Replikacja DNA

Replikacja DNA

Substraty: dATP, dGTP itp.; semikonserwatywna

Procaryota

Topoizomerazy typu I (przecinające jedną nić) – topoizomeraza I, III

Topoizomerazy typu II (przecinające dwie nici) – topoizomeraza II (gyraza DNA)

Rozpoczęcie inicjacji: oriC; dwukierunkowe; jedno miejsce replikacji, 245 pz, dwa motywy: 9-13; do 9 wiąże się kompleks 30 DnaA, topnienie superzwojów; wspomagają – białka HU;

Kompleks preinicjacyjny – 6 x DnaC (przekaźnik, wspomagacz), 6 x DnaB (helikaza 5’-3’)

Elongacja: synteza tylko 5’-3’; (nić prowadząca to ta od końca 3’ DNA), druga to nić opóźniona.

Polimeraza DNA nie może syntezować DNA bez startera – musi mieć wolny koniec z 3’-OH – wymagane startery.

Aktywność 3’-5’ egzonukleazy – aktywność korekcyjna, naprawa błędów

Aktywność 5’-3’ egzonukleazy – łączenie jednostek nici opóźnionej u prokariontów

Polimeraza DNA I – jedna podjednostka, obie aktywności; replikuje i naprawia DNA, usuwa startery i początkowe nukleotydy fragmentu Okazaki

Polimeraza DNA II – naprawia DNA

Polimeraza DNA III – 10< podjednostek, tylko 3’-5’; główny enzym replikacyjny; podjednostka alfa – aktywność polimeryzacyjna, beta – trzyma rdzeń polimerazy na matrycy (wraz z delta, delta’), eta – aktywność 3’-5’.

Fragmenty Okazaki – fragmenty linii opóźnionej, zaczynane są po ok. 1000-2000 nukleotydów na linii prowadzącej; mają też ok. 2000pz.

Startery – budowane przez prymazę

Kompleks preinicjacyjny + prymaza = prymosom.

SSB – białka zabezpieczające jednoniciowy DNA.

Polimeraza III + prymosom = repliosom

Polimeraza DNA III tworzy dimer, spięty podjednostkami teta.

Ligaza – łączenie fragmentów Okazaki

Białka Tus – białka terminacyjne, rozpoznają miejsca terminacji, nie dopuszczają by widełki przeszły za daleko (jedno białko Tus przepuszcza polimerazę, drugie już je hamuje (wystarczająco luźne z jednej strony)

Eucaryota

Topoizomerazy typu I – topoizomeraza III

Topoizomerazy typu II – eukariotyczna topoizomeraza II (gyraza DNA)

Rozpoczęcie inicjacji: wiele miejsc rozpoczęcia.

U drożdży: miejsca ARS (autonomicznie replikujące się sekwencje) z ORC – kompleks rozpoznający, którego subdomeny B2 i B3 replikują się autonomicznie; B2 – odpowiada oriC, topnieje poprzez przyłączenie do B3 białka ABF1

U człowieka: wiele, brak dokładnych info

Dziewięć polimeraz

Polimeraza DNA alfa – 4 podjednostki, brak aktywności, syntezuje startery

Polimeraza DNA gamma – 2, aktywność 3’-5’, replikacja mtDNA

Polimeraza DNA delta – 2/3 pod; aktywność 3’-5’, główny enzym replikacyjny; współpracuje z pomocniczym PCNA, przytrzymuje enzym na matrycy

Startery – polimeraza DNA alfa współpracująca z prymazą

RPA – odpowiednik SSB.

Brak tworzenia dimerów polimeraz; polimeraza delta na ciągłej, eta na opóźnionej;

Fragmenty Okazaki - odpowiadają mniej-więcej nukleosomowi i fragmentowi łączącemu czyli 200 pz.

RFC – czynnik replikacyjny C – kontrola nad dołączaniem i odłączaniem się enzymu z linii opóźnionej.

Endonukleaza FEN1 – usuwanie starterów

RNAza H – degradacja części łańcucha RNA połączonego z DNA

Łączenie bez RNAzy – poprzez odsunięcie ku górze startera i doreplikowanie dalszej części DNA

Terminacja – przez ligację końców łańcuchów polipeptydowych.

Telomerowy DNA – potrzebny, gdyż DNA ulegałoby skróceniu (miejsce budowy ostatniego startera musiałoby znajdować się poza końcem matrycowego DNA bądź nie mógłby ulec przekształceniu jako DNA); dlatego wydłużane przez telomerazę za pomocą specyficznej sekwencji, pomaga w tym białko TRF1, które sygnalizuje, że trzeba wydłużyć DNA, przyłączając się do niego, gdy jest krótkie; telomeraza działa tylko u komórek macierzystych.


Wyszukiwarka

Podobne podstrony:
Replikacja DNA i choroby związane
09 Replikacja DNA u?kterii
biologia, Replikacja DNA, Zjawisko transkrypcji to zjawisko powstawania rodzajów RNA ( t, m, r, )
Replikacja DNA
REPLIKACJA DNA, biochemia
REPLIKACJA DNA
Replikacja DNA, Pomoce do szkoły, Biologia
0 2 Replikacja DNA
REPLIKACJA DNA, Notatki
Budowa i Replikacja Dna
Replikacja DNA, biologia molekularna
BM3 Replikacja DNA
Replikacja DNA do seminarium
24180-genetyka replikacja dna transkrypcja biosynteza białek mutacje, semestr IV, genetyka, Genetyka
Replikacja DNA w komórkach prokariotycznych
Replikacja DNA
09 Replikacja DNA i powstawanie mutacji

więcej podobnych podstron