Enzymy- biokatalizatory białkowe,
regulujące szybkość reakcji
biochemicznych.
Enzymy to kompleksy białkowe proste lub
złożone:
• proste- grupa czynna to aminokwasy
• złożone- grupa czynna to koenzymy
apoenzym + koenzym holoenzym
Koenzymy- małocząsteczkowe, niebiałkowe
związki organiczne decydujące o
aktywności katalitycznej niektórych
enzymów. Są zróżnicowane pod względem
budowy.
Liczne koenzymy są pochodnymi witamin –
np. NAD i NADP zawierają w swoym
składzie amid kwsu nikotynowego, który
jest jedną z witamin grupy B, pirofosforan
tiaminy jest pochodna witaminy B
1
.
Podział koenzymów
1. Przenoszące wodór i elektrony,
współdziałające z enzymami klasy
oksyreduktaz.
2. Przenoszące grupy powiązane z
enzymami klasy transferaz.
3. Inne, czyli katalizujące procesy
syntezy, izomeryzacji i rozpadu
wiązań węgiel- węgiel, grupa ta jest
związana z enzymami klasy ligaz i
izomeraz.
Koenzymy Oksydoreduktaz
• Dinukleotyd nikotynoamidoadeninowy
(NAD
+
)
-organiczny związek chemiczny, pełni
istotną rolę w procesach oddychania
komórkowego, w których jest akceptorem
protonów i elektronów.
NAD
+
+ H
+
+ 2e
-
NADH
NAD
+
- forma utleniona dinukleotydu
NADH – forma zredukowana
Fosforan dinukleotydu
nikotynoamidoadeninowego (NADP
+
) – różni się od
NAD
+
dodatkową grupą fosforanową przyłączoną do
jednej z cząsteczek rybozy.
Podstawowa funkcja :
- przenoszenie elektronów i udział w reakcjach
oksydoredukcyjnych
NADP
+
powstaje w początkowym etapie fotosyntezy i
jest używany później w cyklu Calvina.
NADP
+
- kation fosforanowy dinukleotydu
NADPH – forma zredukowana
NADP
+
jest także akceptorem protonu i elektronów w reakcjach
utleniania, lecz powstający NADPH nie przekazuje protonu i
elektronów na łańcuch oddechowy. Są one zużytkowywane w
różnych reakcjach redukcji, głównie w przebiegu biosyntezy
kwasów tłuszczowych i cholesterolu. W organizmach
samożywnych NADP powstaje w początkowym etapie
fotosyntezy i jest zużywany później w cyklu Calvina.
Dinukleotydy nikotynamidoadeninowe i
flawinoadeninowe uczestniczą w wielu biologicznych
procesach oksydacyjno-redukcyjnych.
Dinukleotyd nikotynamidoadeninowy (NAD) i jego ester
fosforanowy (NADP) są koenzymami, uczestniczącymi
w reakcjach odwodorowywania (utleniania) alkoholi do
aldehydów lub ketonów, w wyniku których pierścień
pirydynowy nukleotydu nikotynamidowego ulega
redukcji do dihydropirydyny, przekształcając te
dinukleotydy w formy zredukowane, mianowicie NADH
+ H+ lub NADPH + H+.
W komórce cykl Krebsa jest głównym dostarczycielem
zredukowanych form koenzymu NADH + H+, będących
bezpośrednimi dostarczycielami protonów i elektronów
do łańcucha oddechowego. Łańcuch oddechowy
stanowi zasadnicze miejsce regeneracji utlenionych
form tego koenzymu (NAD), tym samym dostarcza je
enzymom cyklu Krebsa.
Strukturalnie NADP różni się od NAD jedynie obecnością
ortofosforanu
przy drugim atomie węgla (C2') rybozy nukleotydu adeninowego.
Formy zredukowane tych koenzymów uczestniczą w reakcjach
redukcji związków karbonylowych do alkoholi. Zredukowane
formy koenzymu NADPH + H+ uczestniczą m.in. w procesie
syntezy kwasów tłuszczowych w cytoplazmie komórki.
Głównym dostarczycielem tych zredukowanych dinukleotydów w
komórce jest cykl fosfopentozowy.
Wszystkie koenzymy nikotynamidoadeninowe w swej strukturze
zawierają witaminę PP, mianowicie niacynę, czyli kwas
nikotynowy, dlatego witamina ta potrzebna jest do ich syntezy.
Brak witaminy PP wywołuje chorobę zwaną pelagrą.
Formy zredukowane dinukleotydów nikotynamidoadeninowych
wykazują dodatkowe maksimum absorpcji przy 340 nm, poza
absorpcją światła przy 260 nm, która jest charakterystyczna
dla obu form, zredukowanej i utlenionej. Fakt ten
wykorzystuje się do śledzenia procesu redukcji dinukleotydów
nikotynamidoadeninowych metodami optycznymi.
