Kotwicowisko jest położone 3 mile na SE od Point Loma. Oprócz tego port pozwala na kotwicowanie w każdym miejscu poza kanałem, wolnym od położonych na dnie przewodów. Wyjątkiem jest położony na południu, przy wyspie Coronado, akwen startowy wodnosamolotów.
Kapitanat portu posługuje się kanałem 12. Używa się również kanału 11 po wcześniejszym wywołaniu na kanale 16.
Podejście:
D San Diego podchodzi się przez 2-u milowy kanał o szerokości 244 metrów i minimalnej głębokości 12,5m. Środek kanału wyznacza nabieżnik którego stawy pomalowane są w biało-czerwone pasy i umieszczone są w porcie jachtowym. Wyznaczają namiar 353°. Na podejściu leży kilka wraków oznakowanych bojami. Po minięciu Zuniga Jetty należy przez milę utrzymywać kurs N, potem, przez 2A mili NE. Po wschodniej stronie znajdują się cztery stawy mili pomiarowej (wyznaczające dwie linie prostopadle do trawersu statku idącego kanałem). Po wejściu na North San Diego Bay należy zmienić na E. Obie strony kanału są dobrze oznakowane bojami.
Statki pasażerskie podchodzą do Broadway Pier o głębokości nie mniejszej niż 10,7m.
Most Bay Bridge oddziela Zatokę Glorietta od Zatoki San Diego. Jego prześwit: 59,4m. Infrastruktura portowa:
Holowniki zazwyczaj podchodzą do statku na 1 milę przed keją. Dostępne jest 5 holowników mocy od 200 do 2,400h.p.
Wszystkie nabrzeża wyposażone są w prąd, wodę pitną, tory kolejowe i drogi.
Istnieje możliwość bunkrowania paliwa z barki lub cysterny.
Regulacje lokalne:
Z powodu ruchu statków wojennych U. S A wejście do portu jest zabronione w poniedziałkowe przedpołudnia i w przedpołudnia po każdym dniu świątecznym.