kolekcje roślin leczniczych oraz ozdobnych. Na sadzawce, pochodzącej z dawnego starorzecza Wisły, wzniesiono w 1856 r. sztuczna wyspę. Obszar Ogrodu powiększano kilkukrotnie. Swą obecną powierzchnię ok. 9,6 ha uzyskał w latach pięćdziesiątych XX w. W 1882 r. wybudowano palmiarnię istniejącą do 1969 r. W 1966 r. oddano do użytku palmiamię "Jubileuszową" wraz z zespołem szklarni tropikalnych.
Wycieczkę rozpoczęliśmy od zwiedzania Muzeum Botanicznego, które składa się z 4 sal ekspozycyjnych. W sali 1 i 2 ukazane są historia Ogrodu Botanicznego UJ (m.in. plany, ryciny, portrety W. Szafera i B. Pawłowskiego), drzewa i krzewy dziko rosnące oraz uprawiane na terenach Polski (fragmenty pni, próbki drzew).
Na zbiory Sali 3 składają się:
1. Drzewa i krzewy szpilkowe w Polsce (szyszki, próbki drewna),
2. Sagowce krakowskiego Ogrodu Botanicznego (szyszki makrostrobile, nasiona, fotografie),
3. Sosna ekspozycja szyszek różnych gatunków,
4. Rośliny nagozalążkowe Ogrodu Botanicznego UJ najcenniejsze drzewa (plan Ogrodu z zaznaczonymi okazami, nasiona, szyszki,
fotografie). Największa sala 4 prezentuje następujące zagadnienia botaniczne: tropikalne rośliny użytkowe, liany i epifity, dendroflora Jawy, pasożytnicze rośliny kwiatowe Jawy, typy rozsiewania roślin sawannowych, roślinność gór Afryki Wschodniej (pnie, owoce, nasiona, zielnik, wyroby rzemiosła ludowego). Są to zbiory przywiezione z Jawy i sąsiednich wysp oraz Afryki przez m.in. M. Raciborskiego i J.Komasia.
Zbiory botaniczne obejmują ok. 5000 okazów dendrologicznych, karpologicznych (owoców i nasion) i całych roślin zakonserwowanych w płynach oraz preparatów mikroskopowych (ok. 1500 sztuk). Okazy pochodzą z Ogrodu Botanicznego, a także z naturalnych stanowisk na terenie Polski, Afryki i Indonezji.