• Nukleotydy flawinowe – dinukleotyd
flawinoadeninowy (FAD) oraz mononukleotyd
flawinowy (FMN)
–są przenośnikami elektronów i maja
podobną strukturę chemiczną. Oba te koenzymy zawierają
jednostkę mononukleotydu flawinowego. FAD ma dodatkową
grupę cukrową i zasadę adeninową.
FAD i FMN reagują z dwoma protonami oraz z dwoma
elektronami, oscylując między stanem utlenionym i
zredukowanym.
FAD + 2H
+
+ 2e
-
FADH
2
Nukleotydy flawinowe biorą udział w wielu
biologicznych reakcjach utlenienia i redukcji. W ich
strukturze występuje witamina B2, czyli ryboflawina
(nukleozyd), związek o barwie Żółtej.
Fosforyboflawina (FMN) jest mononukleotydem,
składającym się z zasady azotowej zwanej
izoalloksazyną (policykliczny heterocykl) i z rybitolu,
zestryfikowanego ortofosforanem. FMN jest grupą
prostetyczną niektórych oksydoreduktaz,
uczestniczących w reakcjach utlenienia
biologicznego. Formy zredukowane nukleotydów
flawinowych zawierają dwa protony i dwa elektrony,
które przyłączone są do dwóch atomów azotu (N1 i
N10) heterocyklicznych pierścieni izoalloksazyny. W
wyniku redukcji stają się bezbarwne. Fakt zmiany
barwy Żółtej na bezbarwną może być wykorzystany
do śledzenia redukcji flawin metodami optycznymi,
szczególnie przy długości fali 450 nm, przy której
zanika absorpcja światła przez zredukowane flawiny.
Dinukleotyd flawinoadeninowy (FAD), poza
fosforyboflawiną (FMN) składa się z nukleotydu
adeninowego. Podobnie jak dinukleotyd
nikotynamidoadeninowy przenosi protony i elektrony,
dlatego występuje w dwóch formach utlenionej (FAD) i
zredukowanej (FADH2). Koenzym flawinowy może
uczestniczyć w reakcjach utleniania bezpośredniego
substratu, np. bursztynianu do fumaranu, redukując
się do FADH2. Zredukowany FADH2 jest
dostarczycielem protonów i elektronów na
bezpośrednie akceptory, takie jak cytochromy. Może
też dostarczać je na tlen cząsteczkowy, np. w reakcji
katalizowanej przez oksydazę ksantynową, której
produktem jest nadtlenek wodoru, poza kwasem
moczowym. Koenzymy flawinowe (zarówno FMN lub
FAD) mogą też pośredniczyć w przenoszeniu protonów
i elektronów z koenzymów nikotynamidoadeninowych
na akceptory. Koenzymy flawinowe tworzą stosunkowo
silne połączenia nukleotydoproteinowe z apoenzymem,
dlatego są raczej grupami prostetycznymi, a nie
typowymi koenzymami zdolnymi do oddysocjowywania
od apoenzymu.
Ubichinon (koenzymem Q) - organiczny związek
chemiczny z grupy chinonów, występujący w
mitochondriach komórek roślinnych i zwierzęcych.
Jest odpowiedzialny za przenoszenie elektronów w
łańcuchu oddechowym. Po przyłączeniu
elektronów swobodnie porusza się w wewnętrznej
błonie mitochondrialnej umożliwiając transport
elektronów między kompleksami białek łańcucha
oddechowego, które wbudowane są w
wewnętrzną błonę mitochondrialną. Przenosi
elektrony między dehydrogenazą NADH (kompleks
I), względnie reduktazą bursztynian-koenzym-Q
(kompleks II) na kompleks cytochromów bc1, jest
więc zatem miejscem zejścia się dróg elektronów
pochodzących z NADH oraz FADH2.
Jest on syntetyzowany w komórkach z tyrozyny.
Ubichinon stanowi ostatnie ogniwo łańcucha
oddechowego, do którego dochodzą atomy
wodoru. Dalej przenoszone są już tylko
elektrony. Budowa koenzymu Q jest zbliżona
do witamin E i K, przez co może pełnić rolę
antyoksydanta budzącego nadzieję w
leczeniu chorób wieku starczego. W łańcuchu
oddechowym występuje on w ilości
proporcjonalnie większej od innych
składników. Ubichinon jest ruchomym
elementem łańcucha, zbierającym
równoważniki redukujące z flawoprotein i
przekazującym je cytochromom.
CoQ jest także miejscem ich powstawania
zgodnie ze schematem reakcji:
Kwas liponowy
Kwas liponowy jest kwasem 6,8-ditiooktanowym, koenzymem
przenoszącym protony
i elektrony, współdziałając z oksydoreduktazami. W komórkach
kwas liponowy występuje
w formie utlenionej i zredukowanej, zależnie od potencjału
oksydoredukcyjnego. Uczestniczy w oksydacyjnej
dekarboksylacji alfa-ketokwasów i w przemianie kwasu
pirogronowego do octanu oraz CO2.
