2740390243

EFEKTY KSZTAŁCENIA:

Student:

1.    Zna pojęcie oraz obszary zastosowań bioinformatyki. (K_W01, K_W13, K_W14, K_W16)

2.    Zna wybrane serwisy bioinformatyczne. (K_W13, K_W16)

3.    Zna podstawowe formaty zapisu sekwencji w pliku. (K_W14, K_W16)

4.    Potrafi zamodelować strukturę 3D białek. (K_U15, K_U16)

5.    Potrafi zamodelować strukturę 2D RNA. (K_U15, K_U16)

6.    Zna wybrane programy komputerowe służące do porównywania sekwencji. (K_W14, K_W16)

WERYFIKACJA EFEKTÓW KSZTAŁCENIA I WARUNKI ZALICZENIA:

1.    Sprawdzanie stopnia przygotowania studentów oraz ich aktywności w trakcie zajęć projektowych.

2.    Ocena wykonanego projektu dotyczącego zastosowania wybranych programów i metod informatycznych do modelowania struktury 3D białek oraz modelowania struktury RNA.

3.    Kolokwium pisemne na zaliczenie wykładu.

Na ocenę z przedmiotu składa się ocena z projektu (40%) i ocena z kolokwium na zaliczenie wykładu (60%). Warunkiem przystąpienia do kolokwium jest pozytywna ocena z projektu. Warunkiem zaliczenia przedmiotu jest pozytywna ocena z projektu i z wykładu.

OBCIĄŻENIE PRACĄ STUDENTA:

Godziny kontaktowe

wykład -15 godz. projekt - 30 godz. konsultacje - 5 godz.

Razem: 50 godz. (2 ECTS)

Praca samodzielna

wykonanie projektu - 35 godz.

przygotowanie do kolokwium w ramach zaliczenia wykładu - 15 godz.

Razem: 50 godz. (2 ECTS)

Razem za cały przedmiot: 100 godz. (4 ECTS)

LITERATURA PODSTAWOWA:

1.    Baxevanis A. D., Ouellette B. F. F., Bioinformatyka. Podręcznik do analizy genów i białek, PWN, 2005.

2.    Higgs P. G., Attwood T. K., Bioinformatyka i ewolucja molekularna, PWN, 2008.

LITERATURA UZUPEŁNIAJĄCA:

1.    Cullis C. A., Plant Genomics and Proteomics, John Wiley & Sons, 2004.

2.    Lesk A. M., Introduction to Bioinformatics, Oxford University Press, 2002.

Wydział Matematyki, Informatyki i Ekonometrii Kierunek: Informatyka i ekonometria 12