6 (1271)

Enzymy - c. d.

-    białka proste - za właściwości katalityczne odpowiadają łańcuchy boczne aminokwasów w łańcuchu polipeptydowym

-    o strukturze trzeciorzędowej - złożone z pojedynczego łańcucha polipeptydowego

-    o strukturze czwartorzędowej - złożone z kilku łańcuchów polipeptydowych

-    białka złożone - do działania potrzebują obecności związku o charakterze niebialkowym (koenzymu)

Wszystkie enzymy białkowe posiadają centrum aktywne odpowiedzialne za wiązanie substratu

Budowa miejsca (centrum) aktywnego

Miejsce aktywne to obszar, który wiąże substraty oraz dostarcza reszt amiriokwasowych. biorących bezpośredni udział w tworzeniu i rozrywaniu wiązań w cząsteczce substratu

•    miejsce aktywne zajmuje małą część całkowitej objętości cząsteczki enzymu

•    jest układem przestrzennym złożonym z łańcuchów bocznych aminokwasów leżących w różnych pozycjach liniowej sekwencji aminokwasów

•    w połączeniach substratów z enzymami biorą udział słabe siły wiązania

•    miejsca aktywne są zagłębieniami łub szczelinami

•    substrat musi mieć odpowiedni kształt, by mógł pasować do miejsca aktywnego

-    białka proste

-    białka złożone - zawierają kofaktor (jednostka niebiałkowa)

Kofaktorami mogą być:

•    jony metalu

•    złożone cząsteczki organiczne - koenzymy

HOLOENZYM = APOENZYM + KOENZYM/GRUPA PROSTETYCZNA

białko złożone część białkowa    część niebiałkowa

V

Koenzym - luźno związany z białkiem enzymu

•    łatwo oddysocjowuje od białka enzymu

•    można go oddzielić od enzymu przez dializę (bez zniszczenia struktury białka enzymatycznego)

Grupa prostetyczna - jon metalu łub koenzym związane z enzymem

kowalencyjnie

•    silnie związana z białkiem enzymu

•    można ją oddzielić niszcząc strukturę białka

Rodzaj cząsteczki	Rola w katalizowanej reakcji
Jony metaSł
Fe^2* lub Fe^3*	Utlcmeme/redukcja
Cu* lub Cu^2*	Utlenianie/redukcja
Zn^2*	Wspomaga wiązanie NAD*
Biotyna	Przenosi - COCr
Koenzym A	Przenosi - CH-- Ch3
NAD*	Przenosi elektrony
FAD	Przenosi elektrony
ATP	Dostarcza/magazynuie energię

Grup* p#zna

Hem    Wia.zejony 0₂i elektrony

PAD    Przenoś* elektrony

NAD⁺/NADH - dinukleotyd nikotynoamidoadeninowy NADP^/NADPH - fosforan dinukłeotydu nikotynoamidoadeninowego

R

suacyna witamina PP

o

s

c

2*

NH

iw

{czynni uflfnancy*

£ ZyiUli II    0*7.flO?

vtv, ł

V.

\\

\

R

B

-Lk? ?

Adenina

NAD*"

forma

utleniona

W NADP*ta grupa hydroksylowa jest zestryfikowana reszta fosforanowa

o

h » •. r

•—f] j ^NM'- tub :?

^N ri    " H ’

!

« *

NA DH

forma zredukowana

¹ 0 i ►

0.8 l

r

£ 0.6 i

T

Al

<*

/

w

/

k

o 0.4 i-

^< 0.2 I

O.o U4.---i—

Oxtdized \IWAD* )

V

\

4* .i

Reduced (NADHJ

/

j—:    j

220 240 260 280 300 320 340 360 380 Wdvelenglh (nm|