enzy 2012-01-18

mioglobina i chemioglobina

miglobina dużo mniejszy % 90 do 7 uwalnianego tlenu

związanie tleniu zmienia połozneie Fe2+

struktura czwartorzędowa chemoglobiny

α 1 β 1 α 2 i β 2 więc para dimerów α β

trzeciorzędowe struktury są konserwatywne

mioglobina α łańcuch i mioglobina i leghemoglobina

alfa i LHb maja 15,6 % identycznych amiokwasów (nie istotne statystycznie)

krzywa wysycenia mioglobiny asymptotyczna wysynie tlenem (w torach) -

hemoglobiny S kształtna (sigmoidalna) - leszy przenośnik

koperatwyność (związanie jednej prząstki ułatwia związania kolejnej)

w płucach 100 torów

mioglobina w tkankach 7 % tlenu

hemoglobina 66%

struktura IV rzędowa zmienia się po związaniu tleniu w odległych rejonach

muszą działać mechanizmy sprzeęgające

Dimery mają większą swobodę ruchu względem siebie w stanie utlenowanym niż nie utlenowany

stan T tense - silne odziaływania między podjednostkami

i stan R (relaxed) - wiąże tlen z dużym powinowactwem)

koperatywność Hb model jednoprzejściowy Model MWC

Wszystkie czastki występuja w stanie T albo w stanie R

Zwiększa się prawdopodobieństwo przyłączenia dodatkowych czastek tlenu do trzech wolnych miejsc

model sekwencyjny KNF (Koschland Nemethy Filmer

Związnie ligandu zmienia konformację podjednostki do kórej się związał

Ta zmiana konformacji inicjuje zmiany w dodatkowych …

Zmiana pozycji końca karboksylowego sprzyja przejściu z T do R W ten spowósb zmiany struktury w otoczeniu Fe2+ w jednej podjednostce są przekazywane pezpośrendio do innch podjednostek

Im dłuże trwa stna T tym lepiej

2,3 BPG (bisphosphoglycerate (bisfosfoglicerynian) efektor allosteryczny hemoglobiny

mają przedłużyć trwanie stenu T

takie stężenie jak hemoglobiny jak ATP

u ssaków BPG

u ptaków szejściofosforan …

u ryb ATP

cząstekczak BPG więże w centrum tetrameru Hb w kieszeni obecnej w formie T

chemoglobina wysyca się poźniej

bez BPG jak mioglobina działa

BPG może wiązać się tylko z deoksy Hb

W obecności BPG więcej wiązania tlenu w temp pokojowej musi być zajęty by zainicjować przejście formy T w R

krew płodu musi mieć wyższe powinowactwo do tlenu iż krew matki

łańcuch beta zastąpiony łańuchem γ (72% idnetyczności z beta)

w miejscu His 143 ma seryne co powoduje że zostają wyelimionowana 2 łądunki dodatnie więc BPG łączy się mniej skutecznie

Hemoglobina ewolucyjnie zyskała zdolność łatwiejszego uwalnianai telnu w odpowiedzi nazwiększeni stężenie protównów i CO2 - efekt Bora

w płuchac pH 7,4 i ciśnienie 100 torów

w mięśnich 7,2 i 20 torow

grupy aminowe od N końca odpowiadają i his 146

Kiedy pH obniża się łańcuch boczny his β 146 zostaje uprotonowany powsteje wiąznie jonowej z Asp beta 94 i następuje ustablilizowanie stnu T skutkuje to mniejszym powinowactwem chemoglobiny do tlenu

CO2 prznika biernie przez błony komórkowe a także jest transportowany przez prznośniki błonowe do wnętrza komóki protony obiżją pH (kwas węglowy) i odziąływnie CO2 z Hb

objętość co2 zmniejsza powinowactwo hb do tlenu w stopniiu wykraczajacym poza wpływ pH

hemoglobina oddaj do 90% tlenu

odziałują powyższe z białkiem w rózńych odległych od siebie miejscach to ich fekty są addytywne

wykres Hilla 1913

x białko

s ligant

x+nS → x(s)n

n jest miarą kooperatywności

równania można wyprowadzić dla każdego allosterycznegego

log (y/1 - y od log (pO2) powinien być liniowy o nachyleniu N

mioglobina n =1

chemoglobina = 2,8

w rezultacjei można oszacować stopień kopertywności wiązania

Model jednoprzejściowy można opisać w kategoriach ilościowych i zastosować równania do modelowania wiązania tlenu Ilościowe przedstawie modelu sekwencyjnego wymaga znacznie większej liczby parametrów

---