Bierze udział w procesach detoksykacji dzięki grupie SH.
Posiada właściwości moczopędne, przeciwcukrzycowe,
przeciwmiażdżycowe i ochronne dla narządów miąższowych.
Przyśpiesza utlenianie glukozy, zwiększa zapasy glikogenu w
wątrobie, obniża stężenie lipidów we krwi. Zwiększa
wydolność fizyczną i psychiczną.
Koenzymy transferaz
• ATP - adenozynotrifosforan
ATP – najważniejszy koenzym, uniwersalny
nośnik energii w komórkach. Jest używany
do transportu energii między różnymi
reakcjami. Stanowi też łącznik pomiędzy
katabolizmem i anabolizmem, reakcje
kataboliczne generują jego cząsteczki,
reakcje anaboliczne rozkładają je do ADP.
• Koenzym A i acetylo-CoA
- CoA służy jako przenośnik grup acylowych. Cząsteczka
koenzymu A związana z resztą acylową tworzy acetylo-CoA
Pirogronian + NAD
+
+ CoA acetylo-CoA + NADH + H
+
+
CO
2
Acetylo-CoA
– uczestniczy w wielu przemianach
zachodzących w organizmie, np. w cyklu kwasu
cytrynowego
• Acylo-CoA czyli acylokoenzym A to połączenie
koenzymu A z resztą acylową umożliwiające jej
transport w organizmie. Acylo-CoA powstaje w
wyniku acylowania grupy tiolowej CoA:
– CoASH + RCOOH → CoACOR + H2O
• Najważniejszym przykładem takiego połączenia
jest acetylokoenzym A (Acetyl-CoA), tzw.
aktywny octan - produkt acetylowania koenzymu A
uczestniczący w wielu przemianach zachodzących
w organizmie, np. w cyklu kwasu cytrynowego.
• Acetylo-CoA odgrywa kluczową rolę w
metabolizmie. Składa się z grupy octanowej
(acylowej -COCH3) związanej kowalencyjnie z
koenzymem A. Uczestniczy w przemianie tlenowej
sacharydów w Cyklu Krebsa, w syntezie kwasów
tłuszczowych oraz w syntezie steroidów.
S-adenozynometiononia
Adenozylometionina jest nukleozydową
formą aktywnego metylu wykorzystywaną
w rekcjach metylacji różnorodnych
substratów do ważnych biologicznie
produktów, np. choliny, adrenaliny,
kreatyny i in.
Przenosi jednowęglową grupę –CH
3
Koenzym ten bierze udział w
wielu szlakach anabolicznych,
metylując nim grupę aminową.
• Biotyna
– jest to witamina H, zwana też witaminą
B
7
. Stanowi ona koenzym kilku różnych enzymów,
np. tworzy parę z enzymem karboksylazą.
Uczestniczy w procesach tworzenia glukozy,
syntezy kwasów tłuszczowych, cyklu kwasu
cytrynowego, wspomaga funkcje tarczycy, wpływa
na właściwe funkcjonowanie skóry oraz włosów.
• Pirofosforan tiaminy-
biologicznie czynna forma
witaminy B
1
. Związek ten pełni funkcję koenzymu
kilku enzymów związanych z metabolizmem
cukrowym. Uczestniczy w enzymatycznych
przemianach α-ketokwasów i ketocukrów.
Biotyna (z greki biotos = życie, inaczej witamina H zwana też
witaminą B7) – organiczny związek chemiczny o budowie
heterocyklicznej występujący w organizmach zwierzęcych i
roślinnych.
Zaliczana jest do witamin rozpuszczalnych w wodzie. Składa
się z pierścieni: tiofenowego i imidazolowego.
Stanowi ona koenzym kilku różnych enzymów. Jest niezbędnym
składnikiem karboksylaz biotynozależnych. Uczestniczy w
przenoszeniu grupy karboksylanowej (-COO-) z anionu
wodorowęglanu na różne związki organiczne, zależnie od
rodzaju danej karboksylazy. Wodorowęglan, służący do
karboksylacji danej cząsteczki wchodzi najpierw w reakcję z
ATP. Powstaje mieszany bezwodnik kwasu węglowo-
fosforowego. Reszta węglanowa jest następnie przenoszona
na biotynę - łączy się z atomem azotu w pierścieniu
heterocyklicznym. Następnie grupa karboksylanowa jest
przenoszona na docelową cząsteczkę. Łańcuch
wodorowęglanowy obecny w cząsteczce biotyny nadaje jej
elastyczność (biotyna jest czasem nazywana "elastycznym
ramieniem" karboksylazy) i umożliwia przeniesienie
związanej grupy -COO- na pewną odległość, z miejsca
reakcji z aktywowanym węglanem do miejsca zasadniczej
karboksylacji cząsteczki docelowej.
