W klasyfikacji wirusów uwzględniane są następujące podstawowe kryteria:
- typ kwasu nukleinowego (DNA lub RNA);
- liczba nici kwasu nukleinowego (Jedno -1 dwuniciowy);
- polamość kwasu nukleinowego. Wirusy RNA których genom może bezpośrednio pełnić funkcje informacyjnego RNA umownie nazwane są wirusami o dodatniej pola mości, te zaś u których musi być najpierw utworzony transkrypt - wirusami o ujemnej pola mości;
- symetria nukleokapsydu;
- występowanie osłonki lipidowej lub jej brak.