Biotechnologia
1. integracja nauk przyrodniczych i inżynieryjnych w celu zastosowania organizmów, komórek lub ich części oraz molekularnych analogów w celu pozyskania produktów i usług
Dyscyplina na pograniczu nauk
- biologicznych (genetyki, mikrobiologii, biochemii)
- chemicznych
- medycznych
- techniki
Wykorzystuje żywe komórki lub ich fragmenty do celów gospodarczych
- wytwarzanie substancji
- szybkie rozmnażanie organizmów
Procesy biotechnologiczne
Fermentacja z użyciem drożdży wykorzystywana w produkcji chleba, piwa, wina, przetworów mlecznych, kiszonych produktów roślinnych
Produkcja przemysłowa - kwasu mlekowego, kwasu cytrynowego, preparatów enzymatycznych, acetonu, butanolu, penicyliny
Inżynieria chemiczna:
- identyfikacja bioproduktów
- wydzielanie bioproduktów
- oczyszczanie bioproduktów
Wykorzystanie kultur in vitro do produkcji:
- szczepionek antywirusowych
- wtórnych metabolitów roślinnych
Biologia molekularna
- inżynieria genetyczna (wytwarzanie insuliny ludzkiej w komórkach bakteryjnych)
- zsekwencjonowanie genu (bakterii, drożdży, nicieni, muszki owocowej, rzodkiewnika pospolitego, 95% genomu człowieka)
- rośliny transgeniczne
Rośliny transgeniczne
Organizmy wyższe, którym wprowadzono gen przekazywany następnym pokoleniem zgodnie z podstawowymi prawami dziedziczenia.
transgeniczna bawełna zawiera niewielką domieszkę poliestru
transgeniczne pomidory maja przedłużona trwałość przechowywania
transgeniczny tytoń odporny na herbicydy
transgeniczne ziemniaki produkują białko odpowiedzialne za ciśnienie krwi ludzkiej.
Fuzja - połączenie komórek różnych roślin (mieszańce międzygatunkowe)
Transformacja - modyfikacja poprzez mutacje
Organogeneza - odtworzenie roślin - klonowanie.
Embriogeneza - namnażanie embrionów
Wartość rynku biotechnologicznego
produkty rolne i żywnościowe w UE w 2005 r. 175 mld euro
wprowadzenie apomiksji do ryżu (rozmarzanie bez zapłodnienia) 2,5mld $ rocznie
wzrost zawartości suchej masy w owocach pomidora o 0,5% w USA 35mld$ rocznie
straty powodowanie przez nicienie 100mld$ rocznie
Wartość odmianowa roślin GMO
predyspozycje genetyczne umożliwiające produkcję roślin w trudnym środowisku - bez jego zmian
rośliny odporne na choroby lub szkodniki - bez stosowanie zabiegów ochronnych
w ziarnie więcej białka - bez dodatku konserwantów
kwiaty barwne, wysmukłe i pachnące - bez chemikaliów.
Zagrożenia wynikające ze stosowania biotechnologii:
- manipulacja niebezpiecznym materiałem genetycznym (onkogeny, drobnoustroje chorobotwórcze, kultury komórkowe nowotworów)
- bioterroryzm (broń biologiczna np. wąglik)
- alergiczne działanie białka w kukurydzy Star Link (wprowadzono gen odpowiedzialny za produkcję toksyny bakteryjnej Bt, kukurydza ta może być wyłączeni składnikiem pasz zwierzęcych
- możliwość przenoszenia na konsumenta odporności na antybiotyki.
Ważne daty:
1839 - Schwann i Schleiden - teoria totipotencji komórki - komórkowa budowa wszystkich organizmów
1902 - Hanning - zasady hodowli komórek, tkanek i organów
1937 - Went i Thimann - wpływ IAA na rośliny
1948 - Skoog i Tsui - ustalenie stosunku auksyn do adeniny w pożywce do regeneracji pędów i korzeni z kalusa tytoniu
1952 - Morel i Martin - bezwirusowe dalie z kultur merystemów wierzchołkowych
1954 - Muir i inni - regeneracja pierwszej rośliny z pojedynczej komórki
1956 - Miller i Skoog i Okumara - oznaczenie kinetyny
1962 - Murashige-Skoog - skład uniwersalnej pożywki
1969 - Ericsson i Jonassen - izolacja protoplastu z kultury zawiesinowej
1973 - odkrycie plazmidu Ti u Agrobacterium tumefacjens
Czynniki wzrostu produkcji roślin uprawnych:
- postęp biologiczny
- ochrona roślin
- agrotechnika
Metody kultury in vitro
Cel stosowania kultury in vitro:
szybkie wprowadzenie na rynek nowych odmian
rozmnażanie genotypów trudno korzeniących się
uzyskanie zdrowego i juwenilnego materiału matecznego do dalszej reprodukcji
uzyskanie materiału matecznego, wyrównanego genotypowo i fenotypowo - wszystkie rośliny są takie same jak roślina mateczna
uzyskanie potomstwa wolnego od chorób wirusowych
hodowla twórcza nowych form roślin
banki genów (przechowalnie tkanek roślinnych przez długi czas w warunkach in vitro)
Etapy kultury in vitro:
uzyskanie sterylnej kultury
masowe namnażanie pędów
ukorzenienie in vitro
aklimatyzacja roślin w szklarni
Zdolność morfologiczna komórek roślinnych.
