp 94-96°C przez 20-30 sok. y b) jego czas mc jest zależny od rodzaju użytej matrycy / (ej nic może być ostatnim etapem reakcji PCR
o) temperatura dcnaturacji powinna być wyzsza w ostatnich cyklach PCR
Ą
11 Stężenie wolnych jonów Mg*’ w mieszaninie reakcyjnej PCR zależy: a tylko od dŃTP i EDTA b tylko od PPii EDTA c fylko od EDTA @ od d NTP PPii EDTA