Dominik Jakubiak biotechnologia / 2 rok
Sprawozdanie z laboratorium z biochemii: 11.12.2007
Ćwiczenie 7 (ilościowe): Oznaczanie aktywności peroksydazy w obecności i nieobecności inhibitora - wyznaczanie stałych kinetycznych
Przebieg do doświadczenia:
Z utartego korzenia chrzanu wyciskano sok do zlewki, następnie rozcieńczano 1:1 wodą i pozostawiliśmy na kilka minut do opadnięcia osadu. Powstały ekstrakt wykorzystywano w części dalszej doświadczenia.
Następnie w statywie przygotowano 2 szeregi po 4 niskich probówek. Do wszystkich probówek odmierzono po 0,8 ml roztworu nadtlenku wodoru, a do kolejnych par po 0,8 ml coraz mniej rozcieńczonych roztwórów pirogalolu, zaczynając od najbardziej rozcieńczonego:
1 para: 0,001 M
2 para: 0,005 M
3 para: 0,01 M
4 para: 0,02 M
Do pierwszego rzędu probówek odmierzano po 0,2 ml wody, a do drugiego po 0,2 azytku sodu (inhibitora).
Następnie przygotowano program i natychmiast przed rozpoczęciem dolano do kuwety, zawierającej mieszaninę (zaczynamy od najmniej stężonych bez inhibitora, potem z inhibitorem od najmniej stężonych), 0,2 ml ekstraktu z chrzanu przygotowanego na początku. Następnie rejestrujemy, za pomocą komputera połączonego ze spektrofotometrem (λ = 420 nm), przebieg reakcji co najmniej przez 30 s.
Następnie, korzystając ze stałej Michaelita liczymy szybkość przebiegu reakcji.
Obliczenia:
Uzyskane na wykresach linie powinny być proste, jednak ze względu na niedokładności pomiaru nie są. Dlatego też do wyliczenia stałej Michaelisa i prędkości maksymalnej, posłużę się liniami trendu.
-1/Km = x, gdy y=0
V max = y, gdy x =0
Próbka 1 b:
-1/Km = -39,14 Km = 0,0255
V max = 0,1957
Próbka 1 i:
-1/Km = -9,68 Km = 0,1033
V max = 0,1191
Próbka 2 b:
-1/Km = -55,38 Km = 0,0181
V max = 0,5427
Próbka 2 i:
-1/Km = -5,63 Km = 0,1777
V max = 0,1677
Próbka 3 b:
-1/Km = -4,97 Km = 0,2012
V max = 0,3393
Próbka 3 i:
Za mało danych ze względu na zbyt wysoką absorbancję próbki.
Wnioski:
Z przeprowadzonych obliczeń wynika, że inhibitor znacznie obniżył szybkość maksymalną reakcji. Czym większe stężenie pirogalolu (substratu dla peroksydazy), tym szybszy przebieg reakcji, w związku z tym możemy uznać, ze w tym wypadku mamy do czynienia z inhibitorem kompetycyjnym - azydek sodu współzawodniczy z substratem o enzym, czym więcej substratu w stosunku do inhibitora, tym szybsza reakcja.