Totipotencja komórki - nieograniczona zdolność do dzielenia się oraz odtworzenia poszczególnych organów i całego organizmu
Wszystkie komórki rośliny zawierają taka sama informację genetyczną powielona z zygoty
Zróżnicowanie morfologiczne i funkcjonale komórki jest sterowane genetycznie i wynika z zablokowania niektórych genów.
Zdolność do podziałów i wzrostu w kulturze in vitro jest odwrotnie proporcjonalne do:
- stopnia zróżnicowania komórek
- specjalizacji komórek
Dyferencjacja - odróżnicowanie niezbędne do ponownego podjęcia podziałów komórkowych - uaktywnienia zablokowanych genów
Bodźce wyzwalające dyferencjację w kulturach in vitro
- odizolowanie komórek i tkanek od rośliny matecznej
- wpływ regulatorów wzrostu zastosowanych w pożywce
Redyferencjajca - powtórne różnicowanie 0dmłodzonych komórek - ponowne zablokowanie genów.
Komórki przydatne do kultur in vitro posiadają:
- żywotne jądro komórkowe
- nieuszkodzone błony plazmatyczne
- cienkie ściany
Eksplantaty najbardziej przydatne do kultur in vitro:
komórki merystemów wierzchołkowych, bocznych i interkalarnych
- wierzchołki korzenia i pędu
- zawiązki pędów bocznych
fragmenty roślin zawierające komórki kambialne
- perycykl - okolnica - zewnętrzna warstwa komórek walce osiowego w której powstają zawiązki korzeni bocznych
- promienie rdzeniowe - przewodzą i gromadzą substancje zapasowe
- wiązki przewodzące (sitowo naczyniowe)
tkanki zdolne do odróżnicowania
- komórki parenchymatyczne rdzenia (komórki miękiszowe)
- bulwy
- kora łodygowa i korzeniowa
- niektóre komórki skórki
Komórki nieprzydatne do kultur in vitro:
komórki zróżnicowane i wyspecjalizowane pod względem strukturalnym i fizjologicznym:
- komórki przyszparkowe
- cewki
- włókna
- komórki włośników wydzielniczych
- komórki sklerenchymy
Organogeneza in vitro:
bezpośrednia
- na eksplantacje tworzą się korzenie, pędy i zarodki
pośrednia
- organogenezę poprzedza powstanie kalusa
- w kalusie tworzą się centra komórek merystematycznych
Powstanie organów w kulturach in vitro:
z merystemów wierzchołkowych z eksplantatem
z tkanek zorganizowanych
- międzywęźla łodygowe
- blaszki liściowe
- liścienie
- strefa wydłużenia komórek w korzeniu
z tkanek niezorganizowanych
- z kallusa
Pochodzenie organu przybyszowego:
od jednej komórki merystematycznej
od grupy komórek działających w sposób skoordynowany
z grupy komórek odmiennych genetyczne - organ będzie chimerą
Zdolność rośliny do regeneracji in vitro:
rośliny okrytonasienne (wysoka)
- rośliny dwuliścienne (+++)
- rośliny jednoliścienne (++)
rośliny nagonasienne (niska)
gatunki o dużej zdolności morfologicznej (zielne) tytoń, begonia
gatunki słabo regenerujące - rośliny drzewiaste
Czynniki od których zależy zdolność roślin do regeneracji in vitro:
