Opisać

Alternatywny splicing i edycja mRNA splicing alternatywny:wycięte nie tylko są introny, ale także niektóre egzony, które nie są potrzebne w ekspresji DNA , z jednego tego samego premRNA moze powstac wiele róznych mRNA edycja mRNA- sekwencja czytana moze byc skracana, otrzymywana najczęściej przez przesuwanie sygnału STOP lub wstawienie dodatkowych zasad 5etapów JAK-STAT V: 19. 48 1. Wiązanie cytokiny z właściwym jej receptorem połączonym z kinazą JAK, idukuje ligomeryzaję receptorów B1 i B2. 2. Związanie się cytokiny z receptorem na pow. komorki powoduje auto- lub cross-fosforylacje kinazy JAK. 3. Aktywne kinazy JAK fosforyluja reszty tyrozynowe na czesci cytoplazmatycznej receptorow cytokin, co powoduje przyłaczenie bialka STAT i jego fosforylacje. 4. Ufosforylowane STATy dimeryzuja na pow. cytoplazmatycznej. 5. Translokacja dimerycznych bialek STAT do jadra, gdzie reguluja expresje genow. Rodziny biosyntetyczne aminokwasów- grupy aminokwasów biogennych pochodzące od wspólnego metabolitu pośredniego Synteza od skwalenu do cholesterolu skwalen->epoksyd skwalenu-> kation protosterolu->lanosterol(odłączenie grup metylowych przy C4 i C14; przemieszczenie podwójnego wiazania z C8 do C5; redukcja podwójnego wiazania przy C24) skwalen pod wplywem zespołu enzymow epoksydazy skwalenowej (monooksydazy skwalenowej i reduktazy cytochromu p450) powstaje 2,3-oksydoskwalen. ten pod wpływem cyklazy skwalenowej prowadzi do kation protosterolu->lanosterol( jest to 19 stopniowy proces w którym zachodzi odłączenie grup metylowych przy C4 i C14; przemieszczenie podwójnego wiazania z C8 do C5; redukcja podwójnego wiazania przy C24, wszystkie reakcje wymagaja o2 i nadph). enzymy w tym procesie osadzone sa w ER. Lipoproteiny (funkcje) a)chylomikrony- transport lipidów z przewodu pokarmowego do wątroby i częściowo do tkanki tłuszczowej b)VLDL-wytworzone w wątrobie i wydzielane do krwi rozprowadzają cholesterol do wszystkich tkanek peryferyjnych (transport nieenergetyczny) c)LDL- transport cholesterilu z wątroby do mięsni d)HDL-usuwanie nadmiaru cholesterolu z komórek i transport do wątroby, a tam rozkładany jest do żółci, dyskoidalne HDL- wydzielane są w wątrobie i jelicie, bo działają regulująco na chylomikrony, VLDL LDL Regulacja pozytywna i negatywna procaryota albo eucaryota (po 3 każdego) Bakterie purpurowe fosforylacja to jest rysunek do tego Motywy i domeny białka Różnice rRNA procaryota i eucaryota EU: 80 S 60S (5 5,8 28 srRNA) (49 białek ) 40S(18 srRNA)(33B) PRO: 70S 50S(23 5 srRNA) 34 białek 30S(16 srRNA) 21 białek Aktywność optyczna aminokwasów Dotyczy związków optycznie czynnych, ich roztwory skręcają płaszczyzne światła spolaryzowanego, aby związek był optycznie czynny musi zawierać asymetryczny atom wegla (chiralny) Kofaktory I klasy enzymów NAD NADP(enzymy pirydynowe) FMN FAD(flawoproteiny) FeS Fe2S2 Co-Q(ubichinon ) HemA Hem C (cytochromy) plastocjanina lipoamid plastochinon Działanie oksydo i karboksy reduktazy na RuBP oksydoreduktaza katalizuje przyłączenie O2 do RUBP w procesie fotooddychania w wyniku którego powstaje kw fosfogikolowy i kw 3 fosfoglicerynowy, zaś karboksyreduktaza wystepuje w procesie fotosyntezy i powoduje przyłączenie C02 do RUBP w wyniku czego powstaje 3 fosfo glicerynian a ten udaje sie do cyklu calvina Mitochondrialna syntaza ATP(rotator) IMP w syntezie puryn 28.4 Adenylan (AMP)(- fumaran)Adenylobursztynian (GDP+Pi<-Asp+GTP)<-IMP->(NAD+-> NADH+H+)ksantynian ->(Gln + ATP->Glu +AMP +Pi) Guanylan(GDP) Kotwiczenie białek w błonie przez lipidy Kotwiczenie białek w błonie przez lipidy. 1. kotwiczenie białek transbłonowych -bitopowe- 1 domena alfa helisy - politopowe - kilka domen alfa helisy - betabeczułki- całkowicie transbłonowe 90% beta beczułki, a alfa beczułki maja w srodku otwor (u prokariota wystepuja alfa beczułki) 2. kotwiczenie do monowarstwy - amfipatyczna- przyklejanie sie do błony, struktura alfa hydrofobowa, -petle nieupostaciowane- moga miec aminokwasy hydrofobowe i kleja sie do warstwy lipidowej -kotwiczenie za pomoca kofaktorów- białkjo ulega lipidacji i ta czesc lipidowa kleji sie do warstw lipidowej -oddziaływania jonowe, elektrostatyczne- białak peryferyjne (jon metalu musi brac udział w kotwiczeniu) Sposoby kondensacji DNA eucaryota a) podwójna helisa DNA b)nukleosom c)między nukleosomami jest DNA łącznikowe, nukleosomy i DNA łącznikowe daje solenoid d)rozeta e)chromatyna f)chromatyda g)chromosom Ruchy lipidów w dwuwarstwie lipidowej a)rotacyjne- obracanie sie wokół własnej osi prostopadłej do płaszczyzny błony b)flip-flop-dyfuzja poprzeczna, przejście z jednej powierzchni błony na drugą c) dyfuzja boczna- ruchy lateralne wzdłuż płaszczyzny błony d)bobbing- skaczący ruch pionowy Chromatografia jaka rozdziela białka ze względu na ładunek/wielkość a)wielkość- chromatografia sitowa, porowate żele pozwalają rozdzielić ze względu na wielkość cząsteczek, najpierw przechodza biała najwieksze, pozniej zas najmniejsze b)ładunek- chromatografia jonowymienna- rozdział mieszaniny substancji na podstawie ich ładunku elektrycznego Rodzaje kofaktorów org -koenzymy - kofaktory ktore współptracuja w procesie katalizy enzymatycznej , ale nie sa co-substratami np. dehydrogenaza mleczanowa. substrat i koenzym wchoda do centrum aktywnego, substrat jest przekształcany. -grupy prostetyczne- jest integralna czescia kompletnego enzymu, znajduje sie w centrum aktywnym i katalizuje reakcje. np. układ fad w dehydrogenazie acylo-coA -co-substraty: ~substraty w syntezie kwasow tłuszczowych - koenzym a ~wszystkie cykle wieloenzymatyczne Funkcja reduktazy bursztynylo-CoA 1)Zwana inaczej kompleksem II, zawierającym dehydrogenaze bursztynianową generującą/tworzącą FADH2 w cyklu krebsa 2) w łańcuchu oddechowym transportuje elektronów i wodoru z bursztynianu na ubichinon Różnice glikoliza i glukoneogeneza glikoliza- zach w w kom całego org glukoneogeneza- w watrobie i nerkach (potrzebny rys) Synteza NO w komórkach endotelium 19.12(dolna czesc) Synteza glikogenu Oksydacja tłuszczy o nieparzystej liczbie C 25.18kw tłuszczowe o nieparzystej liczbie at C są utleniane w taki sam sposób jak kw tł parzystoweglowe z tą róznicą, że w końcowej reakcji ostatniego cyklu obok czeąstki acyloCoA tworzy sie propionylo Coa a ten przekształcany jest w bursztynylo coa i włączany do cyklu Krebsa Reakcje kompleksu dehydrogenazy pirogronianowej wrzuciłem wczoraj na proteasomy

