resized P1080851

-

Replisom E. coli		Inicjacja replikacji E. coli
Replisom - kompleks białek biorący udział w replikaqi.		Replikacja zaczyna się od rozpoznania przez prymazę
topoizomerazy - rozcinają chwilowo jedną lub dwie ma i zapewniają		miejsca inicjacji replikacji (On C u E coli). W chromosomie
obrót DNA.		bakterii E. coli jest jedno miejsce Oh C.
hdikaza (DnaB) - rozplata podwójną helisę DNA prymaza (Dna$ - syntezuje starter RNA i rozpoczyna syntezę DNA.		"m7^t; TT*
polimerazy DNA - syntetyzują DNA, istnieje kilka rodzajów polimeraz.
ligaza - łączy wolne końce fragmentów w nici opóźnionej.		3k GATCTNTrNTTTr 4 * TTATNCANA
białka SSB (single stranded binding proteins) - utrzymują strukturę		Ori C (2«5 pz)
pojedynczej nici DNA i zapobiegają ponownemu wiązaniu się w		m o
podwójną nić oraz wiązaniu w strukturę spinki.

Schemat działania polimerazy

^—

1*

<1 Utrf

cn&/&fv

Polimeraza DNA I E. coli

Polimeraza DNA l - kodowana jest przez gen polA, katalizuje reakcję przyłączenia 5-trójfosforanów (dATP, dGTP, dCTP, dTTP.) do grupy 3’-OH tworzącego się łańcucha DNA. Odgrywa ona i również istotną rolę w procesie naprawy DNA i | degradaqi kwasów nukleinowych Łańcuch połimerazy DNA I (103 kD) może być przecięty przez proteazę na dwa fragmenty 68 kDa i 35 kDa.

Fragment 68 kDa oprócz aktywności polimerazy działa również jako 3 -5’ egzonukłeaza (kontrola poprawności wbudowania nukleotydów).

Fragment 35 kDa przecina wiązania oddalone o kilka nukleotydów od końca 5’ (usuwa starter RNA i uzupełnia przerwy po usunięciu startera) Usuwa też dimery pirymidynowe powstające na skutek działania UV.

Przemieszczenie luki katalizowane przez 35 kDa fragment

35 kOa

v 3S kDa

przemieszczenie pęknięcia (nicktransJation)

Polimeraza DNA III E. coli

Polimeraza DNA III składa się z widu podjednostek (900 kDa).

Posiada strukturę asymetrycznego dimeru. jednocześnie replikuje dwie rud DNA. (j _{r R w} u #    ..... » _t ,

W rdzeniu (a. e, 0) podjednostka ot ma aktywność polimerazy, e to egzonukłeaza 3'-5'. Podjednostki t odpowiedzialne są za dimeryzaqę.

Polimerazy DNA - porównanie

	Polimeraza I	Polimeraza II	Polimeraza III
Wefcoić (kDa)	103	90	rdzert.o, t. 0 (130.27. 5. 10)
Gan	potA	polB	polC
floić/komóritę	400	-	10-20
Polimeraza 5'-3*	♦	♦	♦
Egzonukłeaza 3-5'	♦	♦	♦
Egzonukłeaza 5'-3‘	♦	-	-

	u	6	E	P	r
lokalizacja	jądro	jądro	lądro	jądro	rmtocnondna
Funkcja podstawowa	synteza starterów	synteza DNA	naprawił DNA	naprawa DNA	replikacja
Inne funkcje	*	egzonukłeaza 3-5'		egzonukłeaza 3-6'	egzonukłeaza 3-5-

2