Pętla zmienna (pętla V) - zawiera różną liczbę nukleotydów: 3-5 w cząsteczkach tRNA klasy 1 lub 12-31 w cząsteczkach tRNA klasy 2
Ramię TH^C - element z sekwencją tymina - pseudourydyna - cytozyna
Izoakceptorowe tRNA - są to różniące się od siebie cząsteczki tRNA, które są specyficznie w stosunku do tego samego aminokwasu
A-QH
C
<j A
pG — C , ,
_ acceplor sieni
C—Gj^
G — C
G — U Ti|iC fc>op
A — U t
C U
GACAC miA
U — A
T U1
GA r-A JIMI G nrC UCUGr,„ c I 1 | I Q
A it4G /i, 111 G
‘ C — G ~
Anticadon
loop
A —U G — rtfC A «-«*> C„ A
U Y
.t A
vaflatite li>c^
b) zasada tolerancji
Jest to zjawisko polegające na tym, że dany rodzaj tRNA może połączyć się z więcej niż jednym kodonem. Prawo to zos\ało zaproponowane przez Cricka. Ponieważ antykodon znajduje się w pętli cząsteczki tRNA, trójka nukleotydów jest lekko wygięta i dlatego nie może być na całej długości tak samo ułożona wzdłuż kodonu. W wyniku tego możliwe jest tworzenie zgodnie z zasadą tolrancji nietypowych par zasad między trzecim nukleotydem kodonu i pierwszym nukleotydem antykodonu. Możliwe jest powstawanie różnych par zasad w szczególności, gdy nukleotyd w pozycji 34 jest zmodyfikowany.
U bakterii dwie najczęściej występujące możliwości, to:
• tworzenie zasad pary C i U, oznacza to, że antykodon o sekwencji 3'-++G-5' mo/.e tworzyć parę zarówno z kodonem 5’-+ + C-3’, jak i 5’-^^U-3\ W konswkwencji znika konieczność posiadania różnych cząsteczek tRNA dla każdego kodonu
• występowanie inozyny
Zasada tolerancji redukuje liczbę niezbędnych w komórce cząsteczek tRNA, umożliwiając jednej cząsteczce tRNA odczytywanie dwóch lub nawet trzech kodonów.
U Eucaryota:
• tworzenie pary G - U występuje w przypadku ośmiu tRNA, ale te wszystkie cząsteczki mają antykodon typu 3’-4*G-5’
Zasada supertolerancji - skrajna forma zasady tolerancji obowiązująca w mitochondriach u zwierząt. Cztery kodony z jednej rodziny mogą być rozpoznawane przez ten sam tRNA
37