Sprawność rozdzielcza przy zastosowaniu chromatografii preparatywnej (PLC) była gorsza, niż w przypadku analitycznej chromatografii cienkowarstwowej (TLC). Profile stężeniowe otrzymane z PLC były mniej zróżnicowane, niż te pochodzące z TLC. Mogło to być spowodowane naniesieniem niedostatecznej ilości próbki na grubszą warstwę adsorbenta w porównaniu z chromatogramami analitycznymi. W związku z tym chromatogramy preparatywne zostały podzielone tylko na dwie frakcje, co przedstawiono na rys. 41 a i b.
Każda frakcja łącznie z warstwą żelu krzemionkowego była starannie zeskrobywana z płytki szklanej, następnie dodawano do nich porcję metanolu i umieszczano w łaźni ultradźwiękowej na 30 minut. Po tym czasie roztwór przepuszczano przez filtr strzykawkowy z tlenkiem glinu jako adsorbentem w celu oddzielenia żelu krzemionkowego od roztworu. Tak przygotowane próbki w dalszej części były analizowane przy pomocy chromatografii gazowej sprzężonej z detekcją masową (GC/MS). Na rys. 42 a i b zaprezentowano chromatogramy gazowe frakcji 1 i 2 olejku pochodzącego z S. lavandulifolia, rozdzielonego wstępnie przy użyciu preparatywnej chromatografii planarnej, a na rys. 43 a i b przedstawiono analogiczne chromatogramy gazowe frakcji 1 i 2 olejku pochodzącego z S. triloba.
96