• ssDNA hybrydyzuje z nukleotydem
• Przy użyciu polimerazy DNA i dNTP-ów otrzymujemy cząsteczkę typu dsDNA
• Tym wektorem transformujemy komórki bakteryjne
• W bakteriach zachodzi replikacja DNA i podział komórek. Replikacja dotyczy obu nici I
• Otrzymujemy 2 typy komórek - jedne z DNA typu dzikiego a drugie ze zmutowanym DNA(obie nici) w zależności od nici macierzystej która została użyta do syntezy DNA tej komórki
• Bakterie identyfikuje się po wysianiu na podłoże stałe w odpowiedniej gęstości tak by możliwe było rozróżnienie klonów.
• Problemy pojawiają się w komórce na poziomie replikacji (?) ale sama metoda jest łatwa
Poszczególne metody mutagenezy różnią się wydajnością gdyż metody te mają różne cele i problemy do rozwiązania
Mutageneza przy pomocy PCR (mutageneza z wykorzystaniem megaprimera)
(e) PCR mutagenesis
• 1 st PCR to obtain long primer
product Q";j i i ri
• 2nd PCR using long primer
product
• Istotą techniki megaprimera(mega startera) jest to że wykonujemy 2 reakcje PCR
• Technika ta jest bardzo wydajna dla wprowadzania mutacji punktowych - jeśli wszystko jest dobrze wykonane to mamy praktycznie 100% pewność że mutacja została wprowadzona
• W pierwszej reakcji korzystamy z 2 starterów - jeden zawiera mutację(forward - przedni) i ją wprowadza a drugi nie zawiera mutacji
• Otrzymujemy produkt w którym jest mutacja
• W drugiej reakcji znowu posługujemy się dwoma starterami: starter przedni nie zawiera mutacji a drugim starterem jest produkt reakcji pierwszej - jest bardzo długi więc jest megaprimerem
• Po wykonaniu drugiego PCR otrzymujemy produkt który jest identyczna do sekwencji wyjściowej z tą różnicą że wprowadziliśmy mutację
• Metoda nie jest prosta gdyż używamy mega starter