System kanalizacji podzielony na dwa oddzielne systemy posiadające własne oczyszczalnie ścieków:
• Płaszowski(0. Ś. Płaszów)
• Nowohucki (O. Ś. Kujawy)
• Systemy lokalne z mniejszymi oczyszczalniami (Bielany, Skotniki, Kostrze, Sidzina, Tyniec, Wadów)
• 66 przepompowni lokalnych
Długość sieci kanalizacji sanitarnej wynosi obecnie ponad 1800 km, trwa jej dalsza rozbudowa, co jest priorytetem inwestycyjnym MPWiK S. A. Kraków.