Raport z ćwiczenia I
Grupa II
Temat: Skrining środowiskowy.
Wstęp teoretyczny
Skrining srodowiskowy jest to poszukiwanie mikroorganizmów (grzybów, promieniowców o znaczeniu biotechnologicznym). Obejmuje proces zabiegów mających na celu wykrycie i wyizolowanie spośród ogromnej liczby drobnoustrojów tych, które odpowiadają stawianym wymaganiom biotechnologicznym.
Przydatne biotechnologicznie mikroorganizmy powinny być:
-dostępne w postaci czystej kultury i łatwe do przechowywania przez dłuższy okres
czasu
-stabilne genetycznie i łatwo ulegać manipulacjom genetycznym
-proste w hodowli na dużą skale i na łatwo dostępnych podłożach przemysłowych
-mikroorganizm nie może być patogenny
Preparaty enzymatyczne należą do najlepiej rozwiniętego działu biotechnologii. Ich produkcja jest możliwa dzięki naturalnej zdolności mikroorganizmów do produkcji szerokiej gamy enzymów, np. lipazy i proteazy.
Technologia produkcji preparatów enzymatycznych obejmuje m. in. wybór mikroorganizmu, przygotowanie hodowli, zaszczepienie podłoża produkcyjnego, biosyntezę enzymu, wydzielenie i zagęszczenie preparatu enzymatycznego.
Materiały i metody
Selekcje szczepów bakteryjnych wykonano poprzez serie rozcieńczeń próbek pochodzących z różnych środowisk: woda, gleba, osad czynny, osad denny.
Z dwóch ostatnich rozcieńczeń danej próby wykonano wysiew tarty na pożywkę stałą. Pożywka do izolacji bakterii lipolitycznych zawierała trójbutrynę, a do izolacji bakterii proteolitycznych odtłuszczone mleko w proszku. Płytki z pożywkami inkubowano przez 7 dni w temperaturze 20°C. Następnie po upływie 7 dni zliczano kolonie bakterii oraz przenoszono 3 najbardziej aktywne szczepy lipolityczne i proteolityczne z każdego środowiska do pożywki płynnej. Próby inkubowano przez kolejne 7 dni w temperaturze 26°C.
Po upływie 7 dni oznaczano aktywność lipazy i aminopeptydazy w hodowlach. Użyto 2 substratów: MUF-butyrate do oznaczania lipazy i MCA-lecine do oznaczania aminopeptydazy.
Hodowle bakterii lipolitycznych i proteolitycznych poddano wirowaniu 10tys obrotów/min przez 10 minut w temperaturze 4°C aby oddzielić płyn pohodowlany zawierający dany enzym (lipazy lub aminopeptydazy) od biomasy komórek.
Następnie przygotowano mieszaninę reakcyjną w dwóch próbach dla każdego enzymu. W tym celu pobrano po 1ml płynu pohodowlanego i dodano do niego 0,125ml buforu fosforanowego i 0,125ml odpowiedniego substratu. Wykonano także próbę kontrolną nie zawierającą substratu.
Po wykonaniu prób mierzono ich aktywność.
Wyniki:
Strefy przejaśnienia wokół bakterii są charakterystyczne dla drobnoustrojów proteolitycznych i lipolitycznych dzięki czemu łatwiej odróżnić je od pozostałych.
T-pożywka z trójbutryną, M-pożywka z odtłuszczonym mlekiem
X=a*R/v
a-średnia ze zliczonych bakterii
R-rozcieńczenie
v-objętość
Nr.próby |
Środowisko |
Pożywka |
Rozcieńczenie |
Ilość bakterii |
Średnia ilość bakterii |
X |
1 |
woda |
T |
10^3 |
8 |
|
|
2 |
woda |
T |
10^3 |
4 |
6 |
60000 |
3 |
woda |
M |
10^3 |
14 |
|
|
4 |
woda |
M |
10^3 |
7 |
10,5 |
105000 |
5 |
woda |
T |
10^2 |
26 |
|
|
6 |
woda |
T |
10^2 |
8 |
17 |
17000 |
7 |
woda |
M |
10^2 |
21 |
|
|
8 |
woda |
M |
10^2 |
20 |
20,5 |
20500 |
Nr.próby |
Środowisko |
Pożywka |
Rozcieńczenie |
Ilość bakterii |
Średnia ilość bakterii |
X |
1 |
osad czynny |
T |
10^6 |
1 |
|
|
2 |
osad czynny |
T |
10^6 |
1 |
1 |
10.000000 |
3 |
osad czynny |
M |
10^6 |
1 |
|
|
4 |
osad czynny |
M |
10^6 |
0 |
0,5 |
5.000000 |
5 |
osad czynny |
T |
10^5 |
1 |
|
|
6 |
osad czynny |
T |
10^5 |
1 |
1 |
1.000000 |
7 |
osad czynny |
M |
10^5 |
2 |
|
|
8 |
osad czynny |
M |
10^5 |
1 |
1,5 |
1.500000 |
Nr.próby |
Środowisko |
Pożywka |
Rozcieńczenie |
Ilość bakterii |
Średnia ilość bakterii |
X |
1 |
gleba |
T |
10^3 |
11 |
|
|
2 |
gleba |
T |
10^3 |
12 |
11,5 |
115000 |
3 |
gleba |
M |
10^3 |
0 |
|
|
4 |
gleba |
M |
10^3 |
0 |
0 |
0 |
5 |
gleba |
T |
10^4 |
2 |
|
|
6 |
gleba |
T |
10^4 |
3 |
2,5 |
250000 |
7 |
gleba |
M |
10^4 |
1 |
|
|
8 |
gleba |
M |
10^4 |
0 |
0,5 |
50000 |
Nr.próby |
Środowisko |
Pożywka |
Rozcieńczenie |
Ilość bakterii |
Średnia ilość bakterii |
X |
1 |
osad denny |
T |
10^4 |
1 |
|
|
2 |
osad denny |
T |
10^4 |
0 |
0,5 |
50000 |
3 |
osad denny |
M |
10^4 |
16 |
|
|
4 |
osad denny |
M |
10^4 |
8 |
12 |
1200000 |
5 |
osad denny |
T |
10^5 |
0 |
|
|
6 |
osad denny |
T |
10^5 |
0 |
0 |
0 |
7 |
osad denny |
M |
10^5 |
0 |
|
|
8 |
osad denny |
M |
10^5 |
0 |
0 |
0 |
Pochodzenie szczepu |
Aktywność lipazy μmol MUF/l/h, aktywność całkowita |
Aktywność aminopeptydazy μmol MLA/l/h, aktywność całkowita |
Gleba |
2,305 3,908 |
2,410 3,346 |
Woda |
2,264 5,228 |
1,026 |
Osad czynny |
2,931 4,662 |
2,59 2,898 |
Osad denny |
2,662 |
0 0 |
4) Wnioski: Szczepy występujące w glebie charakteryzują się wysoką aktywnością enzymów.
Brak jakiejkolwiek aktywności aminopeptydazy, w przypadku bakterii występujących w osadzie dennym, może świadczyć o nieobecności aminopeptydazy w podłożu bądź o źle zaszczepionych próbach.