Siarkowodór (H2S) może występować w wodach naturalnych, jest pochodzenia: organicznego, mineralnego, biologicznego). Powstaje gdy w podłożu(wodnym) znajdują się FeS2 i FeS: FeS2+2C02+2H20=Fe(HC03)2+H2S+S; FeS+2C02+2H20=Fe(HC03)2+H2S W warunkach beztlenowych za zw organ powstaje siarczek metalu. H2S jest wielką przeszkodą w otrzymaniu czystych produktów destylacji np. ropy naftowej. Jest kwasem słabym, dysocjującym dwustopniowo. Dla wód mocno kwaśnych(pH<5) w wodzie może znajdować się t>iko rozpuszczony H2S. H2S utlenia się do siarki H2S+1/202=H20+S.
Zatem w warunkach aerobowych rozpuszczony siarkowodór nie występuje lub śladowe ilości. W zbiornikach głębokich może występować podwyższona koncentracja H2S w okolicach roponośnych, bagiennych lub narażonych na antropogeniczne zanieczyszczenia. H2S jest przyczyną korozji budowli łączących się bezpośrednio z wodami.