2.Topoizomeraza- DNA jest wiązany w centrum aktywnym topoizomerazy, nastepuje rozcięcie jednej nici w kierunku 3'-5' , przez to rozcięcie przekładana jest druga nić. Po przesunięciu 2 nici DNA zostaje ona zablokowana, potem następuje połączenie nici, uwolnienie zablokowanej, odtwarzamy spiralizację DNA o zmienionych współczynnikach L T i W .

3. Miejsce rozpoczęcia replikacji -ORI, z zakończenia to Ter(specyficzna sekwencja)

11.Działanie fosfolipaz-
A1- tnie przy C1 glicerolu
A2- tnie drugi kwas tłuszczowy
C- tnie miedzy ortofosforowym a C3 glicerolu
D- między ortofosforowym a ....

14. transport aktywny w obręcie ATP-az? 20,17

24.Atenuacja tryptofanu. W warunkach braku tryptofanu rybosom odczytuje sekwencję lidera i zatrzymuje się na kodonach trp Regiony 2 i 3 łączą się, bo zawierają komplementarne pary, co zapobiega tworzeniu szpilki w

regionach 3-4. Transkrypcja może być kontynuowana Kiedy nie ma tryptofanu rybosom zatrzymuje się na kodonach trp, tworzy się struktura, ktora nie kończy transkrypcji W obecności tryptofanu rybosom szybko przechodzi przez 2 kodony trp zajmując region 2 co powoduje, że regiony 3-4 tworzą szpilkę terminującą transkrypcję. Transkrypcja kończy się zanim przejdzie na pierwszy gen operonu

12.Budowa replisomu: jest polimeraza alfa, delta , sigma, białko pcna topioizomerazy, bialka ssb, prymaza, helikaza, ligaza dna dwa rdzenie i ładowarka
widełki replikacyjne składaja sie z 2 rdzeni i ładowarki, na kazdej z tych czesci znajduje sie trimeryczne białko PCNA.
polimeraza alfa to gł polimeraza dna zalezna od dna. syntzuje nic wiodaca lub czesc dna okazakiego.
polimeraza delta- pracuje pod koniec, usuwa rna syntetyzowanego primera, ma enzymy pomocnicze.
polimeraza sigma spełnia funkcje kontrolna
topoizomerazy- rozkreca skret spirali wotsona i cricka(dna b) i wszystkie innne wyzsze zwiniecia
prymaza- syntetyzuje primery - odcinki rna na nici opoznionej, bedace starterami do syntezy frag. okazakiego,
helikaza- jest to specyficzne białko bedace heksamerem, ktore tworzy fizyczne widełki replikacyjne. rozszczepia nic macierzysta na wiodaca i opozniona, zrywa wiazania wodorowe
ligaza dna łaczy odcinki dna okazakiego
białak ssb zabazpieczaja macierzyste dna przed mozliwoscia rozkładu przez endonikleazy
na koncu kompleksu działa telomeraza która rozpoznaje tzw telomery