11.03.2005 - Ćwiczenia 4
TEMAT: ORGANELLE KOMÓRKOWE CD
Mitochondrium
ograniczone przez podwójną błonę
jest to miejsce produkcji ATP
jest teoria, że mitochondria to pozostałość organizmów symbiotycznych, które współżyły z komórkami i zostały przez nie wchłonięte. Za jej słusznością przemawia fakt, iż mitochondrialne DNA jest różne od DNA jądrowego, informacja jest w nim zapisana i inny sposób i są różne kodony STOP - genom mitochondrialny zawiera 22 geny kodujące tRNA, 2 geny mrRNA, 13 regionów kodujących białka.
mitochondria dzielą się przez podział w wyniku powstania bruzdy poprzecznej po replikacji mDNA - zachodzi w interfazie ale nie jest związane z fazą S
błona zewnętrzna mitochondriów posiada dużo białek:
poryny - budują pory w błonie zewnętrznej, dzięki nim dochodzi do swobodnego transportu jonów cukrów, aminokwasów, które dochodzą do przestrzeni międzybłonowej i następuje fosforylacja cukrów i nukleotydów,
błona wewnętrzna tworzy tzw. grzebienie zwiększając tym samym swoją powierzchnię transportującą i enzymatyczną - zachodzi w nic cykl oddechowy
przestrzeń mitochondriów wypełnia matrix - zachodzi w nim cykl Krebsa (kwasów trójkarboksylowych), w wyniku którego powstaje produkt β-oksydacji glukozy czyli acetylo-CoA
musi zawierać dużo białek enzymatycznych do cyklu Krebsa, muszą być one transportowane do wewnątrz mitochondrium z cytozolu
może być kształtu od kolistego do podłużnego
Import białek do mitochondriów
białka - importyny - fragment tego białka o długości od kilku do 80 aminokwasów tworzący α-helisę reagują one z receptorami - są więc to białka transportowe, powodują pofałdowania tych białek enzymatycznych do transportu co umożliwia właśnie ich transport
prawie wszystkie transportowane białka tworzone są na polirybosomach w cytozolu, te przeznaczone dla mitochondriów mają peptydy sygnałowe, w mitochondriach są uaktywniane
kolejne białka to chaperony (np. HSP), są najstarsze ewolucyjnie (bakterie do człowieka), wiążą rozwinięte białka, fałdują je z udziałem ATP, i wywołują aktywność ATP-azy
Peroksysomy
kiedyś nazywano je mikrociałkami
otoczone pojedynczą błoną, posiadają wiele układów enzymatycznych: oksydaza i katalaza (oksydaza utlenia zw. organiczne, powstaje H2O2, którą katalaza rozkłada na O2 i H2)
i ta właśnie woda utleniona bierze udział w tworzeniu wolnych rodników
biorą udział w β-oksydacji czyli rozkładzie wolnych kwasów tłuszczowych, także w syntezie cholesterolu i kwasów żółciowych, także udział w detoksykacji metabolitów i ksenobiotyków
w wyniku β-oksydacji powstaje acetylo-CoA, który wchodzi do cyklu Krebsa
zawiera około 50 różnych enzymów( oksydaza moczanowa, oksydaza D-aminokwasów)
są leki związane z aktywnością peroksysomów tzw. fibraty - obniżają stężenie tłuszczowców w surowicy krwi, działają poprzez PPAR - receptory aktywowane przez proliferację peroksysomów,
fibraty mają budowę podobną do czynnika aktywującego PPAR, ich aktywacja doprowadza do tego, że przechodzą one do jądra i wiążą się z genami będącymi promotorami dla receptorów hormonów tarczycy, steroidowych i retinoli. Te receptory wtórnie powodują narastanie stężenia peroksysomów we krwi
normalne stężenie tych struktur to 1,9%, może wzrosnąć do 25%
Biogeneza : peroksysomy uzupełniają swoją zawartość enzymatyczną z polirybosomów, te białka enzymatyczne są transportowane
dzielą się przez pączkowanie, peroksysomy zwiększają swoją objętość poprzez transport białek z polirybosomów - przyłączają się na chwilę do ER i zabierają trochę ich błony
białka rozpoznają się na zasadzie peptydu sygnałowego SKL (seryna, ?, leucyna) lub PTS (peroksysomalny sygnał docelowy)
zaburzenia peroksysomów powodują zaburzenia całego organizmu - są one dziedziczone
Zespół Zellwegera (adrenoleukodystrofia)
całkowity brak peroksysomów (enzymy nie mogą być uzupełniane)
bardzo wczesna śmierć
Zespół pseudozellwegera
występuje kilka enzymów lecz jest ich za mało, wczesna smierć
Zespół braku jednego enzymu w peroksysomach
Proteasomy
struktury nieobłonione
biorą udział w destrukcji białek
złożone z 4 pierścieni, z których każdy zbudowany jest z 6 kompleksów białkowych
białka te tworzą formę kanału wzmocnionego od zewnątrz kwasami nukleinowymi ( w postaci nieaktywnej 20 S) aby zaaktywować musza przyłączyć się czynniki CF1 i CF2 - zwiększa się wtedy stała sedymentacji do 26 S
sygnałem do działania tych struktur są białka z ubikwityną(4,5):regulatorowe, uszkodzone itp.
