Transkryptom - cała zawartość mRNA komórki lub organizmu
Transkrypcja odwrotna - synteza RNA na matrycy DNA przez odwrotną transkryptazę a) inicjacja - miejsca promotorowe
Promotor - sekwencja nukleotydowa znajdująca się powyżej genu, z którą wiąże się polimeraza RNA, inicjując transkrypcję
Promotor alternatywny - jeden z dwóch lub większej liczby różnych promotorów tego samego genu
Promotor podstawowy - miejsca składania kompleksu inicjacyjnego w obrębie promotora eukariotycznego
Promotor E.coli składa się z dwóch sześcionukleotydowych segmentów.
Blok- 35 5’-TTGACA-3’
Blok-10 5’-TATAAT-3’ł
Są to sekwencje „uśrednione” na podstawie sekwencji wszystkich promotorów E.coli.
Sekwencje promotorów E.coli:
Promotor |
Sekwencja | |
Blok-35 |
Blok - 10 | |
Sekwencje najwyższej zgodności |
5’-TTGACA-3’ |
5’-TATAAT-3’ |
Operon laktozowy |
5’-TTTACA-3’ |
5’-TATGTT-3’ |
Operon tryptofanowy |
5’-TTGACA-3’ |
5’-TTAACT-3’ |
U Eucaryota termin „promotor” obejmuje wszystkie sekwencje istotne w procesie incjacji transkrypcji genu. Każda z trzech eukariotycznych polimeraz RNA rozpoznaje różne sekwencje promotorowe i to właśnie różnice między promotorami decydują o tym, która polimeraza przeprowadza transkrypcję danych genów.
• Promotory polimerazy RNA l składają się z promotora podstawowego, obejjmującego miejsce startu transkrypcji i położonego między nukleotydami -45 ± 20 oraz położonego powyżej elemntu kontrolnego UCE znajdującego się 100 bp powyżej.
• Sekwencje promotorów polimerazy RNA II są bardzo różne i występują w ogległości od kilku tysięcy par zasad powyżej miejsca startu transkrypcji. Promotor podstawowy składa
- się z dwóch segmentów: bloku -25, zwanego sekwencją TATA oraz sekwencji inicjatorowej - Inr obejmującej nukleotyd +1.
Niektóre geny nie mają żadnego z nich. Są to geny „zerowe”. Ich transkrypcja zachodzi w sposób ciągły, jednak położenie miejsca startu transkrypcji jest bardziej zmienne niżw genach mających sekwencje TATA lub Inr.
25