Studenci MISHiS zobowiązani są przez pierwsze dwa lata studiów do uczęszczania na zajęcia zintegrowane dla studentów MISHiS:
■ Wstęp do badań interdyscyplinarnych
■ Kształtowanie umiejętności interpersonalnych
■ Kamień w architekturze i sztuce
■ Antyk w edukacji liberalnej
■ Semiotyka cyfrowej informacji
Zajęcia na studiach II stopnia to:
■ Forum dyskusji interdyscyplinarnej
■ Prakseologia projektów badawczych
Studenci MISHiS wybierają zajęcia oferowane przez następujące wydziały: Wydział Anglistyki, Wydział Filologii Polskiej i Klasycznej, Wydział Historyczny, Wydział Nauk Politycznych i Dziennikarstwa, Wydział Nauk Społecznych, Wydział Neofilologii, Wydział Prawa i Administracji, Wydział Studiów Edukacyjnych, Wydział Teologiczny. Studenci są zobowiązani do wyboru kierunków z dwóch obszarów: nauk humanistycznych i społecznych. Każdego roku organizowany jest wyjazd naukowo-badawczy. Studenci MISHiS mają prawo uczestniczenia w zajęciach i warsztatach kolejnych sesji Międzynarodowej Szkoły Humanistycznej (Polska-Ukraina-Litwa-Białoruś-Rosja-Bułgaria), działającej przy Ośrodku Badań nad Tradycją Antyczną UW, a także w sesjach Akademii Artes Liberales.
Forum dyskusji interdyscyplinarnej jest cyklem spotkań tematycznych, zachęcających studentów i pracowników naukowych UAM do podjęcia interdyscyplinarnej dyskusji na wybrany temat. Podczas każdego ze spotkań zostaje on zaprezentowany przez prelegenta w postaci kilkunastominutowego referatu, do którego ustosunkowuje się dwoje recenzentów, wybranych spośród tutorów MISHiS. Spotkanie, trwające 90 minut, prowadzi moderator,
wprowadzając temat i rozpoczynając dyskusję. Cele FDI to rozwijanie metodologii interdyscyplinarnych w różnych dziedzinach wiedzy, integrowanie środowiska naukowego UAM ponad dyscyplinarnymi i organizacyjnymi podziałami, przygotowywanie studentów do podejmowania dyskusji naukowych na forum publicznym.
Wyjazd naukowo-badawczy dla studentów MISHiS UAM ma charakter badań naukowych skupionych wokół problemu wielokulturowości. Jego głównym celem jest praca nad interdyscyplinarnymi projektami badawczymi, jakie studenci przygotowywali podczas zajęć modułowych - Wstępu do badań interdyscyplinarnych. Projekty te powstają w oparciu o arkusze programu PRELUDIUM Narodowego Centrum Nauki (konkurs na projekty badawcze realizowane przez osoby rozpoczynające karierę naukową nieposiadające stopnia naukowego doktora) i polegają na pracy zespołowej. W wyjeź-dzie oprócz studentów uczestniczą wykładowcy Pracowni Humanistycznych Studiów Interdyscyplinarnych przy Wydziale Filologii Polskiej i Klasycznej UAM, która stanowi zaplecze naukowe dla badań prowadzonych na MISHiS. Wykonawcy projektów biorą udział w wykładach akademickich przygotowanych przez profesorów uniwersytetów współpracujących z Pracownią: Ss. Cyril and Methodius University of Skopje, University of Plovdiv „Paisii Hilendarski", University of Belgrade. Praca studentów polega m.in. na zbieraniu materiałów faktograficznych związanych z projektami, przeprowadzaniu wywiadów i ankiet, rejestrowaniu rozmaitych artefaktów kultury itp. Podsumowaniem projektów jest studencka konferencja warsztatowa, podczas której poszczególne grupy przedstawią zrealizowane przez siebie projekty.