1. Standardowa zmiana entalpii swobodnej w warunkach biochemicznych podczas reakcji hydrolizy fruktozo-1-fosforanu (F-1-P) z utworzeniem fruktozy (F) i ortofosforanu (P) wynosi –5.0 kcal/mol. Stężenia początkowe reagentów wynoszą 10^–6, 10^–2 i 10^–1 M odpowiednio dla F-1-P, F oraz P. Temperatura T, w której zachodzi reakcja to 25 °C; R=2.0 cal/mol×K. Proszę wskazać te z poniższych stwierdzeń, które są prawdziwe.
a. W warunkach zdefiniowanych jako początkowe reakcja przebiega w kierunku syntezy F-1-P.
b. W obecności enzymu katalizującego tę reakcję, w warunkach zdefiniowanych jako początkowe reakcja przebiegać będzie w kierunku syntezy F-1-P.
c. W warunkach standardowych spontanicznie zachodzić będzie hydroliza F-1-P.
d. ΔG°' dla tej reakcji wynosi około –0.9 kcal/mol.
e. Żadne ze stwierdzeń nie jest prawdziwe.
f. Stała równowagi wynosi około 1000 lub 4400 w zależności od tego czy obliczymy ją dla warunków początkowych, czy też dla warunków standardowych.
C, F nie, bo w standardowych Keq jest rowne 1, a w warunkach równowagowych mooglobybyc 4400, A nie, bo delta G równa się -0,9kcal/mol, B nie, bo enzym nie wpływa na deltaG reakcji, tylko na energie aktywacji, D nie, bo -0,9 to deltaG, a deltaG0=-5,0; E nie, bo C jest prawidłowe.
4.bylo rozpoznać wzór tryptofanu
NARYSOWAC EWNTUALNIE
5.tabelka z aminokwasami, żeby przyrównać ich symbole jednoliterowe
asparagina N Asn
asparaginian D Asp
glutamina Q Gln
glutaminian E Glu
tryptofan W Trp
treonina T Thr
lizyna K Lys
8. wykres i pytanko o hemoglobinie, od góry szły- wykres odpowiadający modelowi michaelisowskiemu- 1, potem trzy sigmoidalne, numer 3 to hemoglobina normalna.
a) 1 odpowiada dysocjacji hemoglobiny na podjednostki,
b) 2 to wtedy kiedy pH rośnie,
c) 4 kiedy BPG rośnie
wieksze pH wykres wyżej, wieksze stężenie CO2 – wykres niżej, rozpad na podjednostki – taj jak mioglobina, wiecej BPG – niżej (hemoglobina płodowa)
9. jaki będzie stosunek stężeń substratu miedzy tym które da 70% vmax i tym co da 30% vmax
a) 0.0625 albo cos koło tego
b) 1,6
c) 8,1
d) 16 cos
e) i 80 kilka
5,44 – (x1/1-x1)*(1-x2/x2)
10. jakie jest pH kiedy chyba kwas asparaginowy co ma pk głównych 3,1 i 8,0 i bocznej 4,1 chyba jeśli grupy karboksylowa i aminowa są całkowicie zjonizowane a stosunek formy zjonizowanej grupy bocznej do niezjonizowanej wynosi 0,5 musze się przyznać ze nie pamiętam ale były dla mnie tam dwie odpowiedzi "mozliwe"-
a)4,5
b)3,5
c) 10
d) chyba 1
dla takiego stosunku ph = ok. 3,5 i to jest wieksze o 1,5 od dwoch i mniejsze o 1,5 od 9.
12. Szlaki kataboliczne i anaboliczne właściwe danej cząsteczce biologicznej są niemal zawsze odrębne ponieważ: Wybierz co najmniej jedną odpowiedź
a. byłoby niezwykle trudno regulować szlak metaboliczny, gdyby pełnił on zarówno funkcję kataboliczną jak i anaboliczną.
b. reakcje w układach biologicznych są z reguły w stanie równowagi termodynamicznej.
c. ΔG°' dla obydwu reakcji byłaby dodatnia.
d. reakcje te nigdy nie przebiegają w komórkach tego samego typu.
e. Żadne z podanych stwierdzeń nie jest prawdziwe.
f. reakcje katalizowane przez enzymy są nieodwracalne.
