Infekcja, czyli wtargnięcie wirusa do organizmu gospodarza, przebiega następująco:
• adsorpcja (przyłączenie) wirusa na powierzchni komórki gospodarza przez specyficzne receptory;
• wnikanie całego wirusa do światła komórki;
• replikacja, której początkiem jest rozpuszczenie kapsydu przez enzymy komórki gospodarza i uwolnienie kwasu nukleinowego wirusa; następnie wirus przechodzi w okres utajenia, w czasie którego nie jest możliwe mikroskopowe stwierdzenie jego przebywania w komórce, którą zainfekował; kwas nukleinowy wirusa po uwolnieniu z otoczki jest w stanie zaangażować dla swoich potrzeb całość procesów odpowiedzialnych w komórce za przetwarzanie materiału genetycznego, w tym enzymy, rybosomy i energię;
• składanie, w czasie którego poszczególne poprawnie wykształcone części wirusa łączą się tworząc jego wierną kopię; etap ten następuje w momencie nagromadzenia wystarczającej ilości zreplikowanych białkowych podjednostek kapsydu oraz materiału genetycznego;
• uwolnienie, które kończy infekcję; najczęściej jest to moment, w którym następuje liza, tzn. zniszczenie, komórki gospodarza; dochodzi do uwolnienia dojrzałych wirusów, które są zdolne do zakażenia kolejnej komórki.
Istnieją dwa możliwe sposoby zakończenia infekcji. Wirusy uwalniając się z komórki mogą doprowadzić do jej śmieci (jest to tzw. cvkl lityczny) lub wydostać się nie uszkadzając jej (tzw. cykl iizogeimy)-