Podstawowe tezy chromosomowej teorii dziedziczenia brzmią następującą:
-Geny zlokalizowane są na chromosomach liniowo w określonej kolejności.
-Geny alleliczne znajdują się w tych samych loci chromosomów homologicznych.
-Poszczególne chromosomy zawierają różną liczbę genów, zestaw ich jest charakterystyczny dla danego chromosomu.
-Geny zlokalizowane w obrębie każdej pary chromosomów homologicznych są ze sobą sprzężone.
-Częstość występowania crossing-over zależy od odległości między genami.
-Częstość crossing-over między genami w obrębie tej samej pary chromosomów jest stała dla danego gatunku.
-Organizmy powstałe z rekombinacji po crossing-over noszą nazwę rekombinantów.