A,D
17. studentka robiła preparat określ które zdanie nie może wynikać z tekstu, "ważyła" cząsteczkę i raz jej wyszło 60 da, potem po SDS wyszło 30 da- ja zaznaczyłam tak tylko jedna
a) na podstawie danych nie można określić struktury
b) białko jest homodimerem (dwie takie same podjednostki)
Białko jest Dimerem bo w SDS-PAGE wszystkie niekowalencyjne są rozrywane
18.tabelka k1 k2 k-1 kkat Km 3 enzymy i podporządkowane wcześniej wymienione im wartości no i pytanie który ma największe powinowactwo, który ma największa zdolność wiązać kompleks enzym substrat. wielkosci Km, kcat, i inne i pyatnia o siłe powinowactwa
Największe powinowactwo ten, który ma mniejsze Km, bo przy mniejszym stężeniu substratu osiąga połowę maksymalnej szybkości, największą zdolność wiązać kompleks ma ten, który ma największe k1, bo to jest stała szybkości tworzenia kompleksu, największą wydajność ma ten, który ma największy stosunek kkat/Km, bo wtedy szybkość, zależy tylko od dyfuzji, kkat=Vmax/[Et] jest to maksymalna szybkość, jeżeli jest nadmiar substratu i cały enzym jest wykorzystany.
19. inhibitor wykres do tego i co o nim powiesz
Jeżeli Vmax się nie zmienia, a zmienia się nachylenie to to jest inhibitor kompetycyjny(konkurencyjny), jeżeli nachylenie się nie zmienia, a zmienia się Vmax to to jest inhibitor niekonkurencyjny(nie kompetycyjny), jeżeli i Vmax i nachylenie się zmienia to jest to inhibitor mieszany, a jeżeli na wykresie L-B prosta jest rownolegla, ale poniżej to to inhibitor akompetycyjny ( Vmax tylko się zmienia)
20. BPG i olimpijczyk w górach.
Y=(pO2)n/(pO2n+p50n), liczymy dla wsystkich opcji, pozniej deltaY, a pozniej różnice między tymi deltaY. Po spędzeniu dnia na dużej wysokości wzrasta stężenie BPG, więc krzywa wiązania hemoglobiny jest przesunięta w prawo, więc jest większe p50 co sprzyja oddawaniu tlenu w tkankach.
33. O wiązaniach
a)Arg może tworzyć mostki solne (oddziaływania elektrostatyczne) zarówno z Glu i jak i Asp
b) gr guanidynowa Asp może być donorem wiązania wodorowego dla Gln Asn Ser Thr Asp Glu i gr karboksylowej łańcucha gównego
c) coś o strukturze 4 rzędowej, że najprostszym przykładem jest cząsteczka z 4 podjednostkami
d) coś o mostkach dwusiarczkowych, że powstają przez utlenienie Met
A,
34. O przeciwciałach
a)przeciwciało rozpoznaje hapten na antygenie
b)o produkcji przeciwciał monoklonalnych- w wyniku fuzji z komórkami szpiczaka
c) coś że immunoglobuliny są kwasami nukleinowymi
B
a źle bo, hapteny- małe, obce cząsteczki, też mają epitopy i to te epitopy rozpoznaje przeciwciało
c źle bo immunoglobuliny=przeciwciała- to białka antygeny- to polisacharydy, kw nukleinowe lub białka
1
Punkty: 1
Wybierz prawidłowe zakończenie następującego zdania: RNA charakteryzuje się tym, że...