stan fizjologiczny rośliny wyjściowej
zdrowotność rośliny wyjściowej
położenie tkanek w roślinie - lepiej regeneruje górna część korzenia
Materiał roślinny do hodowli in vitro:
merystemy wierzchołkowe
merystemy z pędów przybyszowych, bocznych lub śpiących
fragmenty liści
fragmenty pędów kwiatostanowych
Składniki pożywki
makroelementy N, S, P, K, Mg, Ca, Cl
mikroelementy Fe, B, Cu, Mn, Mo, Zn
ultramikroelementy Ca, J, Al., Ni
Regulatory wzrostu
auksyny naturalne
- IAA kwas indolilo-3-octowy
- IBA kwas indolilo-3-masłowy
- PAA kwas fenylooctowy
6. auksyny syntetyczne:
- NAA kwas naftylo-1-octowy
- 2,4D kwas 2,4-dichlorofenoksyoctowy
- dicamba kwas 2-metoksy-3,6-dichlorobenzoesowy
- picloram kwas 4-amino-3,5,6-trichloropikolinowy
7. auksyny naturalne:
- Zea - zeatyna
- 2iP 6(γγ-dinetyloalliloamino)puryna
8. cytokininy syntetyczne
- K kinetyka
- BA benzyloaminopuryna
- BPA tetrahydropiranylobenzyloadenina
- TDZ tidiazuron
gibereliny GA3
inhibitory wzrostu ABA
witaminy B1, B6, H, PP, C
aminokwasy - glicyna pepton
węglowodany - sacharoza, glukoza, fruktoza
inozytol
agar (0,6-1%) lub gerlite (0,2%)
węgiel aktywny (0,02-0,035)
naturalne substancje biologicznie czynne (mleczko kokosowe, drożdże, sok ananasowy, sok topoli, miękisz dojrzałych bananów, wyciąg z gotowanych ziemniaków)
odczyn pożywki powinien wynosić os pH 4,8 do 5,7
Ustalenie pH pożywki przed dodaniem agaru i sterylizacją w autoklawie za pomocą 1nNaOH 1nHCl
Pożywka Knudsona 1946
Ca(NO3)2 * 4H2O 100mg*l-1
(NH4)2SO4 500 mg*l-1
MgSO4 * 7H2O 250 mg*l-1
KH2PO4 250 mg*l-1
MnSO4 * 4H2O 7,5 mg*l-1
FeSO4 * 7H2O 25 mg*l-1
Sacharoza 20g*l-1
Pożywka Murashige i Skooga 1962
KNO 1900 mg*l-1
NH4NO3 1650 mg*l-1
MgSO4 * 7H2O 370 mg*l-1
KH2PO4 170 mg*l-1
CaCl *2H2O 440 mg*l-1
KJ 0,83 mg*l-1
H3BO4 6,2 mg*l-1
MnSO4*4H2O 22,3 mg*l-1
ZnSO4 * 7H2O 8,6 mg*l-1
NaMoO * 2H2O 0,25 mg*l-1
FeSO4*7H2O 27,8 mg*l-1
Na2EDTA 37,2 mg*l-1
CuSO4*5H2O 0,025 mg*l-1
CoCl * 6H2O 0,025 mg*l-1
Sacharoza30 g*l-1
Mioinozytol 10 g*l-1
Kwas nikotynowy PP 0,5 g*l-1
B6 0,5 g*l-1
B1 0,1 g*l-1
MAKROELEMENTY
Azot N
Wchodzi w skład:
- białek w tym enzymów
- aminokwasów
- kwasów nukleinowych
Formy azotu dodawane do pożywek:
* nieorganiczna
- azotanowa KNO
- amonowa NH4NO3
* organiczna
- aminokwasy
- peptony
-białko
Siarka S
Wchodzi w skład:
- aminokwasów (cystyna cysteina)
- peptydów i białek
- witamin (biotyna -H, tiamina-B1)
- koenzym A
- olejków eterycznych (cebula czosnek)
-penicyliny
Formy siarki dodawane do pożywek:
* nieorganiczna - siarczanowa MgSO4 * 7H2O
* organiczna - aminokwasy, witaminy, preparaty białkowe
Fosfor P
Wchodzi w skład:
- cukrowców
- nukleotydów
- kwasów nukleinowych
- fosfolipidów
- koenzymów
Formy fosforu dodawane do pożywek:
* nieorganiczna - fosforany KH2PO4
* organiczna
