Lejting
Wystarzczy wyznaczyć masy peptydów po trawieniu trypsyną i porównać je do teoretycznie przewidzianych niepowtarzalnych wzorów białek zgromadzonych w bazie bioinformatycznej. Od dłuższego czasu można rozdzielać mieszanine białek wydzielanych z tkanek z pomocą metody elektroforezy dwukierunkowej. (głównie w żelach poliakryloamidowych) metoda ta pozwala uwidocznić na kwadratowej płytce pokrytej żelem poliakryloamidowym setki a nawet tysiące plamek z których każda odpowiada jednemu polipeptydowi Pomimo iż w takiej jednej plamce ilośc białka jest znikoma można je zidentyfikować za pomocą drugiej metody proteoniki tzw. Spektometrii mas). Zadanie to identyfikacja białek po tej elektroforezie.
Pierwszy rozdział jest uzależniony od mas cząsteczkowych(pejcz elektroforeza) drugi rozdział zalezny od punktów izoelektrycznych
Zdjęcie zdjecie kurwa !!!1!!!1!!oneone :D :D :D
Kazeina jest fosfoproteiną, w najwiekszej ilości występują alfa kazainy do 60% wszystkich kazein, natomiast beta kazainy do 25%, istotną frakcja są kappa kazeiny, które wspólnie z alfaS oraz betazazeiną w obecności jonów wapniowych tworzą micele wapniowe(od 100 do 300 nm)
Białka włosów to przede wszystkim keratyny, to przede wszystkim włosy, kopyta, skórze i mja trukturę alfa helisy. Zawierają w swojej strukturze bardzo dużo cystyny, dzieki mostkom disiarczkowym utrzymywana jest struktura włosa i w zależności od ilości mostków sa włosy proste/kręcone. Skład keratyny – około 10% stanowi arginina.
ZDJĘCIE ZDJECIE ZDJĘCIE ZDJĘCIE!!!11!!!11ONEONE!!
JAKO PIERWSZĄ SUBSTANCJĘ CZYNNĄ w 1955 roku wodrębniono z wzgórza – kortykoliberynę czyli czynnik uwalniający kortykotropinę
CHUJ CHUJ CHUJ CHUJ! :<
ZDJĘCIE ZDJECIE ZDJECIE ZDJĘCIE!!!111!!!1ONEONE!!
(Hormony przedniego płata przysadki mózgowej)
Zdjęcie – leptyna!!!!11!!!11!!oneone
Im mniej leptyny w organiźmie tym osoba chudziejsza
Oreksyny działają przeciwstawnie
Większośc enzymów posiada skomplikowaną budowę chemiczną.
Oprócz części białkowej(apoenzym) zawierają w swojej budowie część niebiałkową(koenzym lub grupą prostetyczną)
Koenzym a grupa prostetyczna – zdjęcie.
Grupa prostetyczna na stale związana a koenzym nieeeeeeeeeeeeeeeee!
Wyróżniamy 6 klas enzymów i tylko jedna z tych klas – 3 klaa – hydrolazy – nie posiada koenzymów bądź grup prostetycznych – sa białkami prostými, reszta enzymów to złożone białaka. Najważniejsza część enzymu to centrum aktywne(centrum katalityczne) miejsce wiązania substratu. W obrębie tego centrum wyróżniamy tzw. Grupy kontaktowe
Kwasowe, zasadowe
Tioaminokwasy(z grupą SH), albo zasadowe z OH
Typy budowy centrum aktywnego enzymu:
Typ I – gdzie w skład centrum wchodza wyłącznie aminokwasy i dotyczy to tylko hydrolaz
Typ II – w skład wchodza aminokwasy i koenzymy/grupy prostetyczne(typ I + koenzymy/grupy prostetyczne)
Typ III – to co w II i jony metali przede wszystkim dwuwartosciowych(wapń, magnez, mangan, żelaza)
Jony metali pełnią funkcje katalityczna ale również strukturalną
Ważną rolę pełni cynk
1 etap – kompleks enzym-substrat i substrat w trakcie reakcyjnej przekształcony w produkt, potem jest kompleks enzym-produkt
Miara aktywności enzymu jest albo przyrost produktu w jednostce czasu w reakcji enzymatycznej, albo ubytek substratu w jednostce czasu
Wyróżniamy enzymy od małej specyficzności substratowej bądź wysokiej – są to enzymy wysokospecyficzne.
Niska tzn. Katalizuje ten sam typ reakcji, ale może reagować z różnymi substratami, przykłądem takich enzymów są fosfatazy, które odcinają reszty ortofosforanowe z różnego rodzaju substratów, ale są równiez enzymy wysoce specyficzne, które mogą reagować tylko z 1 substratem, przykładem jest ureaza, która hydrolizuje mocznik do CO2 i amoniaku
2 teorie
teoria fishera – tzw. Zamka i klucza, gdzie zamkiem jest centurm aktywne enzymu a kluczem substrat, teoria ta zakłada, że 1 enzym moze reagować tylko z 1 substratem i ten substrat musi pasować idealnie do centrum aktywnego, jak klucz do zamka. Nie ma zmiany konformacji w obrębie centrum aktywnego enzymu.(to powoduje że nie ma miliarda fosfataz)
teoria K.... - teoriA GIETKIEGO CENTRUM albo wymuszonego kontaktu albo ręki i rękawiczki, czyli podczas wiazania substratu z centrum aktywnym dochodzi do zmian konformacyjnych głównie w obrębie centrum ale również w obrębie susbtratu(dopasowują się do siebie jak ręka i rękawiczka)
Specyficzność substratowa enzymów
Istnieje 6 klas enzymów. Każda klasa posiada swój numer. Najczęściej każdy enzym z danej klasy, posiada 4 cyfry/liczby
Np. 1 - numer klasy, 12 – podklasa, 40 - podpod klasa, ostatni numer to numer enzymu w podklasie
Oksydoreduktazy – reakcje oksydoreduksyjne – przede wszystkim w łańcuchu odde howym, cyklu krebsa, glikolizie, betaoksydacji.
2 klasa to transferazy – sa to enzymy, które przenoszą określone reszty bądź grupy funkcyjne, z jednego substratu na drugi. Nazwy podklas tworzy się od tego co one przenoszą.
NAD, FAD – koenzymy
Koenzym A, ATP, fosforan pirydoksalu(witaminy b6) B1
Aminotransferazy, przenosza grupę aminową z 1 na drugi
Fosfotransferazy inaczej kinazy, które najczęściej pobierają komponentę fosforanowa i gli
Gliko... reszty cukrowe
Klasa 3 hydrolazy, są to enzymy katalizujące hydrolizę wiazań chemicznych w środowisku wodnym. Ich nazwy tworzymy od wiązań na jakie działają a aczasami nawet jeszcze bardziej potocznie, nukleazy działają na kwasy nukleinowe, glikozydazy, esterazy itd
Klasa 4 to liazy, one również hydrolizują wiązania chemiczne, ale te z udziałem węgla.