Wybierz co najmniej jedną odpowiedź
a. ... pełni rolę pośrednika w przepływie informacji genetycznej.
b. ... może być składnikiem rybosomu.
c. ... często zachodzi wewnątrzłańcuchowe parowanie zasad.
d. ... zawiera deoksyrybozę zamiast rybozy.
e. ... jest liniowym polimerem.
f. ... jego rdzeń jest zbudowany z powtarzających się jednostek cukrowo-fosforanowych.
poprawne:a,b,c,e,f
2
Punkty: 1
Które z poniższych stwierdzeń dotyczących różnych izoform hemoglobiny są prawdziwe?
Wybierz co najmniej jedną odpowiedź
a. Hemoglobina płodu ma wyższe powinowactwo do tlenu niż hemoglobina matki w nieobecności BPG.
b. Hemoglobina płodu ma wyższe powinowactwo do BPG niż hemoglobina matki.
c. Hemoglobina F przeważa w ciągu ostatnich sześciu miesięcy życia płodowego człowieka i ma budowę podjednostkową α2g2.
d. Hemoglobina o budowie podjednostkowej α2g2 ma wyższe powinowactwo do tlenu niż hemoglobina A.
e. Hemoglobina A2 przeważa na początkowym etapie życia płodowego człowieka i ma budowę podjednostkową α2δ2.
f. Hemoglobina A przeważa u dorosłego człowieka i ma budowę podjednostkową α2β2.
poprawne:d(jeżeli g to gamma), f
3
Punkty: 1
Ile wynosi punkt izoelektryczny pI argininy (pKα-COOH=1.80; pKα-NH2=9.00; pKArg=12.5)?
Wybierz jedną odpowiedź
a. 9.00
b. 14.30
c. 7.15
d. 12.15
e. 5.4
f. 7.76
g. 10.75
h. Żadna z podanych wartości nie jest prawdziwa.
poprawne: g
4
Punkty: 1
Które z poniższych stwierdzeń na temat wiązania kowalencyjnego są prawdziwe?
Wybierz co najmniej jedną odpowiedź
a. Żadne z wymienionych stwierdzeń nie jest prawdziwe.
b. Obecność cząsteczek wody osłabia oddziaływanie kowalencyjne.
c. Jest najsilniejszym wiązaniem występującym w związkach biochemicznych.
d. W utworzeniu wiązania wielokrotnego uczestniczy więcej niż jedna para elektronów.
e. Podwójne wiązanie C=C jest słabsze od pojedynczego wiązania C-C.
f. Podczas reakcji chemicznych dochodzi m. in. do zrywania wiązań tego rodzaju.
poprawne:b,c,d
5
Punkty: 2
Które z poniższych stwierdzeń na temat prędkości początkowej (Vo) oraz maksymalnej (Vmax) reakcji katalizowanej przez enzym zgodnie z modelem Michaelisa-Menten są prawdziwe?
Wybierz co najmniej jedną odpowiedź
a. Vo praktycznie nie zależy od stężenia substratu [S] dla [S]<<KM.
b. Vo praktycznie nie zależy od stężenia substratu [S] dla [S]>>KM.
c. Vmax jest liniowo proporcjonalna do stężenia substratu [S] dla każdego [S].
d. Vmax w ogóle nie zależy od stężenia substratu [S].
e. Vo jest liniowo proporcjonalna do stężenia substratu [S] dla [S]>>KM.
f. Vmax jest to Vo osiągana w warunkach [S]>>KM.
poprawne:b,d,f
6
Punkty: 1
Do której z poniższych grup aminokwasów należy glicyna?