Rola biotyny w organiźmie
Karboksylazy są enzymami niezbędnymi w wielu
ważnych reakcjach biochemicznych, np. w
procesie tworzenia glukozy (glukoneogeneza),
syntezy kwasów tłuszczowych, czy cyklu kwasu
cytrynowego. Biotyna uczestniczy również
wspomaganiu funkcji tarczycy, przemianie
dwutlenku węgla, wpływa na właściwe
funkcjonowanie skóry oraz włosów, uczestniczy z
witaminą K w syntezie protrombiny
(odpowiedzialna za krzepliwość krwi).
Pirofosforan tiaminy (TPP), biologicznie czynna formą
witaminy B1 (tiamina). Związek ten pełni funkcję
koenzymu kilku enzymów związanych z metabolizmem
cukrowym. Niedobór lub brak tiaminy upośledza funkcje
tych biologicznie czynnych białek. Uszkodzeniu ulega
przede wszystkim tkanka nerwowa, gdzie dochodzi do
zaburzeń w syntezie acetylocholiny, procesu pozostającego
w ścisłym związku z tlenową karboksylacją kwasu
pirogronowego i powstawaniem czynnego octanu.
Pirofosforanowa pochodna tiaminy jest koenzymem:
dekarboksylazy ketokwasów
układu enzymatycznego katalizującego tlenową
dekarboksylacja ketokwasów
transketolazy
We wszystkich tych reakcjach miejscem aktywnym koenzymu
jest atom węgla 2-pierścienia tiazolowego, który po
odłączeniu protonu tworzy układ karbanionu z wolną parą
elektronów. W tym miejscu przyłącza się związek ulegający
dekarboksylacji lub przeniesieniu.
Witamina B9 jako kwas tetrahydrofoliowy (koenzym F) to
koenzym w syntezie zasad purynowych i
pirymidynowych. Uczestniczy w przenoszeniu grup
jednowęglowych: formylowej, hydroksymetylowej,
metylowej, metylenowej formiminowej w pozycji N5, N10
pierścienia pterydynowego. Niezbędny do syntezy
tymidylanu wykorzystywanego w procesie syntezy DNA.
Uczestniczy w procesach mielizacji (tworzenie osłonki
mielinowej) neuronów i przy przekształcaniu
homocysteiny w metioninę.
Podstawową postacią koenzymatyczną kwasu foliowego jest
jej zredukowana pochodna - kwas tetrahydrofoliowy.
Biorąc udział w różnorodnych reakcjach enzymatycznych,
związanych z odłączeniem reszt jedno-węglowodorowych,
kwas tetrahydrofoliowy realizuje ich chemiczny
transport, występując w jednych reakcjach jako akceptor,
w innych - jako donor grup. Dzięki tej funkcji
koenzymatyczne postacie kwasu foliowego odgrywają
bardzo ważną rolę w przemianie szeregu amniokwasów
(seryny, glicyny, histydyny), resyntezie metioniny i
biosyntezie zasad purynowych i pirymidynowych -
prekursorów DNA i RNA.
Przekształcenie kwasu foliowego do wyjściowej
koenzymatyczne]' postaci - tatrahydrofolianu
- następuje w tkankach zwierząt w dwóch
etapach. W pierwszym etapie kwas foliowy,
przyłączając dwa atomy wodoru, przekształca
się w kwas dihydrofoliowy; w drugim etapie
następuje przyłączenie jeszcze dwóch atomów
wodoru, w wyniku czego powstaje kwas
tetrahydrofoliowy. Oba etapy katalizowane są
przez enzym zależny od FAD - reduktazę
dihydrofolianu. Głównym donorem wodoru
jest NADP • H2.
Fosforan pirydoksalu (PLP) jest
koenzymem reakcji enzymatycznych,
oraz aktywną formą witaminy B6. W
organizmie pełni funkcję koenzymu
niezbędnego do działania enzymów
odpowiedzialnych za metabolizm
aminokwasów (aminotransferaz i
dekarboksylaz). Podczas transaminacji
jest przekształcany w fosforan
pirydoksaminy.
PLP
PLP jest koenzymem wielu enzymów. Bierze udział w
przemianach aminokwasów. Przede wszystkim
współdziała z aminotransferami przenoszącymi
grupę aminową z aminokwasów na α-ketokwasy i
odwrotnie. Jest koenzymem dekarboksylaz
aminokwasów.
PLP jest to czynna forma witaminy B
6
(a ta witamina
jest mieszaniną 3 substancji:
pirydoksalu, pirydoksaminy i pirydoksyny
Natomiast formą czynną jest tylko PLP