Chlor Cl
Wchodzi w skład:
- w procesie fotosyntezy (aktywuje transport elektronów między cytochromami)
- w transporcie asymilantów
- w syntezie białka
Formy chloru dodawane do pożywek:
* nieorganiczna - chlorki CaCl2 CoCl2
Potas K
Występuje w komórkach w formie jonowej
Bierze udział:
- w regulacji gospodarki wodnej
- aktywuje 40 enzymów
- utrzymuje plazmę w stanie optymalnej hydratacji
Formy potasu dodawane do pożywek:
* nieorganiczna - azotany KNO3, chlorki KCl, fosforany KH2PO4
Wapń Ca
Bierze udział:
- w formowaniu membran w organellach i ścianach komórkowych
- utrzymuje selektywność w transporcie jonów przez błony cytoplazmatyczne
- w polarnym transporcie auksyn
- aktywuje α-amylazę
Formy wapnia dodawane do pożywek:
* nieorganiczna - chlorek wapnia CaCl2
MIKROELEMENTY
Żelazo Fe
Bierze udział:
- w procesie oksydacyjno - redukcyjnym
- występuje w mitochondriach i chloroplastach
- tworzy związki chylatowe o zmiennej wartości Fe
Formy żelaza dodawane do pożywek:
- kompleks żelaza z kwasem etylenodwuaminoczterooctowym (EDTA) Fe-EDTA
- sól sodowo-żelazowa kwasu EDTA NAFe-NDTA
Bor B
Bierze udział:
- w procesach wzrostu i rozwoju komórek
- w budowie ścian komórkowych i metabolizmie kwasów nukleinowych
- w przemianie węglowodanów i ich transporcie z chloroplastów
Formy boru dodawane do pożywek:
- kwas borowy H3BO4
Miedź Cu
Bierze udział:
- w fotosyntetycznym łańcuchu transportu elektronów (występują w wielu enzymach, jest wbudowana w plastocyjaninę)
- w przemianie tłuszczów i innych procesach cycowych roślin
Formy miedzi dodawane do pożywek:
- siarczan miedzi CuSO4*5H2O
Molibden Mo
Bierze udział:
- w przemianie azotu
> wiązania N cząsteczkowego, redukcja enzymów
> synteza i działanie kwasu askorbinowego
> metabolizm kwasu fosforowego
- w przemianie tłuszczów i innych procesach cycowych roślin
Formy molibdenu dodawane do pożywek:
- molibdenian sodu NaMoO * 2H2O
Mangan Mn2+
Bierze udział:
- w utrzymaniu równowagi układu oksydacyjno - redukcyjnego formy 2- i 3-wartościowe
- aktywator fotolizy wody
- działa wymiennie z magnezem
Formy manganu dodawane do pożywek:
- siarczan manganu MnSO4*4H2O
ULTRAMIKROELEMENTY
Jod J
Bierze udział:
- rola nie jest dokładnie znana
Wchodzi w skład:
- białek
Formy jodu dodawane do pożywek:
- jodek potasu KJ
Nikiel Ni
Bierze udział:
- aktywuje enzymy cyklu cytrynianowego
Wchodzi w skład:
- transfosforylazy
Formy niklu dodawane do pożywek:
- chlorek niklu NiCl * 6 H2O
Glin Al.
Bierze udział:
- aktywuje wzrost i rozwój roślin wyższych
- poprawia pęcznienie cytoplazmy
- aktywuje oksydazę askorbinową
Wchodzi w skład: herbaty (2,5g/dm3) paproci, skrzypów
Formy glinu dodawane do pożywek:
- chlorek gliny AlCl3
WITAMINY
Proste związki organiczne występujące w roślinach w niskim stężeniu.
