DSC01259 (6)

DSC01259 (6)



Jeśli ponownie kliknie się na klawisz Save/Restiore settings można zobaczyć zapisany plik My setting razem z wcześniej podanymi parametrami, które zadawano, aby uzyskać standardową formę prezentacji wyników, dopuszczoną przez program CLC Seąuence Yiewer

SaveSetUnas.. Oetete Settogs..

Appły Sered Setting; ►

Black/whito ConserYfltion color Non-compact Show annotations my setbngs

CLC Standard Settlngs

Wybrać fonkcję CLC Standard Setting powoduje wyświetlenie wyników przeprowadzonego algorytmu dopasowania sekwencji.

4 Przeszukanie bazy GenBank z pamiętaniem wybranych danych

4.1. Dokonać przeszukania bazy danych NCBI GenBank database. Wyniki przeszukiwania bazy, zostaną wyświetlone w oknie prezentacji

W programie CLC Seąuwncw Viewer możliwe będzie pokazanie sekwencji DNA zidentyfikowanych w ludzkiej hemoglobinie w sytuacji, gdy przyjęto założenie, że nieznany jest dostępowy numer tej sekwencji Aby uruchomić proces przeglądania należy:

wejść w funkcję Search | opcja Search for Sequences at NCBI ( )

Otwarte okno dialogowe wymaga wypełnienia danymi, tak więc wyszukiwanie sekwencji DNA wymaga zaznaczenia bazy Nucleotide, lub dowolnej innej, a następnie wypełnienia trzech kolejnych pól przez wpisanie odpowiednich parametrów. Należy, więc wykonać następującą sekwencję czynności:

choose Organism in the fint drop down menu | write 'human' in the adjoining text field | choose AU Fields in the second drop down menu j write 'hemoglobin' in the adjoining textfield \choose Ali Fields in the third drop down menu | write 'complete' in the adjoining textfield

Następnie należy kliknąć klawisz Start search, aby uruchomić przeszukiwanie bazy danych NCBL Rezultaty wyszukania sekwencji przedstawione zostana w oknie prezentacji.

4-2. Należy podjąć próbę zmiany parametrów wyszukania sekwencji i wprowadzić inne dane w pola deklaracyjne formularza dialogowego. Zapamiętać otzrymanre wyniki przeszukiwania

4.3. W sprawozdaniu umieścić opis pliku danych zawierąjących sekwencję i zapamiętanych w formacie GenBanku W tym celu należy wyświetlić sobie plik źródłowy z danymi i opisać co zostało umieszczone w wierszach nagłówkowych opisu sekwencji.

Ocenić poprawność działania programu wyszukującego.


Wyszukiwarka

Podobne podstrony:
Zaproszenie do socjologii Peter L Berger0 (2) Jednakże jeśli nawet skupimy się na ściśle rozumianym
P1000498 /v. jeśli inscenizacja zasadza się na unikaniu spójności acm^ tycznej luh na jej krzyżowani
CCF20071025007 Jednakże jeśli nawet skupimy się na ściśle rozumianym życiu akademickim, to socjolog
CCF20100512020 jeśli mianownik kończył się na -d ścieśnione — biernik przyjmował końcówkę -ą: burzą
55754 Obraz8 Schemat do modelu 55 Jeśli znaki łączą się na górze, to o. przer. razem, jeśli zb
44 (211) Jeśli znaki zbiegają się na dole to przerabiamy je w jednym o. = potrójny słupek dalej
Krótko po tym, bo już w roku 1971 na ulicach mojego miasta milicja ponownie rozprawiała się na ulica
Image222 (3) Programowanie ■ indeksu. Normalnie funkcje te powinny zwracać wartość 0. Jeśli jednak z

więcej podobnych podstron