Wybierz jedną odpowiedź
a. zawierające zasadowy łańcuch boczny.
b. zawierające łańcuch boczny z obecną grupą karboksyamidową.
c. zawierające alifatyczny łańcuch boczny.
d. zawierające alifatyczny łańcuch boczny z obecną grupą hydroksylową.
e. zawierające kwasowy łańcuch boczny.
f. zawierające w łańcuchu bocznym atom siarki.
g. zawierające aromatyczny łańcuch boczny.
poprawne: c
7
Punkty: 2
Standardowa zmiana entalpii swobodnej w warunkach biochemicznych podczas reakcji hydrolizy fruktozo-1-fosforanu (F-1-P) z utworzeniem fruktozy (F) i ortofosforanu (P) wynosi –5.0 kcal/mol. Stężenia początkowe reagentów wynoszą 10–6, 10–2 i 10–1 M odpowiednio dla F-1-P, F oraz P.
Temperatura T, w której zachodzi reakcja to 25 °C; R=2.0 cal/mol×K.
Proszę wskazać te z poniższych stwierdzeń, które są prawdziwe.
Wybierz co najmniej jedną odpowiedź
a. W warunkach zdefiniowanych jako początkowe reakcja przebiega w kierunku syntezy F-1-P.
b. W obecności enzymu katalizującego tę reakcję, w warunkach zdefiniowanych jako początkowe reakcja przebiegać będzie w kierunku syntezy F-1-P.
c. W warunkach standardowych spontanicznie zachodzić będzie hydroliza F-1-P.
d. ΔG°' dla tej reakcji wynosi około –0.9 kcal/mol.
e. Żadne ze stwierdzeń nie jest prawdziwe.
f. Stała równowagi wynosi około 1000 lub 4400 w zależności od tego czy obliczymy ją dla warunków początkowych, czy też dla warunków standardowych.
poprawne: c
8
Punkty: 1
Które z poniższych stwierdzeń dotyczących oczyszczania białek są prawdziwe?
Wybierz co najmniej jedną odpowiedź
a. Dializa jest podstawową metodą używaną do rozdziału białek niewiele różniących się wielkością.
b. W procesie oczyszczania białka metodą chromatografii powinowactwa wykorzystuje się np. specyficzne oddziaływanie białka z przeciwciałami.
c. Podczas chromatografii metodą filtracji żelowej najszybciej poruszają się i wypływają z kolumny najmniejsze białka.
d. Podczas frakcjonowania białek wykorzystuje się ich zmniejszoną rozpuszczalność w stężonych roztworach niektórych soli.
e. Do związania białka o charakterze zasadowym z kolumną do chromatografii jonowymiennej używa się anionitu.
poprawne: b,d
9
Punkty: 1
Które z poniższych stwierdzeń dotyczących modelu sekwencyjnego i jednoprzejściowego zmian allosterycznych w hemoglobinie są prawdziwe?
Wybierz co najmniej jedną odpowiedź
a. Model jednoprzejściowy zakłada możliwość istnienia tetramerów hemoglobiny składających się tylko z podjednostek o takiej samej konformacji.
b. Dane eksperymentalne wskazują, że rzeczywiste zmiany allosteryczne zachodzące w przypadku hemoglobiny są zgodne tylko z modelem sekwencyjnym.
c. Dane eksperymentalne wskazują, że rzeczywiste zmiany allosteryczne zachodzące w przypadku hemoglobiny są zgodne tylko z modelem jednoprzejściowym.
d. Model sekwencyjny zakłada możliwość istnienia tetramerów hemoglobiny składających się z podjednostek o różnej konformacji.
e. Model sekwencyjny zakłada, że tetramer hemoglobiny może występować tylko w jednej z dwóch konformacji – R lub T.
f. Model jednoprzejściowy zakłada, że związanie liganda z podjednostką zmienia bezpośrednio konformację tylko tej podjednostki.
poprawne:a,d
10
Punkty: 2
Ile wynosi stosunek formy zasadowej do formy kwaśnej dla grupy karboksylowej lizyny (pKa=2.2) w pH=0.8?
Wybierz jedną odpowiedź
a. 0.40
b. 5.1
c. żaden z wymienionych
d. 0.060
e. 0.040
f. 25.1
Odpowiedź 0,040 - e
1
Punkty: 1
Które z poniższych stwierdzeń na temat wiązania kowalencyjnego są prawdziwe?
