(stan na 31 grudnia 2005 roku)
Wydział Prawa i Administracji Wydział Filozoficzny Wydział Historyczny Wydział Filologiczny Wydział Polonistyki
Wydział Fizyki, Astronomii i Informatyki Stosowanej Wydział Matematyki i Informatyki Wydział Chemii
Wydział Biologii i Nauk o Ziemi
Wydział Lekarski
Wydział Farmaceutyczny
Wydział Ochrony Zdrowia
Wydział Zarządzania i Komunikacji Społecznej
Wydział Studiów Międzynarodowych i Politycznych
Wydział Biotechnologii
Archiwum UJ
Biblioteka Jagiellońska
Biblioteka Medyczna
Centrum Zdalnego Nauczania
Muzeum Uniwersytetu Jagiellońskiego
Studium Pedagogiczne
Wszechnica Uniwersytetu Jagiellońskiego
Jagiellońskie Centrum Językowe Medyczne Centrum Kształcenia Podyplomowego CM Studium Wychowania Fizycznego i Sportu UJ Studium Wychowania Fizycznego i Sportu CM
Środowiskowe Laboratorium Analiz Fizykochemicznych i Badań Strukturalnych.
14