2. Transkrypcja
Transhypcja to enzymatyczna synteza RNA na matrycy DNA. Matrycą jest jedna nić matrycowa (antysensowna).
Budową promotora
5' TTGACA[kasety-35] —16-18 (spacer) — TATAAT[kasety -10 pribnowa] ----5-8(dyskryminator) 3’
Polimeraza RNA wiążę się ze specyficznym miejscem inicjatorowym promotorem. Promotor skłąda się z 40-60 par zasad.
Kaseta -10 jest miejscem inicjacji rozplatania DNA Kaseta -35 region rozpoznoawania
Miejscem startu transkrypcji w 90% przypadków jest puryna G.
PolimeidZd RNA z 5 sztuk
(a2pP'ó) holoenzym (a2pp) rdzeń
Podjenostki alfa - odpowiadają za montaż rdzenia i wiązanie białek regulatorowych Podjednostka beta - zaangażowana w dołączanie trifosforanów rybonnkleozydów Beta' - umocowanie enzymu do nici DNA Sigma - kluczowa rola i rozpoznanie promotora w inicjacji.
1. Polimeraza RNA, podjednostka sigma rozpoznaje promotor i odnandując jego charakterystyczną sekwencję -35 przyłącza się tam dzięki podjednostce beta.
2. Tworzy się kompleks zamknięty. Polimeraza przesuwa się do kasety -10 i w tym miejscu rozpoczyna się, czyli rozplatanie nici DNA (słabe wiazania AT)
3. Tworzy się bąbel transkrypcyjny. Syntetyzowanych jest pierwszych 8 nukleotydów i podjednostka sigma oddysocjowuje. Występuje proces inicjacji
Po udanej inicjacji enzym uwalnia czynnik sigma i tworzy potrójny kompleks polimeraza-DNA-powstający RNA. Polimeraza przesuwa się wzdłuż DNA Dołączane są tri fosforany nukleozydów.
Może być rho-niezależna i rho-zależna. W sekwencji terminacyjnej jest dużo par GC. To stablizuje strukturę transkryptu.-tworzy się spinka Końce są bogate w dużo adenin.
Rho - czynnik białkowy.
Rho-zależna: Rho przyłącza się do transkryptu do miejsca rut i przesuwa się wzdłuż tego transkryptu w kierunku 3’. „Goni” polimerazę RNA. Gdy zetknie się z polimerazą do zmienia konformację enzymu, który oddysocjowuje. W tym typie może wystąpić strukhira spinki do włosów. Nie występuje ogonek poliuracylowy
Rho-niezależna: DNA ma sekwencję palindromową. Po jej stranskrybowaniu tworzy się struktura spinki do włosów, która zmienia konformację polimerazy RNA, która oddysocjowuje. Zakończenie UUU... ułatwia rozszczepienie transkryptu i matrycy.
U EUCARYOTA: pierwsza kaseta -30 o sekwencji tata. druga sekwencja -80 CA AT. 3 polimerazy RNA (zamiast 1; I - synteza rRNA, II - mRNA snRNA, III - tRNA), mRNA monocistronowe (każdy gen swój promotor ma). mRNA przechodzi proces dojrzewania.
Do koiica 5’ orzyczepia się czapeczka (7-metyloguanozyna - chroni przed enzymami i ułatwia transport z jądra do cytoplazmy). Do końca 3’ przyłącza się ogonek (150 reszt adeninowych - zabezpieczna przed działaniem tuikleaz). Transkrypcja zachodzi w jądrze.