Wybierz co najmniej jedną odpowiedź
a. Podwójne wiązanie C=C jest słabsze od pojedynczego wiązania C-C.
b. Obecność cząsteczek wody osłabia oddziaływanie kowalencyjne.
c. Jest najsilniejszym wiązaniem występującym w związkach biochemicznych.
d. Żadne z wymienionych stwierdzeń nie jest prawdziwe.
e. Podczas reakcji chemicznych dochodzi m. in. do zrywania wiązań tego rodzaju.
f. W utworzeniu wiązania wielokrotnego uczestniczy więcej niż jedna para elektronów.
Poprwne: b,c,f
2
Punkty: 1
Które z poniższych stwierdzeń dotyczących modelu sekwencyjnego i jednoprzejściowego zmian allosterycznych w hemoglobinie są prawdziwe?
Wybierz co najmniej jedną odpowiedź
a. Model jednoprzejściowy zakłada, że związanie liganda z podjednostką zmienia bezpośrednio konformację tylko tej podjednostki.
b. Dane eksperymentalne wskazują, że rzeczywiste zmiany allosteryczne zachodzące w przypadku hemoglobiny są zgodne tylko z modelem jednoprzejściowym.
c. Model jednoprzejściowy zakłada możliwość istnienia tetramerów hemoglobiny składających się tylko z podjednostek o takiej samej konformacji.
d. Model sekwencyjny zakłada, że tetramer hemoglobiny może występować tylko w jednej z dwóch konformacji – R lub T.
e. Dane eksperymentalne wskazują, że rzeczywiste zmiany allosteryczne zachodzące w przypadku hemoglobiny są zgodne tylko z modelem sekwencyjnym.
f. Model sekwencyjny zakłada możliwość istnienia tetramerów hemoglobiny składających się z podjednostek o różnej konformacji.
Poprawne: c, f
3
Punkty: 2
Standardowa zmiana entalpii swobodnej w warunkach biochemicznych podczas reakcji hydrolizy fruktozo-1-fosforanu (F-1-P) z utworzeniem fruktozy (F) i ortofosforanu (P) wynosi –5.0 kcal/mol. Stężenia początkowe reagentów wynoszą 10–6, 10–2 i 10–1 M odpowiednio dla F-1-P, F oraz P.
Temperatura T, w której zachodzi reakcja to 25 °C; R=2.0 cal/mol×K.
Proszę wskazać te z poniższych stwierdzeń, które są prawdziwe.
Wybierz co najmniej jedną odpowiedź
a. W warunkach standardowych spontanicznie zachodzić będzie hydroliza F-1-P.
b. W warunkach zdefiniowanych jako początkowe reakcja przebiega w kierunku syntezy F-1-P.
c. ΔG°' dla tej reakcji wynosi około –0.9 kcal/mol.
d. W obecności enzymu katalizującego tę reakcję, w warunkach zdefiniowanych jako początkowe reakcja przebiegać będzie w kierunku syntezy F-1-P.
e. Żadne ze stwierdzeń nie jest prawdziwe.
f. Stała równowagi wynosi około 1000 lub 4400 w zależności od tego czy obliczymy ją dla warunków początkowych, czy też dla warunków standardowych.
Poprawna: a
4
Punkty: 1
Które z poniższych stwierdzeń dotyczących różnych izoform hemoglobiny są prawdziwe?
Wybierz co najmniej jedną odpowiedź
a. Hemoglobina A2 przeważa na początkowym etapie życia płodowego człowieka i ma budowę podjednostkową α2δ2.
b. Hemoglobina o budowie podjednostkowej α2g2 ma wyższe powinowactwo do tlenu niż hemoglobina A.
c. Hemoglobina F przeważa w ciągu ostatnich sześciu miesięcy życia płodowego człowieka i ma budowę podjednostkową α2g2.
d. Hemoglobina płodu ma wyższe powinowactwo do tlenu niż hemoglobina matki w nieobecności BPG.
e. Hemoglobina A przeważa u dorosłego człowieka i ma budowę podjednostkową α2β2.
f. Hemoglobina płodu ma wyższe powinowactwo do BPG niż hemoglobina matki.
poprawne: b(jeżeli g to gamma), e
5
Punkty: 1
Ile wynosi punkt izoelektryczny pI argininy (pKα-COOH=1.80; pKα-NH2=9.00; pKR=12.5)?
