Białka integralne znajdują się w podwójnej warstwie lipidowej. Białka perferyczne są położone na powierzchni błony.
Białka błonowe:
Wewnętrzna np. ATP-aza
Zewnętrzne
Środkowe (peryferyczne i transmembranowe)
Białka:
Struktury
Enzymatyczne
Kanałowe (permeazy, translokazy)
Generujące ruch: lateralny, typu flip-flop
niepolarne cząsteczki hydrofobowe (przechodzą) | azot, tlen, alkohol benzylowy, metan, tlenek azotu (I), wodór |
---|---|
małe cząsteczki bez ładunku (przechodzą) | woda, mocznik, glicerol, tlenek węgla (IV) |
duże cząsteczki polarne bez ładunku | glukoza, sacharoza |
jony | sodu, potasu, magnezu, wapnia, wodorowęglanowe, chlorkowe, wodorofosforanowe (V) |
duże cząsteczki polarne z ładunkiem | glukozo-6-fosforan 2-, glukoza |
Prosta dyfuzja – zgodnie z gradientem stężeń, nie zmienia się struktura chemiczna substancji.
Dyfuzja ułatwiona – kanał białkowy specyficzny dla danego związku, bez użycia energii, zgodnie z gradientem stężeń, nie powoduje zmiany struktury chemicznej substancji transportowanej.
Transport aktywny – z użyciem energii, transportowany związek nie zmienia struktury chemicznej.
Translokacja grupowa – związek transportowany zmienia swoją strukturę (zostaje ufosforylowany, resztą fosforanową z fosfoenolopirogronianu), transportowane związki: glukoza, fruktoza, mannoza, N-acetyloglukozamina, galaktiol, mannitol, sorbitol, ksylitol.
Mechanizm specyficzny dla transportu glukozy. Jeśli w podłożu znajduje się glukoza, żaden inny cukier nie jest transportowany.
Glukoza | Galactiol |
---|---|
Mannoza | Mannitol |
Fruktoza | Sorbitol |
N-acetyloglukozamina | Xylitol |
PEP – fosfoenolopirogronian
EI, HPr - białka transportowe w cytozolu
EIIA i EIIB – cytozolowe
EIIC – kanał transmembranowy
Gdy stężenie glukozy jest wysokie, rośnie też stężenie defosfo-EIIA. Następuje inhibicja cyklazy adenylowej i spadek stężenia cAMP.
Energia: Δp (główne źródło energii), ATP, PEP
Δp – potencjał protonowy utrzymywany dzięki stałemu wypompowywaniu na zewnątrz jonów: H+ lub Na+. Może to być połączone z jednoczesnym transportem innego związku, jonu czy kwasu (symport, antysport).
Transport pierwotny – nieodwracalny, jeden element, jednokierunkowy
Energia: przenoszenie elektronów, pompy jonowe zależne od ATP (ATP-azy), lub dekarboksylacji (charakterystyczne dla procaryota), np. szczawiooctanu, czy metylomalonyloCo-A.
Transport indukowany specyficzny dla żelaza.
Pseudomona putida, P. aeruginosa – indukcja sideroforów, gdy w podłożu są jony Fe3+.
Siderofor fenolowy – 6 grup OH – związek chelatujący
Lamelle: Nitrococcus, Nitrobacter, Nitrosomonas.
Chromatofory – struktury zawierające barwniki fotosyntetyczne; Chromatium okenii.
Rurki: Thiocapsa pfennigii
Stosy: Ectothiorodaspiria mobilis
Mezosom – element strukturalny bakterii, powstaje podczas dzielenia się komórek bakteryjnych w wyniku tworzenia się septum (nie bierze udziału przemianach energii!).
Polihydroksymaślan – materiał zapasowy w warunkach głodowych
Cyjanoficyna – cyjanobakterie (Asp, Arg – rezerwy azotu)
Glikogen bakteryjny
Magnetosomy
Polihydroksymaślan najłatwiej zaobserwować u Bacillus cereus.
Polifosforany – granule metachromatyczne – zmeiniające kolor; Pseudomonas aeroginosa.
Cyjanoficyna – pęcherzyki białkowe, dodatkowe białka na zewnątrz; Nostoc coreum.
Karboksysomy – białka zatzymujące CO2 u bakterii zależnych od CO2 (obligatoryje autotrofy); Thiobacillus.
Cytoplazma u bakterii jest miejscem, w którym zachodzą procesy metaboliczne, replikacja DNA i biosynteza białek.
Struktuy:
Rybosomy
Białko 40%, rRNA 60%
Wolne – niezwiązane z innymi strukturami – charakterystyczne dla bakterii
Przyłączone do błon tylko w trakcie biosyntezy białek (polisomy)
Podjednostki – 30S, 50S
Rejon jądrowy DNA
Bezpośrednio zawieszone w cytoplazmie
Chromosom bakteryjny – pojedynczy, kolisty nukleoid.
Podwójna helisa, superhelisa – wiele pętli (nawet do 43).
Przyłączony do błony cytoplazmatycznej
80% DNA, 10% RNA, 10% białek
Dodatkowe DNA – episomy (w postaci liniowej lub zamkniętej, nie ma możliwości do autoreplikacji), plazmidy (podobni jak episomy, jednak ze zdolnością do autoreplikacji); charakterystyczne dla bakterii.
Formowane wewnątrz komórki wegetatywnej.
Najtrwalsze formy przetrwalne.
Zawierają tylko ok. 15% wody.
Charakterystyczne dla: Clostridium, Bacillus, Sporolactobacillus, Sporosarcina, Desulfotomaculum
Thermoacrinomyces – formują mycelia o cechach endospory.
Położenie endospor (cecha gatunkowa, pozwalająca charakteryzować bakterie): terminalne, centralne, subterminalne.
Inwaginacja – tworzenie septum.
Zawsze tworzenie sporów poprzedza replikacja DNA.
Protoplast akumuluje Ca2+ i kwas dipikolinowy. Daje to odporność na temperaturę.
Kiełkowanie sporów może być zainicjowany przez: obecność aminokwasów (L-ala), impuls temperaturowy (ok. 650C), warunki utleniające, adenozyna, zmiana pH.
Większa zawartość wody, a więc większa wrażliwość na temperaturę i wysychanie, niż endospory.
Cysty – zmieniona postać wegetatywna; bakterie glebowe Azotobacter; bakterie śluzowe: Myxobacteria, Methylocystis.
Egzospory – pączkowanie; Methylosinus, Trichosporium.
Miksospory – przemiana całych komórek; dużo mniejsze od pozostałych form wegetatywnych; bakterie śluzowe: Myxococcus, Spoocytophaga.
Konidia – pseudogrzybnia, końcowe mikroorganizmy, promieniowce: Aetinomycetales – jako forma rozmnażania.