5192605643

5192605643



[3] BADANIE ODDZIAŁYWANIA BIAŁKO — LIGAND 35

wiążących ligand w makrocząsteczce. Z zależności tych łatwo wyprowadza się równanie Adaira (5):

K1[L] + 2K1K2[L]2+ ...... +nKtK2 ... Kn [L]n

f    1+K1[L] + KiK2[L]2+ ...... + K1K2...Kn[L]nJ (rowname )

W najprostszym możliwym przypadku, gdy wszystkie miejsca wiążące są identyczne i nie oddziaływują ze sobą, otrzymuje się równanie (6—8):

nK[L]

1 + k[L]


(równanie 2)

gdzie k — oznacza tzw. mikroskopową (wewnętrzną) stałą asocjacji charakteryzującą hipotetyczną równowagę: miejsce nieobsadzone + L ^ miejsce związane z L.

Zależność między stałą k a stałymi z równania 1 jest następująca:


Jeżeli wszystkie miejsca wiążące można podzielić na m klas, w obrębie których miejsca są identyczne i niezależne, wtedy (9, 10):

(równanie 3)


_ V n*k* [LI

y 1 + k, [L]

Dopasowywanie równań teoretycznych do danych doświadczalnych przeprowadza się obecnie najczęściej metodami numerycznymi przy zastosowaniu maszyn cyfrowych (11—15). Tracą natomiast na znaczeniu metody graficzne, oparte na liniowych transformacjach równania 2, np. na wykresie Scatcharda (6):


kn — kr


(równanie 4)


Wykres Scatcharda ([L.]) nie jest już linią prostą w przypadku

modelu makrocząsteczki z kilkoma klasami miejsc identycznych i nie-oddziaływujących ze sobą (10). Przy rozkładzie takich krzywoliniowych wykresów na proste składowe wielu badaczy kieruje się intuicją, co z reguły prowadzi jednak do rażących błędów (16). Podano kilka teoretycznie prawidłowych graficznych metod analizy (9, 13, 17, 18). W praktyce można je jednak zastosować tylko do analizy układów, w których występują najwyżej 2 klasy miejsc wiążących.

Krzywoliniowość wykresu Scatcharda może wskazywać również na oddziaływania wzajemne między miejscami wiążącymi czyli tzw. koope-ratywność'(19, 20). Przyłączenie cząsteczek ligandu do pewnych miejsc może zmniejszać (kooperatywność ujemna) lub zwiększać (kooperatyw-ność dodatnia) powinowactwo innych miejsc do ligandu. Efekty takie są

3*



Wyszukiwarka

Podobne podstrony:
[5] BADANIE ODDZIAŁYWANIA BIAŁKO — LIGAND 37 ale również zniekształcenia wykresu Scatcharda, co
[7] BADANIE ODDZIAŁYWANIA BIAŁKO — LIGAND *59 frakcje z obszaru plateau (3 wykorzystać do wyzna
[9] BADANIE ODDZIAŁYWANIA BIAŁKO — LIGAND 4H B + La ^ BLab + + L„ Lb Kb U Kba U
[13] BADANIE ODDZIAŁYWANIA BIAŁKO — LIGAND 45 Zaletą tej techniki jest prostota oraz możliwość
[17] BADANIE ODDZIAŁYWANIA BIAŁKO — LIGAND 49 37.    Stevens R.
[19] BADANIE ODDZIAŁYWANIA BIAŁKO — LIGAND 51 97.    Alberty R. A., Marvin H. H.
BADANIE ODDZIAŁYWANIA BIAŁKO ■— UGAND 43 Tak czy inaczej, jeżeli ilość miejsc wiążących w
U5] BADANIE ODDZIAŁYWANIA BIAŁKO — UGAND 47 ności równania 17. Ogromną wadą opisanej metodyki j
1) Badania oddział) wuń bialko-bialko 1/1 vivo (FRET) Oddziaływanie GFP BFP Bako świeci m nebtesko
336 J. EILMES, M. PTASZEK. z ligandem makrocyklicznym [55]. Otrzymano również kompleks, w którym jon
9 Zbiór 1300 par białko-ligand z bazy PDBbind wersja 2007 (znana prawdziwa struktura kompleksu jak i
DSC02052 oddziaływania niekowalencyjne ligandów z DNA Non-oovatently tinding drugs Bis
DSC02054 oddziaływania kowalencyjne ligandów z DNA Covatent cccnptex€>s (diadducfcs) hntrastrand
IMG 1404014836 wielką liczbę bezpośrednich oddziaływań białko-białko. Widać, te ^ katne oddziaływan
Dorota KSIĄŻEK, Mariusz J. LIGARSKI _BADANIA ODDZIAŁYWANIA _ROZWINIĘTEGO SYSTEMU_ _ZARZĄDZANIA
1.4. Pływające magnesy Cel: badanie oddziaływań między dwoma magnesami pływającymi po wodzie. Środki
Zdjęcie0588 Badania oddziaływania źródeł pola elektromagnetycznego na pramdtomą pracą yfctadów
1.4. Pływające magnesy Cel: badanie oddziaływań między dwoma magnesami pływającymi po wodzie. Środki
2.4. Oddziaływania magnesu na igły magnetyczne Cel: badanie oddziaływania magnesu na igły magnetyczn

więcej podobnych podstron