Wybierz jedną odpowiedź
a. 5.4
b. 14.30
c. 9.00
d. 10.75
e. Żadna z podanych wartości nie jest prawdziwa.
f. 12.15
g. 7.15
h. 7.76
d
6
Punkty: 1
Wybierz prawidłowe zakończenie następującego zdania: RNA charakteryzuje się tym, że...
Wybierz co najmniej jedną odpowiedź
a. ... jego rdzeń jest zbudowany z powtarzających się jednostek cukrowo-fosforanowych.
b. ... zawiera deoksyrybozę zamiast rybozy.
c. ... jest liniowym polimerem.
d. ... pełni rolę pośrednika w przepływie informacji genetycznej.
e. ... często zachodzi wewnątrzłańcuchowe parowanie zasad.
f. ... może być składnikiem rybosomu.
poprawne: a, c, d, e, f
7
Punkty: 1
Które z poniższych stwierdzeń dotyczących oczyszczania białek są prawdziwe?
Wybierz co najmniej jedną odpowiedź
a. Podczas frakcjonowania białek wykorzystuje się ich zmniejszoną rozpuszczalność w stężonych roztworach niektórych soli.
b. Do związania białka o charakterze zasadowym z kolumną do chromatografii jonowymiennej używa się anionitu.
c. Dializa jest podstawową metodą używaną do rozdziału białek niewiele różniących się wielkością.
d. W procesie oczyszczania białka metodą chromatografii powinowactwa wykorzystuje się np. specyficzne oddziaływanie białka z przeciwciałami.
e. Podczas chromatografii metodą filtracji żelowej najszybciej poruszają się i wypływają z kolumny najmniejsze białka.
poprawne: a, d,
8
Punkty: 2
Ile wynosi stosunek formy zasadowej do formy kwaśnej dla grupy karboksylowej lizyny (pKa=2.2) w pH=0.8?
Wybierz jedną odpowiedź
a. 0.060
b. 25.1
c. 0.40
d. 5.1
e. 0.040
f. żaden z wymienionych
e = 0,040
9
Punkty: 1
Do której z poniższych grup aminokwasów należy glicyna?
Wybierz jedną odpowiedź
a. zawierające alifatyczny łańcuch boczny.
b. zawierające alifatyczny łańcuch boczny z obecną grupą hydroksylową.
c. zawierające łańcuch boczny z obecną grupą karboksyamidową.
d. zawierające zasadowy łańcuch boczny.
e. zawierające kwasowy łańcuch boczny.
f. zawierające aromatyczny łańcuch boczny.
g. zawierające w łańcuchu bocznym atom siarki.
a
10
Punkty: 2
Które z poniższych stwierdzeń na temat prędkości początkowej (Vo) oraz maksymalnej (Vmax) reakcji katalizowanej przez enzym zgodnie z modelem Michaelisa-Menten są prawdziwe?
Wybierz co najmniej jedną odpowiedź
a. Vo jest liniowo proporcjonalna do stężenia substratu [S] dla [S]>>KM.
b. Vmax w ogóle nie zależy od stężenia substratu [S].
c. Vo praktycznie nie zależy od stężenia substratu [S] dla [S]<<KM.
d. Vmax jest to Vo osiągana w warunkach [S]>>KM.
e. Vo praktycznie nie zależy od stężenia substratu [S] dla [S]>>KM.
f. Vmax jest liniowo proporcjonalna do stężenia substratu [S] dla każdego [S].
Poprawne: b,d, e