Skrining drobnoustrojów (lub produktów ich metabolizmu) to kompleksowe postępowanie, obejmujące zespół selektywnych zabiegów mających na celu:
a) wykrycie i izolację spośród dużej liczby możliwych, tylko tych drobnoustrojów (lub metabolitów), które są celem badań
b) wstępną ocenę ich przydatności do danego procesu
Ogólna strategia skriningu w biotechnologii (na przykładzie biotechnologii farmakologicznej)
mikrobiolodzy - izolacja drobnoustrojów ze środowiska, eliminacja powtórzeń, klasyfikacja, przechowywanie
mikrobiolodzy, genetycy, biochemicy, biolodzy molekułami - modyfikacja genotypu w celu uzyskania nadprodukcji metabolitu, biosyntezy metabolitu o zmienionej strukturze lub produkcji całkowicie obcej dla drobnoustroju struktury chemicznej
farmakolodzy, biochemicy, mikrobiolodzy, chemicy - opracowanie metod oraz dokonanie ukierunkowanego skriningu in vitro, izolacja i identyfikacja produktów, synteza i półsynteza analogów produktów naturalnych, testowanie aktywności farmakologicznej in vivo (na zwierzętach)
mikrobiolodzy, technolodzy fermentacji, inżynierowie bioprocesowi - opracowanie podłoża i warunków fizycznych bioprocesu, powiększenie skali i wdrażanie przemysłowe, prowadzenie i usprawnianie procesu technologicznego
chemicy, farmakolodzy, lekarze, biochemicy - opracowanie formy leku i badanie jej aktywności terapeutycznej, farmakokinetyka, ustalanie przebiegu leczenia
Otrzymywanie szczepów przemysłowych
KRYTERIA UWZGLĘDNIANE PRZY WYBORZE MIKROORGANIZMU:
• charakterystyka odżywiania (tanie media, dostosowanie do określonego substratu)
• optimum temperatury (najlepiej wyższa od 40°C - mniejsze koszty chłodzenia, eliminacja ryzyka zakażenia)
• zdolności do wzrostu w warunkach przemysłowych (odporność na typ procesu i stosowane materiały)
• stabilność cech
• produkcyjność (wydajność procesu substrat - produkt na jednostkę czasu)
• łatwość wydzielenia produktu z medium pofermentacyjnego
• brak toksycznych produktów metabolizmu
W początkowym etapie skriningu mamy najczęściej do czynienia z nieznanym szczepem.
Ocena przydatności biotechnologicznej drobnoustrojów: izolacja, namnażanie, testowanie w postaci czystych kultur. Rozproszenie komórek, by wyrosłe z nich kolonie miały charakter monokultur (odpowiednie rozcieńczanie próbek oraz środki chemiczne (m.in. detergenty) i fizyczne (m.in. filtrację, wirowanie).
Przy izolowaniu drobnoustrojów ze środowisk nie sprzyjających ich rozwojowi, stosuje się zagęszczanie komórek.
o
POZrSKIWANIĘ SZCZEPÓW
ZE ŚRODOWISKA Z KOLEKCJI
ł i
CZYSTA KULTURA
ł
SKRIWIHO WSTĘPNY
i
HODOWLA
Ogólna strategia skriningu drobnoustrojów w biotechnologii Pozyskiwanie szczepów mikroorganizmów o znaczeniu przemysłowym
Etapy podstawowego postępowania przy izolowaniu drobnoustrojów ze środowiska
I
TESTY <W VfTRO \
'ŻOLACJA PRODUKTU
EA DANIE AKTYWNOŚCI BIOLOftCagJ PRODUKTU TESTY BADANIA
ł
URUCHOMIENIE PRODUKCJI N0WE60 LEKU
Schemat postępowania podczas poszukiwania i opracowywania nowego produktu (leku) pochodzenia mikrobiologicznego
Badanie znanych szczepów nowe sposoby hodowli bardziej czułe metody t
analityczne
Izolacja nowych mikroorganizmów o pożądanych cechach —-►
postępowanie
wzbogacające
testy
różnicujące
© — c-na
kultura wyjściowa
obserwacje próba fermentacyjna
morfologiczne i
do
dalszych
badań
kolekcji
testy produktu