Zakładowa organizacja związkowa ma też uprawnienie do występowania do pracodawcy z wnioskiem o przeprowadzenie odpowiednich badań w razie uzasadnionego podejrzenia, że w zakładzie pracy występuje zagrożenie dla życia lub zdrowia pracowników.
Art. 30 ustawy szczegółowo reguluje działalność zakładowej organizacji związkowej i zasady jej współdziałania z pracodawcą, w sytuacji gdy w zakładzie pracy działają dwie organizacje lub więcej organizacji związkowych.
Zasada negatywnej wolności związkowej - każda z organizacji broni praw i interesów swoich członków, nie wkraczając w sprawy członków innego związku oraz pracowników niezrzeszonych w związku. Pracownik niezrzeszony w związku ma prawo do obrony swoich praw na zasadach dotyczących członków związku, jeżeli wybrana przez niego organizacja związkowa wyrazi na to zgodę. Na pracodawcy ciąży obowiązek zaciągnięcia informacji o liczbie takich pracowników. Organizacja związkowa powinna w ciągu 5 dni od otrzymania pisma pracodawcy przedstawić wykaz pracowników korzystających z jej obrony. Jeżeli nie uczyni tego w terminie pracodawca jest zwolniony z obowiązku współdziałania z nią. SN uznał, że pracodawca, jeżeli ma wątpliwości co do tego czy pracownik korzysta z ochrony związkowej, powinien zwrócić się z zapytaniem do organizacji związkowej przed dokonaniem każdej czynności wymagającej w spółdziałania z tą organizacją.
Dla sprawniejszego działania organizacje związkowe mogą tworzyć wspólną reprezentację -gdy działa więcej niż jedna.