Wszelakie koszty i wydatki na infrastrukturę wodną śródlądową są ponoszone przez różne resorty, a w szczególności przez:
Ministerstwo Środowiska
Ministerstwo Infrastruktury
Ministerstwo Rolnictwa i Rozwoju Wsi
Ministerstwo Spraw wewnętrznych i Administracji
Pozostałe.
Na podstawie analizy wszystkich wydatków, odnoszących się do przepisów Unii Europejskiej, koszty infrastruktury śródlądowych dróg wodnych można usystematyzować w sposób uwzględniający przedstawione definicje. Rodzaje i strukturę wydatków na infrastrukturę dróg wodnych przedstawiono w tabeli:
Z przeprowadzonej analizy wynika, że koszty infrastruktury transportu wodnego są przenoszone przez różne resorty oraz, że elementy kosztów odnoszą się do:
wyłącznie transportu wodnego
potrzeb wielozadaniowych, w tym transportu wodnego
potrzeb nie obciążających transportu wodnego.