Jeśli ponownie kliknie się na klawisz Save/Restiore settings można zobaczyć zapisany plik My setting razem z wcześniej podanymi parametrami, które zadawano, aby uzyskać standardową formę prezentacji wyników, dopuszczoną przez program CLC Seąuence Yiewer
SaveSetUnas.. Oetete Settogs.. | |
Appły Sered Setting; ► |
Black/whito ConserYfltion color Non-compact Show annotations my setbngs |
CLC Standard Settlngs |
Wybrać fonkcję CLC Standard Setting powoduje wyświetlenie wyników przeprowadzonego algorytmu dopasowania sekwencji.
4.1. Dokonać przeszukania bazy danych NCBI GenBank database. Wyniki przeszukiwania bazy, zostaną wyświetlone w oknie prezentacji
W programie CLC Seąuwncw Viewer możliwe będzie pokazanie sekwencji DNA zidentyfikowanych w ludzkiej hemoglobinie w sytuacji, gdy przyjęto założenie, że nieznany jest dostępowy numer tej sekwencji Aby uruchomić proces przeglądania należy:
wejść w funkcję Search | opcja Search for Sequences at NCBI ( )
Otwarte okno dialogowe wymaga wypełnienia danymi, tak więc wyszukiwanie sekwencji DNA wymaga zaznaczenia bazy Nucleotide, lub dowolnej innej, a następnie wypełnienia trzech kolejnych pól przez wpisanie odpowiednich parametrów. Należy, więc wykonać następującą sekwencję czynności:
choose Organism in the fint drop down menu | write 'human' in the adjoining text field | choose AU Fields in the second drop down menu j write 'hemoglobin' in the adjoining textfield \choose Ali Fields in the third drop down menu | write 'complete' in the adjoining textfield
Następnie należy kliknąć klawisz Start search, aby uruchomić przeszukiwanie bazy danych NCBL Rezultaty wyszukania sekwencji przedstawione zostana w oknie prezentacji.
4-2. Należy podjąć próbę zmiany parametrów wyszukania sekwencji i wprowadzić inne dane w pola deklaracyjne formularza dialogowego. Zapamiętać otzrymanre wyniki przeszukiwania
4.3. W sprawozdaniu umieścić opis pliku danych zawierąjących sekwencję i zapamiętanych w formacie GenBanku W tym celu należy wyświetlić sobie plik źródłowy z danymi i opisać co zostało umieszczone w wierszach nagłówkowych opisu sekwencji.
Ocenić poprawność działania programu wyszukującego.