Struktura organizacyjna Instytutu (w nawiasach kierownicy jednostek)
W roku sprawozdawczym struktura Instytutu nie uległa zmianie i obejmowała:
I. Zakład Różnorodności Biologicznej (prof. dr hab. Krzysztof Zdzitowiecki)
1. Pracownia Pasożytniczych Protozoa (prof. dr hab. Irena Wita)
2. Pracownia Biologii, Systematyki i Zoogeografii Helmintów (prof. dr hab. Krzysztof Zdzitowiecki)
3. Pracownia Biologii Rozmnażania i Rozwoju Pasożytów (prof. dr hab. Zdzisław Swiderski)
II. Zakład Biologii Molekularnej (prof. dr hab. Halina Wędrychowicz)
4. Pracownia Immunobiologii (dr Ewa Dziemian)
5. Pracownia Fizjologii (prof. dr hab. Mieczysława I. Boguś)
6. Pracownia Biochemii (doc. dr hab. Tadeusz Moczoń)
7. Pracownia Parazytologii Molekularnej (prof. dr hab. Halina Wędrychowicz)
III. Zakład Epizootiologii i Patologii (doc. dr hab. Bożena Moskwa)
8. Pracownia Parazytoz Zwierząt Domowych (dr hab. Jakub Gawor)
9. Pracownia Parazytoz Zwierząt Dzikich (prof. dr hab. Aleksander W. Demiaszkiewicz)
10. Pracownia Fizjopatologii (doc. dr hab. Bożena Moskwa)
11. Pracownia Produkcji Doświadczalnej Pasz (w Łomnie) (mgr inż. Czesław Bąk) - działalność zawieszona
Jednostki organizacyjne podporządkowane bezpośrednio Dyrekcji:
12. Stacja Badawcza w Łomnie-Las (mgr inż. Czesław Bąk)
13. Stacja Badawcza i Ferma Jeleniowatych w Kosewie Górnym (mgr inż. Marek Bogdaszewski)
14. Centralna Biblioteka Parazytologiczna (mgr Małgorzata Woronowicz-Rymaszewska)
4