Funkcja:
- regulująca
- biokatalityczna
Podział witamin:
- rozpuszczalne w tłuszczach A, D, E, K
- rozpuszczalne w wodzie C, B, PP H, kwas foliowy, inozytol
Tiamina (B1, aneuryna)
Bierze udział:
- w procesie oddychania i fotosyntezy
- w przemianie węglowodanów
Wchodzi w skład: koenzymu pirofosforanu tiaminy
Formy dodawane do pożywek:
- chlorowodorek aneuryny 0,1-10 mg/ dm3
Ryboflawina (B6, G)
Bierze udział:
- w przemianie glukozy i aminokwasów w komórkowym procesie utleniania
Wchodzi w skład:
- monomukleotydy flawinowego FMN
- dwunokleotydu flawinoadeninowego FAD
Formy dodawane do pożywek:
- ryboflawina 0,1-10 mg/ dm3
Kwas pantotenowy (B3, B5)
Bierze udział:
- w reakcjach metabolizmu węglowodanów, tłuszczów i białek
- w przemianie energii
Wchodzi w skład: koenzymu A
Formy dodawane do pożywek:
- pantotenian wapnia 0,1-2,5 mg/ dm3
Pirydoksyna (B6, adermina)
Bierze udział:
- w syntezie fosforanu pirydoksalu - koenzymu biorącego udział w reakcjach enzymatycznej transaminacji i dekarboksylacji aminokwasów do amin
Formy dodawane do pożywek: chlorowodorek aderminy
Biotyna H
Bierze udział:
- w asymilacji CO2
- karboksylacji acetylokoenzymu A - pierwszy etap syntezy kwasów tłuszczowych
Wchodzi w skład: koenzymu karboksybiotyny
Formy dodawane do pożywek: biotyna 0,01-10 mg/ dm3
Kwas nikotynowy (PP, niacyna = amid kwasu nikotynowego)
Bierze udział:
- w reakcjach odwodorowania jako akceptor i dawca wodoru
Wchodzi w skład:
- koenzymu NAD
- koenzymu NADP
Formy dodawane do pożywek: kwas nikotynowy 0,25-10 mg/ dm3
Kwas askorbinowy C
Bierze udział:
- w reakcjach utleniania komórkowego szczególnie tyrozyny
- w opóźnianiu starzenia się tkanek i jej brunatnieniu
- hydroksylacji proliny (aminokwasu)
Formy dodawane do pożywek: kwas askorbinowy 1-100 mg/ dm3
FITOHORMONY występują w bardzo niskich stężeniach i regulują:
- procesy syntezy enzymów na poziomie komórki
- wzrost roślin
- podziały i różnicowanie komórek
- występowanie tropizmów
- rozwój, dojrzewanie i starzenie się tkanek
AUKSYNY
IAA
Funkcja:
- indukuje szybki wzrost tkanki kalusowej zwłaszcza przy współudziale kinetyny (10-25 mg/ dm3, niektóre zboża 100 mg/ dm3
- indukuje ukorzenianie pędów 1-10 mg/ dm3
NAA
Funkcja:
- silnie stymuluje powstawanie i wzrost tkanki kalusowej, zwłaszcza przy współudziale BA i 2iP
- indukuje ukorzenianie pędów 0,01-10 mg/ dm3
IBA
Funkcja:
- syntetyczna auksyna stosowana do pobudzenia tkanki kalusowej do organogenezy
- indukuje ukorzenianie pędów 1-10 mg/ dm3
2,4D
Funkcja:
- syntetyczna auksyna o najsilniejszym działaniu
- indukuje szybkie rozmnażanie komórek kallusa i największy przyrost tkanki kalusowej
GIBERELINY tworzą się w wierzchołkach korzeniu i pędów, najmłodszych liściach, kwiatach, niedojrzałych nasionach, kiełkujących zarodkach. Znanych jest 99 związków.
Funkcja:
- wydłużanie pędów
- stymulacja wydłużenia i podziału komórek
- zwiększają aktywność kambium
CYTOKININY - pochodne adeniny syntetyzowane głównie w korzeniach i transportowane do pędów. Działają antagonistycznie do auksyn, zmniejszając dominację wierzchołkową i sprzyjają wzrostowi pędów bocznych.
Funkcja: wpływają na podziały komórkowe
2iP - stymuluje regeneracje paków przybyszowych
Kinetyna - stymuluje podziały komórkowe, aktywuje syntezę kwasów nukleinowych, stymuluję organogenezę tkanki kalusowej, pobudza tkanki dojrzałe.
BAP - stymuluje przyrost masy komórkowej
PBA - stymuluje regenerację tkanki kalusowej.
Przygotowanie pożywki:
stężone roztwory macierzyste
- 50x, 100x, 200x, 1000x
nie tworzą związków chemicznych
- wytrącających się
- inaktywujących się
Rozpuszczanie auksyn
10mg auksyny
1nNaOH lub KOH - 0,3ml
10ml H2O
Rozpuszczanie cytokinin
10mg cytokininy
1nHCl- 0,3ml
10ml H2O
Rozpuszczanie giberelin
10mg gibereliny
1nNaOH
10ml H2O w temp 70oC
Sporządzanie pożywki:
Każdy kolejny składnik dodaje się po całkowitym rozpuszczeniu poprzedniego
Wyjaławianie pożywki
* sterylizacja termiczna w autoklawie
- temp 121oC
- nadciśnienie 1 atm
- 20 min.