Wykłady z biofizyki1, Biofizyka


Oddziaływania międzycząsteczkowe:

Każda emisja lub absorpcja energii promieniowania odpowiada przejściu elektronu pomiędzy orbitami stacjonarnymi.

hv=E1-E2

gdzie h-stała Plancka, v- częstotliwość, E1 i E2 energie układu w obu stanach stacjonarnych.

Cząsteczki.

Cząsteczka powstaje tylko wtedy gdy energia cząsteczki jest mniejsza od sumy energii poszczególnych atomów w stanie swobodnym. O trwałości stanowi minimum energii potencjalnej takiego układu.

Siła oddziaływań.

0x08 graphic
Prawie wszystkie własności materii określone są przez charakter tych oddziaływań.

Cząsteczki, nawet pozbawione ładunku elektrycznego, oddziałują między sobą. Dzięki tym oddziaływaniom możliwe jest istnienie cieczy i większości ciał stałych.

Wyróżniamy dwa rodzaje oddziaływań międzycząsteczkowych:

  1. Przyciąganie

  2. Odpychanie (na bardzo małych odległościach)

Oddziaływania międzycząsteczkowe:

1. Siły elektrostatyczne

2. Wiązania wodorowe

3. Siły van der Waalsa

4. Oddziaływania hydrofobowe

Siły elektrostatyczne.

0x01 graphic

0x01 graphic

0x01 graphic
- przenikalność elektryczna ośrodka;

0x01 graphic
- względna przenikalność elektryczna ośrodka;

0x01 graphic
- przenikalność elektryczna próżni.

Elektroujemność.

Zdolność uzupełniania do trwałej powłoki przez przyłączenie elektronu.

Pierwiastek; Elektroujemność


Cząsteczka wody.

Wiązanie wodorowe.

Posiada ono bardzo duże znaczenie w układach biologicznych i jest odpowiedzialne za utrzymanie struktury białek, DNA unikalne własności wody.

Warunek powstania wiązania wodorowego

Drugorzędowe struktury białek.

0x08 graphic

Wiązanie wodorowe jest głównym czynnikiem odpowiedzialnym za stabilność konformacji białka i aminokwasów.

Siły Van der Waalsa.

Oddziaływania pomiędzy cząsteczkami obojętnymi elektrycznie i energii E równej:

E=0x01 graphic

Siły dyspersyjne pomiędzy dwoma różnymi cząsteczkami mogą być zarówno siłami przyciągania jak i odpychania. Zależy to od rodzaju środowiska, w którym odbywa się oddziaływanie.

Oddziaływania hydrofobowe („nie lubi wody”)

Cząsteczki amfifilowe.

Cząsteczki lipidów posiadają charakter amfifilowy, to znaczy że jedna część cząsteczki posiada własności hydrofobowe ("nie lubi wody") natomiast druga własności hydrofilowe ("lubi wodę").

0x01 graphic

Zachowanie lipidów w kontakcie z wodą.

0x01 graphic

Błony biologiczne.

Zaliczamy do nich zarówno błony komórkowe jak i błony organelli wewnętrznych. Bez względu na lokalizacje błony zbudowane są w identyczny nieomal sposób.

Funkcje błony biologicznej.

Model płynnej mozaiki

0x01 graphic

0x08 graphic

Składniki błon biologicznych:

- lipidy

- białka

- cukry

Lipidy.

Lipidami nazywamy grupę cząsteczek charakteryzujących się bardzo złą rozpuszczalnością w wodzie i dobrą rozpuszczalnością w rozpuszczalnikach niepolarnych (np. chloroformie).

Amfifilowy charakter lipidów.

Cząsteczki lipidów posiadają charakter amfifilowy. W środowisku wodnym spontanicznie grupują się one tak by z wodą kontaktowały się wyłącznie części hydrofilowe.

Frakcja lipidowa.

W błonach komórek przeważającą część frakcji lipidowej stanowią fosfolipidy.

Asymetria błony.

  1. Lipidy:

  • Białka: