Okres wylęgania - czas od wniknięcia zarazka do organizmu do wystąpienia pierwszych objawów chorobowych W tym okresie zarazek przystosowuje się do warunków panujących w organizmie, rozmnaża się i zaczyna działać patogennie.
Nosiciel- osoba , która nie wykazuje widocznych objawów chorobowych ale równocześnie wydala z kałem, moczem, plwociną drobnoustroje chorobotwórcze. Jest on potencjalnym źródłem zakażenia dla otoczenia.
Zdrowi nosiciele- którzy nie chorowali i nie spostrzegli u siebie zaburzeń czynności organizmu a mimo to izoluje się od nich zarazki. W surowicy krwi nosicieli stwierdza się podwyższony poziom przeciwciał specyficznych dla drobnoustroju
Ozdrowieńcy - ludzie, którzy chorowali i w okresie rekonwalescencji wydzielają chorobotwórczy drobnoustrój.
-stały
-okresowy
Mikrobiom, mikrobiota - ogół mikroorganizmów występujących w danym siedliska Termin mikrobiom zaproponował Joshua Lederberg na przełomie XX i XXI w., nawiązując zwłaszcza do słów genom i proteom. Ponieważ większość organizmów mikrobioty (zwłaszcza bakterie, mikroskopijne grzyby) niegdyś zaliczano do roślin, termin ten jest bliskoznaczny z terminem mikroflora. Z kolei w przypadku mikrobioty glebowej odnosi się w znacznej mierze do mikrofauny. W odróżnieniu od pojęcia mikroflory fizjologicznej, obejmuje on wszystkie mikroorganizmy, nie wyłączając chorobotwórczych W pewnych ujęciach mikrobiom stosowany jest nie tyle do zespołu organizmów, ile raczej do zespołu ich genomów