Lepsza wydajność całkowita procesu - często można ominąć ekstrakcję Lepsza rozpuszczalność - związki o niskiej polarności reagują szybciej Rozpuszczalniki źle wpływają na żywe komórki - nie trzeba martwić się sterylnością
Mniejsze ryzyko dezaktywacji lub inhibicji enzymu spowodowane
osadzaniem się lipofilowych związków na powierzchni białka
Nie trzeba immobilizować enzymów, ewentualnie wystarczy zwykła
adsorpcja
Enzymy są bardziej stabilne w niepolarnych rozpuszczalnikach organicznych - lizozym w wodzie po 30s (płł 8) lub po lOOmin (pH 4) w T=100°C traci 50% aktywności, a w cykloheksanie dopiero po 140h
Zmiana równowagi reakcji hydrolizy w kierunku syntezy - można przeprowadzać reakcje estryfikacji, transestryfikacji, syntezę peptydów, laktonów