4. Transferazy - enzymy przenoszące grupy atomów z jednego związku na inny w zależności od rodzaju przenoszonej grupy wyróżniamy:
a) metylotransferazy (przenoszą grupy -CH3)
b) acylotransferazy (przenoszą reszty acylowe R-CO-)
c) aminotransferazy (przenoszą grupy aminowe -NH3)
d) kinazy (przenoszą reszty fosforanowe -P04*)
do transferaz należą też polimerazy DNA i RNA uczestniczące w syntezie kwasów nukleinowych. Współdziałają z koenzymami.
5. Liazy - enzymy katalizujące reakcje eliminacji z utworzeniem podwójnego wiązania, a także przyłączania różnych grup do podwójnego wiązania. W procesie rozszczepiania nie biorą udziału cząsteczki wody. Zalicza się do nich
a) dekarboksylazy (katalizują usuwanie z substratów grup karboksylowych w postaci C02)
b) dehydratazy (katalizują eliminację cząsteczek wody)
c) aldolazy - odczepiają grupę aldehydową -CHO
6. izomerazy - białka proste, działają bez udziału grup prostetycznych i koenzymów, enzymy katalizujące przemiany izomeryczne wew. cząsteczki, w zależności od rodzaju przeprowadzonych izomeryzacji wyróżnia się;
a) racematy (kataliza przejścia enancjomerów L w D
b) epimerazy (kataliza enomerów a w 3 i odwrotnie)
c) izomerazy cis-trans
d) oksydoreduktazy (aldoza<->ketoza)
e) mutazy (przenoszą reszty fosforanowe w obrębie danej cząsteczki
7. Ligazy - enzymy katalizujące powstawanie wiązań kowalencyjnych między różnymi cząsteczkami, kosztem energii wyzwalanej w wyniku hydrolizy ATP. Przykładem mogą być karboksylazy, tworzące wiązania między dwoma atomami węgla.