specjalnie zaprojektowane i zsyntetyzowone dla danej sekwencji.
Specyficzne:
Sondy wyznakowane są fluorescencyjnie.
Podczas reakcji dochodzi do przeniesienia energii zaabsorbowanej przez jeden f luorochrom (reporter) na drugi, który emituje światło o innej długości (np. HybProbes) lub dochodzi do wygaszenia emisji
f luorochromu przez zwitek wygaszający (np. TaąMan).
OHM