zachodzi tzw. ubikwitynizacja białek przeznaczonych do rozłożenia, jest w nich sygnał do destrukcji - 10 aminokwasów, tam przyłącza się białko rozpoznające a ono powoduje przyłączenie się ligazy ubikwitynowej i przyłącza się ubikwityna. Jedna jej jednostka powoduje przyłączenie następnych do 4,5 i takie białko jest rozpoznawalne przez proteasomy
Lizosomy
Biorą udział w niewybiórczej, masowej degradacji białek
są to struktury obłonione, występujące w postaci pęcherzyków
ich składnikami są hydrolazy
ich enzymy działaj w określonych warunkach - pH około 5, takie pH panuje wewnątrz lizosomów, ich błona jest odporna na działanie enzymów bo jej białka są silnie glikolizowane, te oligosacharydy są skierowane do wewnątrz lizosomów i izolują one błonę od zawartości lizosomów
normalnie w komórce pH=7,2-7,3 są więc ich enzymy nieaktywne
szlak biosyntetyczny (jak do lizosomów dostają się enzymy)
enzymy są syntetyzowane w RER, dojrzewają w Aparacie Golgiego,
po fałdowaniu są transportowane do lizosomów, podtswową rolę odgrywają tutaj receptory M-6-P - są to receptory skierowane do środka błony - wiążą się z nimi enzymy, które przez to są nieaktywne i ukierunkowane na transport do błony
lizosomy uzyskują niskie pH dzięki wbudowanej w błonę pompie protonowej
lizosomy pierwotne - enzymy są jeszcze połączone z M-6-P a pH wynosi 5
po dojrzeniu lizosomów ulega rozerwaniu wiązanie M-6-P - enzym i receptory te biorą udział w recyklingu receptorów
z lizosomów odłączają się pęcherzyki z receptorami i powracają one do białek na RER i są ponownie wykorzystywane
część enzymów z lizosomów zostaje uwolniona np.fizjologicznie (np.osteoklasty) lub w naturalny sposób poprzez defekty i enzymy te mogą być wiązane z M-6-P (tymi powracającymi) i są na nowo transportowane do Ap. Golgiego gdzie dojrzewają itd.
szlak endocytarny (dostarczenie produktów do endozytozy)
trawią własne organella - autofagosomy
produkty z fagocytozy - szlak pęcherzyków
endosomy wczesne - w pobliżu błony komórkowej i pH zbliżone do pH cytozolu w wyniku ich przesuwania się do w kierunku jąder przekształcają się w endosomy późne, w które jest wbudowywana pompa protonowa co obniża pH do około 6
w chorobach spichrzeniowych gromadzą się resztki z procesów trawienia jako wtręty i dochodzi do przeładowania komórek (żyje się do około 10 lat), lizosomy nie są w stanie rozkładać mukopolisacharydów i są one magazynowane w komórce przez co jest dużo wtrętów, związane są one przede wszystkim z błędami receptorów M-6-P (za dużo enzymów w cytoplazmie)
zespół Taya-Sachsa
choroba Niemanna-Picka
leukodystrofia metochromatyczna
4